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2015 年度 研究成果報告書

Development of an intelligent dynamic docking pipeline for improving molecular docking simulations

研究課題

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研究課題/領域番号 26730152
研究種目

若手研究(B)

配分区分基金
研究分野 生命・健康・医療情報学
研究機関沖縄科学技術大学院大学

研究代表者

Hsin KunYi  沖縄科学技術大学院大学, その他の研究科, 研究員 (60604155)

研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2016-03-31
キーワードDocking Simulation / Molecular Dynamics / Network Pharmacology / Machine Learning / Molecular Interaction / Drug Discovery
研究成果の概要

我々は、薬理学に基づく予測パイプラインネットワークを開発した。分子経路に関与するタンパク質に対する試験化合物の結合可能性を正確・効率的に予測できる。予測スコアと実験的結合親和性は、R>0.8と良好なパフォーマンスを示した。更に既知のバイオアッセイ結果と比較することにより、様々なキナーゼ阻害剤の選択性を予測した。この結果も高い一貫性を示している。インパクトの高い学術誌に発表し、システム生物学研究所や東京大学医科学研究所とのプロジェクトでも、創薬分子を同定するためこのツールを使用した。さらに、創薬関係者をはじめとした社会全体へ貢献できるよう、オープンアクセスでsystemsDockを公開した。

自由記述の分野

Bioinformatics

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公開日: 2017-05-10  

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