| 研究課題/領域番号 |
26670610
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| 研究機関 | 日本医科大学 |
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研究代表者 |
瀧澤 俊広 日本医科大学, 医学(系)研究科(研究院), 教授 (90271220)
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| 研究分担者 |
吉田 寛 日本医科大学, 医学部, 准教授 (60246999)
谷合 信彦 日本医科大学, 医学部, 准教授 (20287725)
水口 義昭 日本医科大学, 医学部, 助教 (70409217)
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| 研究期間 (年度) |
2014-04-01 – 2016-03-31
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| キーワード | 癌 / 胆道外科学 / 胆管癌 / ノンコーディングRNA |
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| 研究実績の概要 |
胆管癌増殖･浸潤に関与する胆管癌特異的 long non-coding RNA（lncRNA）の同定：先端次世代シーケンサーによる胆管癌の発現プロファイル解析を開始した。1）胆管癌組織、胆嚢癌組織、肝細胞癌組織（所属機関倫理審査委員会により承認済）のサンプル採取およびサンプル調製を行った。2）イルミナ社次世代シーケンサー・MiSeqを用いて、培養細胞（絨毛外栄養膜細胞、胆管癌細胞株など）のlncRNA発現解析を開始した。抽出したRNAをイルミナ社TruSeq RNAサンプル調整キットで標識し、シーケンスを行った。引き続きMiSeqから得られた1サンプル当たり約900万リードの塩基配列データをCLC bio社CLC Genomics Workbenchを用いてバイオインフォマティックス解析した。mRNAとともに十分にlncRNAの配列同定が可能であった。3）Loss-of-function解析による胆管癌増殖および浸潤･転移に関与するlncRNAの同定：胆管癌細胞株を用いたlncRNA機能解析のために、レンチウイルスを用いたsiRNA発現ベクターの作製を進めた。
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
3: やや遅れている
理由
血液・胆汁中の癌特異的lncRNAを用いたバイオマーカー開発において、患者さんからの血液・胆汁サンプルの採取が遅れているため。
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| 今後の研究の推進方策 |
遅れはあるが着実に進展しているので、計画に沿って研究を進める予定である。
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