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2015 年度 実績報告書

環境による性決定遺伝子の発現調節メカニズムの解明―甲殻類ミジンコをモデルとして―

研究課題

研究課題/領域番号 26840105
研究機関大阪大学

研究代表者

加藤 泰彦  大阪大学, 工学(系)研究科(研究院), 助教 (60415932)

研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2016-03-31
キーワード性決定 / 幼若ホルモン受容体 MET / ゲノム編集技術 / RNA-Seq / オオミジンコ / dsx 遺伝子 / 幼若ホルモン
研究実績の概要

本研究では、幼若ホルモンによる Dsx 遺伝子の制御機構を解析し、動物種を越えて保存された性決定遺伝子 Dsx の発現が、どのように環境変化に応答するのかを解明することを目的とし、2つの仮説を立て研究を進めた。
1つ目の仮説は、幼若ホルモン受容体である転写因子 MET が直接 Dsx 遺伝子を制御しているというものである。この仮説を ChIP 解析により検証するために、タグ配列を付加した MET を発現するトランスジェニック個体を作出を試みた。前年度に引き続きミジンコのゲノム編集技術の開発を進め、相同組み換えによる遺伝子導入法を確立した。一方で、2A ペプチド配列を利用しタグ融合型MET 遺伝子と蛍光タンパク質遺伝子をバイシストロニックに発現させる系を開発した。また、眼の色素遺伝子が形質転換のマーカーとなることも見出した。今後これらの技術をトランスジェニック個体の作製に応用できる。
2つ目の仮説は、幼若ホルモンにより活性化した遺伝子が間接的に Dsx 遺伝子の発現を制御しているというものである。昨年度行った性決定時期の RNA-Seq の解析を行い、リファレンスゲノムへの TopHat によるマッピング、Cufflinks 及び Cuffmerge によるトランスクリプトのアセンブル、Cuffquant 及び Cuffdiff による遺伝子発現解析、CummeRund によるデータの可視化を行った。その結果、2倍以上有意に発現が上昇、減少した遺伝子を複数見出した。一方で、遺伝的に性決定を行う生物で性決定、分化に働くことが知られている FTZ-F1 遺伝子のオーソログをミジンコから単離、解析し、性特異的な遺伝子発現を示すことを明らかにした。ノックダウンによる表現型は胚性致死であったが、FTZ-F1 がミジンコの環境性決定を制御していることが示唆された。

  • 研究成果

    (9件)

すべて 2016 2015

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (8件) (うち国際学会 2件、 招待講演 1件)

  • [雑誌論文] TALEN-mediated homologous recombination in Daphnia magna2015

    • 著者名/発表者名
      Nakanishi T, Kato Y, Matsuura T, Watanabe H.
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 5 ページ: 18312

    • DOI

      10.1038/srep18312

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] Use of the bicistronic expression involving viral T2A peptide in Daphnia magna2016

    • 著者名/発表者名
      Hitoshi Kumagai, Yasuhiko Kato, Tomoaki Matsuura, Hajime Watanabe
    • 学会等名
      第62回日本生態学会大会
    • 発表場所
      仙台
    • 年月日
      2016-03-20 – 2016-03-24
  • [学会発表] Analysis of Transcription Activation of the Environmental Sex Determining Gene Doublesex1 in Daphnia magna2015

    • 著者名/発表者名
      Syafiqah Ishak, Yasuhiko Kato, Tomoaki Matsuura, Hajime Watanabe
    • 学会等名
      第38回日本分子生物学会年会、第88回日本生化学会大会 合同大会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2015-12-01 – 2015-12-04
  • [学会発表] Eye Color Gene Scarlet as a Visible Marker for Daphnia magna Transgenesis2015

    • 著者名/発表者名
      Nur Izzatur Binti Ismail, Yasuhiko Kato, Tomoaki Matsuura, Hajime Watanabe
    • 学会等名
      第38回日本分子生物学会年会、第88回日本生化学会大会 合同大会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2015-12-01 – 2015-12-04
  • [学会発表] Use of the bicistronic expression involving viral T2A peptide in Daphnia magna2015

    • 著者名/発表者名
      Hitoshi Kumagai, Yasuhiko Kato, Tomoaki Matsuura, Hajime Watanabe
    • 学会等名
      第38回日本分子生物学会年会、第88回日本生化学会大会 合同大会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2015-12-01 – 2015-12-04
  • [学会発表] Efficient DNA integration into germ line genome via TALEN in Daphnia magna2015

    • 著者名/発表者名
      Takashi Nakanishi, Yasuhiko Kato, Tomoaki Matsuura, Hajime Watanabe
    • 学会等名
      Conference on Transposition and Genome Engineering 2015
    • 発表場所
      奈良
    • 年月日
      2015-11-17 – 2015-11-20
    • 国際学会
  • [学会発表] ミジンコのゲノム操作による環境性決定メカニズムの解明2015

    • 著者名/発表者名
      加藤泰彦、中西貴士、渡邉肇
    • 学会等名
      「細胞を創る」研究会8.0
    • 発表場所
      大阪
    • 年月日
      2015-11-13 – 2015-11-13
    • 招待講演
  • [学会発表] 環境指標生物オオミジンコにおけるTALENを用いた外来遺伝子導入技術の開発2015

    • 著者名/発表者名
      中西貴士、加藤泰彦、松浦友亮、渡邉肇
    • 学会等名
      日本生物工学会 若手会2015
    • 発表場所
      鹿児島
    • 年月日
      2015-10-27 – 2015-10-27
  • [学会発表] Efficient DNA integration into germ line genome via programmable nucleases in Daphnia magna2015

    • 著者名/発表者名
      Takashi Nakanishi, Yasuhiko Kato, Tomoaki Matsuura, Hajime Watanabe
    • 学会等名
      Cold Spring Harbor Laboratory Meetings & Courses Program "GENOME ENGINEERING: THE CRISPR/CAS REVOLUTION"
    • 発表場所
      New York, USA
    • 年月日
      2015-09-24 – 2015-09-27
    • 国際学会

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公開日: 2017-01-06  

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