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2014 年度 実施状況報告書

Additional genetic defects outside commonly deleted region in 22q11.2 deletion with psychosis; a prospect for identifying novel schizophrenia candidate genes

研究課題

研究課題/領域番号 26860954
研究機関独立行政法人理化学研究所

研究代表者

SHABEESH BALAN  独立行政法人理化学研究所, 脳科学総合研究センター, 研究員 (70721588)

研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2016-03-31
キーワード脳神経疾患 / ゲノム / 遺伝子 / 染色体異常
研究実績の概要

Among structural variants, 22q11.2 deletion is one of the highest risk factors for developing schizophrenia. Caused by hemizygous microdeletions at chromosome 22q11.21, about a fourth of the carriers develop schizophrenia. This chromosomal region is considered to be one of the main schizophrenia susceptibility loci, harbouring several candidate genes for disease pathogenesis. The incomplete penetrance of schizophrenia in 22q11.2 deletion suggests polygenic mechanisms that require additional genomic variants outside of the deleted region. This study aimed to decipher the role of genetic defects outside of the 22q11.2 region in increasing the risk for schizophrenia. We performed whole exome sequencing on two individuals with 22q11.2 deletion; one carrier (Person A) with schizophrenia and the other (Person B) who was psychosis-free.
The FISH analysis and aCGH confirmed the 22q11.2 microdeletions, showing a 2.6Mb hemizygous genomic deletion in both participants. The exome sequencing yielded a large number of variants in both participants including the previously reported frameshift mutation in GLO1 in Person A. Based on the specified criteria for variant prioritisation, we identified five heterozygous variants (three frameshift and two nonsense variants) in Person A, which were validated by Sanger sequencing. Interestingly, none of the genes harboring these variants was previously reported to be associated with any neurological or psychiatric phenotypes, and therefore the roles of these genes in manifesting or modulating psychiatric phenotypes warrant future examination.

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

染色体22q11.2欠失を持っていて統合失調症を発症したサンプルと、同じ染色体欠失を持ちながら統合失調症を発症していないサンプルを収集することができ、それらサンプルを用いた全エクソーム解析を行い、統合失調症発症に関与する可能性のある3種類のフレームシフト変異と2つのナンセンス変異を同定出来たため。これら5つの遺伝子は、今後の統合失調症や精神疾患のゲノム理解について、重要な情報を提供するものと考えられる。

今後の研究の推進方策

上述の5遺伝子のうち、いろいろな過去の文献報告からKAT8遺伝子が精神疾患との関連で最も興味深いと考えられた。
よって今後は、KAT8遺伝子に焦点をあて、精神疾患の大規模サンプルセットによる解析、死後脳における発現解析を進めていく

  • 研究成果

    (3件)

すべて 2015 2014

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件、 オープンアクセス 3件、 謝辞記載あり 3件)

  • [雑誌論文] Sequencing and expression analyses of the synaptic lipid raft adapter gene PAG1 in schizophrenia.2015

    • 著者名/発表者名
      Balan S, Iwayama Y, Yamada K, Toyota T, Ohnishi T, Toyoshima M, Shimamoto C, Ide M, Iwata Y, Suzuki K, Kikuchi M, Hashimoto T, Kanahara N, Yoshikawa T, Maekawa M
    • 雑誌名

      Journal of Neural Transmission

      巻: 122(3) ページ: 477-485

    • DOI

      10.1007/s00702-014-1269-0

    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Genetic analysis of the glyoxalase system in schizophrenia.2015

    • 著者名/発表者名
      Bangel FB, Yamada K, Arai M, Iwayama Y, Balan S, Toyota T, Iwata Y, Suzuki K, Kikuchi M, Hashimoto T, Kanahara N, Mori N, Itokawa M, Stork O, Yoshikawa T
    • 雑誌名

      Progress in Neuro-Psychopharmacology & Biological Psychiatry

      巻: 59 ページ: 105-110

    • DOI

      10.1016/j.pnpbp.2015.01.014

    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Exome comparison of two 22q11.2 deletion carriers reveals potential schizophrenia-associated novel variants.2014

    • 著者名/発表者名
      Balan S, Iwayama Y, Toyota T, Manabu M, Maekawa M Yoshikawa T
    • 雑誌名

      British Journal of Psychiatry

      巻: 204 ページ: 398-399

    • DOI

      10.1192/bjp.bp.113.138420

    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり

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公開日: 2016-06-01  

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