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2014 年度 実施状況報告書

クロマチンリモデリング因子ARID1A発現消失の胃癌における意義の解明

研究課題

研究課題/領域番号 26860232
研究機関東京大学

研究代表者

阿部 浩幸  東京大学, 医学部附属病院, 助教 (40708632)

研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2016-03-31
キーワード胃癌 / Epstein-Barr virus / ARID1A / クロマチンリモデリンング / 免疫組織化学 / マイクロアレイ
研究実績の概要

ARID1Aの発現低下による変化を網羅的に解析するため,胃癌細胞株MKN74とNUGC3に対しsiRNAによるARID1A knockdownとマイクロアレイによる網羅的遺伝子発現解析を行い,約50の共通して発現が変動する遺伝子を同定した.更にThe Cancer Genome Atlasによる胃癌の網羅的遺伝子発現解析(Nature 2014)の公開データベースから,EB胃癌の中でARID1A変異の有無により発現の異なる遺伝子を抽出した.その結果,マイクロアレイと共通して発現が上昇する遺伝子Xを同定した.ARID1A knockdownによるXの発現上昇はRT-PCR及びWestern blottingでも確認された.Xは幅広い細胞に発現するタンパクであり,クロマチンリモデリンングや細胞老化,増殖に関与し,EBVのタンパクとの核内での共局在も報告されている.今後はXの発現変動とウイルス感染効率やウイルスタンパクとの関係を解析する予定である.
また,手術材料を用いた検討では,肝細胞癌及びマイクロサテライト不安定性胃癌において,一部のクローンのみARID1Aの発現消失が見られるclonal loss patternの存在を確認した.特に肝細胞癌については腫瘍径や組織学的分化度,p53, beta-cateninの発現と相関しており,腫瘍の進展に深く関わる可能性が示唆された[Abe H et al. Int J Clin Exp Pathol (in press)].

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

ARID1A knockdownとマイクロアレイによる網羅的発現解析,ARID1A発現消失により発現が変動する候補遺伝子の抽出は順調に進んでいる.また手術材料を用いた検討も,胃癌だけでなく肝細胞癌も含めた解析を行い,特に肝細胞癌については論文発表を行うことができた(Int J Clin Exp Pathol in press).EBVとの関係性の解明は今後の課題となるが,概ね計画は順調に進んでいると判断される.

今後の研究の推進方策

上記で見つかったARID1A発現低下により発現が更新する遺伝子Xについて,EBVとの関連を解析する.具体的には,XをknockdownすることによりEBVの胃癌細胞に対する感染効率の変化を解析する.また既にEBVに感染した細胞について,Xの発現抑制が癌細胞の動態(増殖や遊走能)に変化を与えるか否かについて検討する.EBVの産生する蛋白とXとの間に相互作用があるかどうか,蛍光免疫染色や免疫沈降を用いて解析する.さらにXとARID1Aの発現の相関について,胃癌手術材料から作製したtissue microarrayを用いて検証を行う予定である.

次年度使用額が生じた理由

必要な器具・試薬類が当初予定より安く入手できたこと,及び学会発表出張が当初予定より少なかったことから,次年度使用額が生じた.

次年度使用額の使用計画

次年度は海外学会での発表を含む学会発表のための出張を複数予定しているため,旅費が2014年度を上回る予定である.また2014年度に得られたデータを踏まえて解析を進めるため,試薬類もより多くを必要とする予定である.

  • 研究成果

    (2件)

すべて 2015 2014

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (1件)

  • [雑誌論文] Altered expression of AT-rich interactive domain 1A in hepatocellular carcinoma2015

    • 著者名/発表者名
      Abe H, Hayashi A, Kunita A, Sakamoto Y, Hasegawa K, Shibahara J, Kokudo N, Fukayama M
    • 雑誌名

      International Journal of Clinical and Experimental Pathology

      巻: 未定 ページ: 未定

    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [学会発表] EBV関連胃癌におけるARID1A発現消失はヒストンアセチル化の消失と相関する2014

    • 著者名/発表者名
      阿部浩幸、林玲匡、国田朱子、深山正久
    • 学会等名
      第103回日本病理学会総会
    • 発表場所
      広島
    • 年月日
      2014-04-24 – 2014-04-26

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公開日: 2016-06-01  

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