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2016 年度 実績報告書

ビタミンB12を感光色素とする新規光センサーの構造機能研究

研究課題

研究課題/領域番号 26840027
研究機関分子科学研究所

研究代表者

村木 則文  分子科学研究所, 生命・錯体分子科学研究領域, 助教 (20723828)

研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2017-03-31
キーワード光受容体 / 結晶構造解析 / ビタミンB12 / 転写因子
研究実績の概要

ビタミンB12(アデノシルコバラミン)が高い光感受性をもち、光分解することは50年以上前から知られていた。しかし、ビタミンB12を感光色素とするセンサータンパク質の存在は近年まで明らかでなかった。2011年に含コバラミン転写因子CarH/LitRが光センサーとして機能することが報告されると、2014年にはヒドロキシコバラミン結合タンパク質AerRが転写因子CrtJと相互作用することで転写制御に関わることが報告された。いずれも構造生物化学的知見に乏しく、コバラミンの光依存的な構造の変化が転写調節をもたらす一連の情報伝達メカニズムは全く不明である。本研究では、エックス線結晶解析法によってCarHとAerRの立体構造を決定し、光応答に伴う動的な構造変化を捉えることを目指している。
T. thermophilus 由来CarHについて、光反応前の構造解析に成功した。光応答に重要なC末端ドメインのみの構造を2.5オングストローム分解能で、全長構造を3.0オングストローム分解能で決定できている。いずれも四量体を形成しており、生理的条件を反映していると考えられている。既知のコバラミン結合タンパク質との比較から、コバラミン中心金属の軸配位子の光乖離がDNA結合親和性を変化させるという作業仮説を立てた。仮説の検証に向けて、実験を進めている。
AerRにおいて、AerRの大量発現系を確立することはできたが、結晶化には至らなかった。AerRはコバラミンを結合させることで安定化することがわかったが、等量のコバラミンを結合させることができなかった。コバラミン結合状態のAerRのみの単離も試みたが、十分な結果は得られなかった。

  • 研究成果

    (7件)

すべて 2016

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (6件) (うち国際学会 2件、 招待講演 1件)

  • [雑誌論文] Structural Characterization of Heme Environmental Mutants of CgHmuT that Shuttles Heme Molecules to Heme Transporters2016

    • 著者名/発表者名
      Norifumi Muraki, Chihiro Kitatsuji, Mariko Ogura, Takeshi Uchida, Koichiro Ishimori and Shigetoshi Aono
    • 雑誌名

      International Journals of Molecular Sciences

      巻: 17 ページ: 829

    • DOI

      10.3390/ijms17060829

    • 査読あり
  • [学会発表] Crystal structure of a photosensor CarH using adenosylcobalamin as a photosensing unit2016

    • 著者名/発表者名
      村木則文、青野重利
    • 学会等名
      8th Asian Biological Inorganic Chemistry Conference
    • 発表場所
      オークランド大学 (オークランド, ニュージーランド)
    • 年月日
      2016-12-04 – 2016-12-09
    • 国際学会
  • [学会発表] 新規な光受容体型転写因子CarHの結晶構造解析2016

    • 著者名/発表者名
      村木則文、青野重利
    • 学会等名
      平成28年度日本結晶学会年会
    • 発表場所
      茨城県立県民文化センター(茨城県水戸市)
    • 年月日
      2016-11-21 – 2016-11-22
  • [学会発表] Structural analysis of heme acquisition proteins in Corynebacterium2016

    • 著者名/発表者名
      村木則文、青野重利
    • 学会等名
      The 9th Japan-Korea Seminars on Biomolecular Science: Experiments and Simulations
    • 発表場所
      慶州コモドホテル(慶州, 韓国)
    • 年月日
      2016-11-14 – 2016-11-16
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] ビタミンB12を光センサーとして用いる転写調節因子の構造基盤2016

    • 著者名/発表者名
      村木則文、青野重利
    • 学会等名
      第10回バイオ関連化学シンポジウム
    • 発表場所
      石川県立もてなしドーム(石川県金沢市)
    • 年月日
      2016-09-07 – 2016-09-09
  • [学会発表] 光センサーとして機能するコバラミン含有型転写因子CarHの構造と機能2016

    • 著者名/発表者名
      村木則文、青野重利
    • 学会等名
      第26回金属の関与する生体関連反応シンポジウム(SRM2016)
    • 発表場所
      北海道大学(北海道札幌市)
    • 年月日
      2016-06-17 – 2016-06-18
  • [学会発表] ビタミンB12を利用した光受容体型転写因子CarHの構造解析2016

    • 著者名/発表者名
      村木則文、青野重利
    • 学会等名
      第16回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      福岡国際会議場(福岡県福岡市)
    • 年月日
      2016-06-07 – 2016-06-09

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公開日: 2018-01-16  

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