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2014 年度 実施状況報告書

ゲノムワイド関連解析による心肥大感受性遺伝子の探索

研究課題

研究課題/領域番号 26670409
研究機関慶應義塾大学

研究代表者

佐野 元昭  慶應義塾大学, 医学部, 准教授 (30265798)

研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2016-03-31
キーワード左室肥大 / ゲノムワイド関連解析 / メタ解析 / 心電図
研究実績の概要

Japan PGx Data Science Consortium (JPDSC) に記録されている約3,000人の日本人健常者の臨床データ、心電図データ、約250万個のSNP遺伝型データ (DNA genotyping はIllumina Human Omn 2.5.8 BeadChipを用いて行った) をもとに年齢、性別、収縮期血圧、BMIが説明変数として補正をかけた後のRV5, SV1, RV5+SV1値(すなわち環境要因を補正した値=遺伝要因が濃縮された値)に対してゲノムワイド関連解析 (Genome Wide AssociationStudy: GWAS) を行った。RV5 を対象とした解析の結果、p値 1 X 10-5を超えたSNPがクラスターで検出された複数の遺伝子座が見つかった。RV5で同定された候補遺伝子座のSNPsが過去に報告されている左室肥大関連SNPsに関してはreplicationがとれるか否か、田原康玄先生との共同研究によって確認し、replicationがとれた遺伝子に関しては、メタ解析を行った。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

平成26年度の研究は、研究実施計画どおりに進行しているため。

今後の研究の推進方策

GWASの結果、同定された左室肥大関連候補遺伝子の中には、心筋症の原因遺伝子として遺伝子改変マウスを駆使した仮説検証型のアプローチで心肥大形成に関与していることが報告されている既知のもの、心肥大との関連においては機能未知の新規遺伝子が含まれている。心肥大との関連においては未知の新規遺伝子に関しては、心臓における発現量、遺伝子の機能、創薬の対象になりやすいか否か、などを考慮して、優先順位の高いものから遺伝子改変マウスを作製して、遺伝子機能連関を明らかにしていく。

次年度使用額が生じた理由

消耗品代が想定より少ない状態で研究を進めることができたため。

次年度使用額の使用計画

論文投稿の準備として、英文校正代や投稿料、掲載料等に使用する予定である。

  • 研究成果

    (8件)

すべて 2015 2014 その他

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件、 オープンアクセス 2件、 謝辞記載あり 2件) 学会発表 (3件) 図書 (1件) 備考 (1件) 産業財産権 (1件) (うち外国 1件)

  • [雑誌論文] Evaluation of differences in automated QT/QTc measurements between Fukuda Denshi and Nihon Koden systems2014

    • 著者名/発表者名
      Sano M, Aizawa Y, Katsumata Y, Nishiyama N, Takatsuki S, Kamitsuji S, Kamatani N, Fukuda K
    • 雑誌名

      PLoS One

      巻: 9(9) ページ: e106947

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0106947. eCollection 2014.

    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Genome-wide association study of electrocardiographic parameters identifies a new association for PR interval and confirms previously reported associations2014

    • 著者名/発表者名
      Sano M, Kamitsuji S, Kamatani N, Hong KW, Han BG, Kim Y, Kim JW, Aizawa Y, Fukuda K
    • 雑誌名

      Hum Mol Genet

      巻: 23(24) ページ: 6668-76

    • DOI

      10.1093/hmg/ddu375

    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [学会発表] 全ゲノム関連解析を用いた心肥大感受性遺伝子の同定2014

    • 著者名/発表者名
      佐野元昭
    • 学会等名
      突発性心筋症に関する調査研究
    • 発表場所
      東京大学
    • 年月日
      2014-10-30
  • [学会発表] 心不全の分子病態解明Multifaceted Approach to Analyzing the Pathogenesis of Heart Failure2014

    • 著者名/発表者名
      佐野元昭
    • 学会等名
      第18回日本心不全学会学術集会学術賞受賞講演
    • 発表場所
      大坂国際会議場
    • 年月日
      2014-10-11
  • [学会発表] 日本人心電図形質に対する全ゲノム関連解析2014

    • 著者名/発表者名
      佐野元昭
    • 学会等名
      第62回日本心臓病学会学術集会
    • 発表場所
      東北大学百周年記念会館川内萩ホール
    • 年月日
      2014-09-26
  • [図書] 心不全診療のQ&Aエキスパート106人からの回答2015

    • 著者名/発表者名
      佐野元昭
    • 総ページ数
      未定
    • 出版者
      中外医学社
  • [備考] 慶應義塾大学医学部循環器内科 基礎研究

    • URL

      http://www.cpnet.med.keio.ac.jp/research/basic/pathogenesis/

  • [産業財産権] 肺動脈高血圧症の治療薬の開発2014

    • 発明者名
      佐野元昭、福田恵一
    • 権利者名
      佐野元昭、福田恵一
    • 産業財産権種類
      特許
    • 産業財産権番号
      PCT/JP2014/079098
    • 出願年月日
      2014-10-31
    • 外国

URL: 

公開日: 2016-05-27  

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