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2本鎖DNA中のCpG配列が繰り返し存在する領域（CpGアイランド）は転写の起点となるプロモーターに多く観測され、シトシン5’メチル化によって転写が抑制され、発生や分化誘導などのエピジェネテックな遺伝子制御の重要な役割を果たしている。また、過剰なメチル化は癌化と関連しており、配列特異的にCpGアイランドを標的化できる分子は、新しい創薬リードとしての展開が期待される。しかし、これまでに、CpGアイランドに特異的に結合する分子は開発されておらず、新規分子の開発が望まれている。本研究では、CpGアイランドではグアニン塩基が交互に配置されている点に着目し、糖部分がD-体、L-体のヌクレオチドを交互に連結した分子を設計し、グアニンと連続的にフーグスティーン塩基対形成により結合する特異的分子の開発を目指した。これまでに、グアノシンを基本骨格として、その2位のアミノ基に、ベンゼン環導入体、ピリジン導入体、ピリミジン導入体、メチルピリミドン導入体を合成に成功した。さらに、それらの化合物を用いて、3本鎖DNA形成能の評価をゲルシフトアッセイにより行った結果、その詳細を調べることで、ベンゼンを有する人工核酸で骨格であるdGよりも安定で選択的に3本鎖DNAを形成する事を見いだした。この機能は、人工核酸を3本目の鎖のどの位置に組み込んでも同じ性質があるという、興味深い結果が得られた。また、連続して複数個導入することで、3本鎖DNAを形成しなくなること、自己鎖で高度な高次構造を形成する事を明らかにした。
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