次世代シークエンサーを駆使したプロモーター配列の網羅的解析

2015 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 26830137
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 基金
• 研究分野: システムゲノム科学
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 入江 拓磨 東京大学, 新領域創成科学研究科, 特任助教 (50625944)
• 研究期間 (年度): 2014-04-01 – 2016-03-31
• キーワード: 次世代シークエンサー / 超並列レポーターアッセイ / プロモーター / 転写因子結合配列

研究成果の概要

一塩基単位の解像度でプロモーター領域の転写活性情報を抽出する手法の開発を行った．平均で1-2%ランダム突然変異を導入したヒトプロモーターに対し，次世代シークエンサーを用いた大規模なレポーターアッセイ系の構築を行い，プロモーター配列の解析と活性測定を行った．これらの情報を用い，プロモーター配列と活性に関する線形モデルを構築によって，事前の知識が無くても転写制御の情報を抽出を可能にした．また，これらの成果はプロモーター配列のデザインについての基礎情報として有用であると考えている．

自由記述の分野

ゲノムシステム医療科学分野