卵巣がん関連遺伝子の網羅的メタボローム解析

2015 年度 実績報告書

• 研究課題/領域番号: 26861324
• 研究機関: 京都大学
• 研究代表者: 山口 建 京都大学, 医学(系)研究科(研究院), 助教 (20378772)
• 研究期間 (年度): 2014-04-01 – 2016-03-31
• キーワード: 明細胞癌 / SWI/SNF複合体

研究実績の概要

代謝に関わる遺伝子を検索するために、代謝異常を示す卵巣明細胞癌において、どのような遺伝子変異やコピー数異常があるかを検討するために明細胞癌39検体を用いてエクソームシークエンス解析を行った。遺伝子変異解析では426遺伝子に変異を認め、62%にARID1A遺伝子、51%にPIK3CA遺伝子、10%にKRAS遺伝子、ARID1B遺伝子変異をそれぞれ認めた。コピー数異常解析では、染色体8qの増幅を64%、20qの増幅を54%、17qの増幅を46%、19pの増幅を41%に認めた。染色体8qにはMYC遺伝子、17qにはERBB2、HNF1B、STAT3遺伝子がある。また、欠失はSMARCA4遺伝子がある19pは41%に、RB1遺伝子がある13qは28%に認めた。遺伝子変異とコピー数異常を統合すると、85%にSWI/SNF複合体に属する因子に、82%にKRAS/PI3Kシグナルに、75%にMYC/RBシグナルに異常を認めた。
次にSWI/SNF複合体に着目して解析した。免疫組織染色では卵巣明細胞癌の46.3%にARID1A遺伝子がコードするBAF250a発現の消失を認めた。SWI/SNF複合体全体で見ると、7.8%は1因子のみ、23.2%は複数因子に発現消失を認めたSWI/SNF複合体発現の消失因子多いと有意に進行期が多く、複合体の発現消失は累積的に無病生存期間、全生存期間ともに予後不良であった。多変量解析では病期と、SWI/SNF複合体の発現消失が独立予後予測因子となった。コピー数異常解析では、SWI/SNF複合体の発現消失がない症例は、発現消失のある症例と比較してコピー数異常がより強かった。以上の結果は、卵巣明細胞癌には、SWI/SNF複合体の発現が消失した予後不良の群と、SWI/SNF複合体の発現がありコピー数異常が多い予後良好群との2つの亜型が存在することを示唆している。

研究成果

• [雑誌論文] Prediction of taxane and platinum sensitivity in ovarian cancer based on gene expression profiles. (2016)
  • 著者名/発表者名: Murakami R, Matsumura N, Brown JB, Wang Z, Yamaguchi K, Abiko K, Yoshioka Y, Hamanishi J, Baba T, Koshiyama M, Mandai M, Yamada R, Konishi I.
  • 雑誌名: Gynecol Oncol. 巻: 141 ページ: 49-56
  • DOI: 10.1016/j.ygyno.2016.02.027.
  • 査読あり
• [雑誌論文] Establishment of a Novel Histopathological Classification of High-Grade Serous Ovarian Carcinoma Correlated with Prognostically Distinct Gene Expression Subtypes. (2016)
  • 著者名/発表者名: Murakami R, Matsumura N, Mandai M, Yoshihara K, Tanabe H, Nakai H, Yamanoi K, Abiko K, Yoshioka Y, Hamanishi J, Yamaguchi K, Baba T, Koshiyama M, Enomoto T, Okamoto A, Murphy SK, Mori S, Mikami Y, Minamiguchi S, Konishi I.
  • 雑誌名: Am J Pathol. 巻: 186 ページ: 1103-13
  • DOI: 10.1016/j.ajpath.2015.12.029. Epub 2016 Mar 15.
  • 査読あり
• [雑誌論文] Clinical efficacy of neoadjuvant chemotherapy with irinotecan (CPT-11) and nedaplatin followed by radical hysterectomy for locally advanced cervical cancer. (2016)
  • 著者名/発表者名: bou-Taleb HA, Koshiyama M, Matsumura N, Baba T, Yamaguchi K, Hamanishi J, Abiko K, Yamanoi K, Murakami R, Horikawa N, Taha AA, Kitamura S, Konishi I.
  • 雑誌名: J Int Med Res 巻: 44 ページ: 346-56
  • DOI: 10.1177/0300060515591858.
  • 査読あり
• [雑誌論文] The BMP signaling pathway leads to enhanced proliferation in serous ovarian cancer-A potential therapeutic target. (2016)
  • 著者名/発表者名: Peng J, Yoshioka Y, Mandai M, Matsumura N, Baba T, Yamaguchi K, Hamanishi J, Kharma B, Murakami R, Abiko K, Murphy SK, Konishi I.
  • 雑誌名: Mol Carcinog. 巻: 55 ページ: 335-45
  • DOI: 10.1002/mc.22283.
  • 査読あり
• [雑誌論文] Chemotherapy Induces Programmed Cell Death-Ligand 1 Overexpression via the Nuclear Factor-κB to Foster an Immunosuppressive Tumor Microenvironment in Ovarian Cancer. (2015)
  • 著者名/発表者名: Peng J, Hamanishi J, Matsumura N, Abiko K, Murat K, Baba T, Yamaguchi K, Horikawa N, Hosoe Y, Murphy SK, Konishi I, Mandai M.
  • 雑誌名: Cancer Res. 巻: 75 ページ: 5034-45
  • DOI: 10.1158/0008-5472.CAN-14-3098.
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genomic profile predicts the efficacy of neoadjuvant chemotherapy for cervical cancer patients. (2015)
  • 著者名/発表者名: Horikawa N, Baba T, Matsumura N, Murakami R, Abiko K, Hamanishi J, Yamaguchi K, Koshiyama M, Yoshioka Y, Konishi I.
  • 雑誌名: BMC Cancer. 巻: 19 ページ: 739
  • DOI: 10.1186/s12885-015-1703-1.
  • 査読あり
• [雑誌論文] Safety and Antitumor Activity of Anti-PD-1 Antibody, Nivolumab, in Patients With Platinum-Resistant Ovarian Cancer. (2015)
  • 著者名/発表者名: Hamanishi J, Mandai M, Ikeda T, Minami M, Kawaguchi A, Murayama T, Kanai M, Mori Y, Matsumoto S, Chikuma S, Matsumura N, Abiko K, Baba T, Yamaguchi K, Ueda A, Hosoe Y, Morita S, Yokode M, Shimizu A, Honjo T, Konishi I.
  • 雑誌名: J Clin Oncol. 巻: 33 ページ: 4015-22
  • DOI: 10.1200/JCO.2015.62.3397.
  • 査読あり
• [雑誌論文] Metabolic alterations caused by HNF1β expression in ovarian clear cell carcinoma contribute to cell survival. (2015)
  • 著者名/発表者名: Amano Y, Mandai M, Yamaguchi K, Matsumura N, Kharma B, Baba T, Abiko K, Hamanishi J, Yoshioka Y, Konishi I.
  • 雑誌名: Oncotarget. 巻: 22 ページ: 26002-17
  • DOI: 10.18632/oncotarget.4692.
  • 査読あり
• [雑誌論文] IFN-γ from lymphocytes induces PD-L1 expression and promotes progression of ovarian cancer. (2015)
  • 著者名/発表者名: Abiko K, Matsumura N, Hamanishi J, Horikawa N, Murakami R, Yamaguchi K, Yoshioka Y, Baba T, Konishi I, Mandai M.
  • 雑誌名: Br J Cancer. 巻: 28 ページ: 1501-9
  • DOI: 10.1038/bjc.2015.101.
  • 査読あり
• [学会発表] Genomic Alterations of Ovarian Clear Cell Carcinoma (2015)
  • 著者名/発表者名: Noriomi Matsumura
  • 学会等名: The 57th meeting of the Japan Society of Gynecologic Oncology
  • 発表場所: アイーナ岩手県民情報センター(盛岡市)
  • 年月日: 2015-08-07 – 2015-08-09
  • 招待講演
• [学会発表] 卵巣明細胞癌におけるSWI/SNF複合体の網羅的遺伝子変異解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 山口 建
  • 学会等名: 67回日本産科婦人科学会学術講演会
  • 発表場所: パシフィコ横浜(横浜市)
  • 年月日: 2015-04-09 – 2015-04-12