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GISTにおいてエピジェネティックに不活化されるnoncodigRNAの探索目的に遺伝子サイレンシングの解除のためGIST-T1細胞株に５aza-dCおよび4 -PBAによる薬剤処理を行った後にnoncodingRNAの発現変化、ChIP シークエンス解析を行った。
エピジェネティックな機序で転写抑制を受けると考えられるnoncoding RNAを抽出し、臨床検体のメチル化状態を解析し高頻度にメチル化されるmiR-34a,miR-335を見出した。また、tumor suppressiveに働くと考えられているlncRNAのCpG island高メチル化が予後不良と相関することが確認された。
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