末梢血cell free DNAを用いた網羅的・定量的遺伝子変異解析の探索研究

2014 年度 実施状況報告書

• 研究課題/領域番号: 26870509
• 研究機関: 和歌山県立医科大学
• 研究代表者: 赤松 弘朗 和歌山県立医科大学, 医学部, 助教 (10646582)
• 研究期間 (年度): 2014-04-01 – 2016-03-31
• キーワード: Liquid Biopsyに関する研究

研究実績の概要

肺癌を対象として、末梢血採取からDNA抽出・定量・保管に至るまでのプラットフォームを前向き臨床研究として整備し、まずは呼吸器内科を中心として症例集積を開始している。現在21例の症例登録が済んだところであり、今後も継続予定である。次世代シークエンサーを用いた解析については組織検体の集積も待って、今年度中の解析が可能な状況である。探索的研究としての高感度PCR法（Digital PCR法）については、これまでmultiplex検出系の確立がされていなかったため、EGFR遺伝子変異（exon19del、exon20 T790M、exon21 L858R）についてそれぞれのプローブ作成・条件検討を行った。前者については、genomic DNAを用いた検討でmultiplex検出系における十分な精度が示され、結果を2014年の肺癌学会総会で報告した（渡邊、赤松、洪、山本ら、肺癌学会 2014）。その後、臨床検体を用いた検討に移った。同一症例におけるduplex・multiplex検出系での一致率が100％と、精度が十分であることを報告した（Akamatsu, Watanabe, Koh, Yamamotoら、米国癌学会2015）。
臨床情報との統合については2014年1月から呼吸器内科におけるデータベース作成を開始しており、今後遺伝子変異解析結果と併せて報告する予定である。

現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

年度前半で前向き臨床研究としての体制整備（採血からDNA抽出・保管までの体制や臨床データベースの確立）に時間を要したものの、その後は症例集積が比較的順調に進んでいる。一方で同時期に多くの臨床試験・治験が並行して開始となった事から、これらの症例については本研究への参加が制限された事が予想外の事項であった。

今後の研究の推進方策

本年は臨床検体の集積に注力すると同時に、次世代シークエンサーでの解析を進めていく。また、digital PCRを用いたmultiplex検出系についても同様に症例集積と解析を進めていく（2015年日本癌学会で報告予定）。臨床情報との統合については、当科データベースが稼働して長期フォローアップのデータが一部で得られると思われるので、その際に解析することを計画している。

次年度使用額が生じた理由

臨床研究体制の整備と高感度PCR法を用いたmutiplex検出系の確立に時間を要したため、次世代シークエンサーを用いた解析が十分に進まなかったことから次年度使用額が生じた。

次年度使用額の使用計画

次年度は臨床検体の集積を進め、次世代シークエンサー・高感度PCR法を用いた研究を推進していくため、次年度使用額を充てる事ができる。また、multiplex検出系の構築については論文作成を計画しており、こちらについても次年度使用額を充てることを予定している。

研究成果

• [雑誌論文] Disease flare after gefitinib discontinuation. (2015)
  • 著者名/発表者名: Akamatsu H, Ono A, Shukuya T, Tsuya A, Nakamura Y, Kenmotsu H, Naito T, Murakami H, Endo M, Nakajima T, Yamamoto N
  • 雑誌名: Respir Investig 巻: 53 ページ: 68-72
  • DOI: 10.1016
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Comparison of platinum combination re-challenge therapy and docetaxel monotherapy in non-small cell lung cancer patients previously treated with platinum-based chemoradiotherapy. (2015)
  • 著者名/発表者名: Imai H, Kaira K, Mori K, Ono A, Akamatsu H, Taira T, Yoshino R, Kenmotsu H, Saitoh J, Harada H, Naito T, Murakami H, Tomizawa Y, Matsuura M, Saito R, Nakajima T, Yamada M, Takahashi T.
  • 雑誌名: Springerplus 巻: 4 ページ: 152
  • DOI: 10.1186
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] The efficacy of amrubicin on central nervous system metastases originating from small-cell lung cancer: a case series of eight patients. (2015)
  • 著者名/発表者名: Miura S, Kaira K, Kaira R, Akamatsu H, Ono A, Shukuya T, Tsuya A, Nakamura Y, Kenmotsu H, Naito T, Murakami H, Takahashi T, Endo M, Yamamoto N.
  • 雑誌名: Invest New Drugs. 巻: epub ahead of print ページ: epub
  • DOI: epub ahead of print
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Progression-free survival, post-progression survival, and tumor response as surrogate markers for overall survival in patients with extensive small cell lung cancer. (2015)
  • 著者名/発表者名: Imai H, Mori K, Wakuda K, Ono A, Akamatsu H, Shukuya T, Taira T, Kenmotsu H, Naito T, Kaira K, Murakami H, Endo M, Nakajima T, Yamamoto N, Takahashi T.
  • 雑誌名: Ann Thorac Med. 巻: 10 ページ: 61-65
  • DOI: epub ahead of print
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Prognostic impact of cancer cachexia in patients with advanced non-small cell lung cancer. (2015)
  • 著者名/発表者名: Kimura M, Naito T, Kenmotsu H, Taira T, Wakuda K, Oyakawa T, Hisamatsu Y, Tokito T, Imai H, Akamatsu H, Ono A, Kaira K, Murakami H, Endo M, Mori K, Takahashi T, Yamamoto N.
  • 雑誌名: Support Care Cancer 巻: 23 ページ: epub
  • DOI: 10.1007
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Multiplexed molecular profiling of lung cancer using pleural effusion (2014)
  • 著者名/発表者名: Akamatsu H, Koh Y, Kenmotsu H, Naito T, Serizawa M, Kimura M, Mori K, Imai H, Ono A, Shukuya T, Taira T, Murakami H, Ohde Y, Endo M, Nakajima T, Takahashi T, Yamamoto N
  • 雑誌名: J Thorac Oncol 巻: 9 ページ: 1048-1052
  • DOI: 10.1097
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] The effect of gefitinib in patients with postoperative recurrent non-small cell lung cancer harboring mutations of the epidermal growth factor receptor. (2014)
  • 著者名/発表者名: Ko R, Kenmotsu H, Hisamatsu Y, Akamatsu H, Omori S, Nakashima K, Oyakawa T, Wakuda K, Shukuya T, Ono A, Imai H, Taira T, Naito T, Murakami H, Mori K, Endo M, Ohde Y, Takahashi K, Takahashi T.
  • 雑誌名: Int J Clin Oncol 巻: epub ahead of print ページ: epub
  • DOI: epub ahead of print
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Identification of actionable mutations in malignant pleural mesothelioma. (2014)
  • 著者名/発表者名: Shukuya T, Serizawa M, Watanabe M, Akamatsu H, Abe M, Imai H, Tokito T, Ono A, Taira T, Kenmotsu H, Naito T, Murakami H, Takahashi T, Endo M, Ohde Y, Nakajima T, Yamamoto N, Koh Y.
  • 雑誌名: Lung Cancer 巻: 86 ページ: 35-40
  • DOI: 10.1016
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Individual-level data on the relationships of progression-free survival and post-progression survival with overall survival in patients with advanced non-squamous non-small cell lung cancer patients who received second-line chemotherapy. (2014)
  • 著者名/発表者名: Imai H, Mori K, Ono A, Akamatsu H, Taira T, Kenmotsu H, Naito T, Kaira K, Murakami H, Endo M, Nakajima T, Takahashi T.
  • 雑誌名: Med Oncol 巻: 31 ページ: 88
  • DOI: 10.1007
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Changes in forced expiratory volume in 1 second over time in patients with controlled asthma at baseline. (2014)
  • 著者名/発表者名: Matsunaga K, Ichikawa T, Oka A, Morishita Y, Kanai K, Hiramatsu M, Akamatsu H, Kawabata H, Kikuchi T, Akamatsu K, Hirano T, Kou Y, Nakanishi M, Minakata Y, Yamamoto N.
  • 雑誌名: Respir Med 巻: 108 ページ: 976-982
  • DOI: 10.1016
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Toxicity and efficacy of chemotherapy for non-small cell lung cancer with cavitary lesions. (2014)
  • 著者名/発表者名: Tokito T, Shukuya T, Akamatsu H, Ono A, Taira T, Kenmotsu H, Naito T, Murakami H, Takahashi T, Endo M, Mori K, Yamamoto N.
  • 雑誌名: Respir Investig 巻: 52 ページ: epub
  • DOI: 10.1016
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Assessment of mutational profile of Japanese lung adenocarcinoma patients by multitarget assays: a prospective, single-institute study. (2014)
  • 著者名/発表者名: Serizawa M, Koh Y, Kenmotsu H, Isaka M, Murakami H, Akamatsu H, Mori K, Abe M, Hayashi I, Taira T, Maniwa T, Takahashi T, Endo M, Nakajima T, Ohde Y, Yamamoto N.
  • 雑誌名: Cancer 巻: 15 ページ: 1471-81
  • DOI: 10.1002
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Comparison of cisplatin plus pemetrexed and cisplatin plus gemcitabine for the treatment of malignant pleural mesothelioma in Japanese patients. (2014)
  • 著者名/発表者名: Shukuya T, Takahashi T, Imai H, Tokito T, Ono A, Akamatsu H, Taira T, Kenmotsu H, Naito T, Murakami H, Endo M, Yamamoto N.
  • 雑誌名: Respir Investig 巻: 52 ページ: 101-106
  • DOI: 10.1016
  • 査読あり / オープンアクセス
• [学会発表] Ongoing early phase trials using liquid biopsy (2015)
  • 著者名/発表者名: Hiroaki Akamatsu
  • 学会等名: The 4th Japan-Taiwan Oncology Phase I Trial Conference
  • 発表場所: International Conference Center of National Taiwan University Hospital
  • 年月日: 2015-04-26
  • 招待講演
• [学会発表] Establishment of multiplexed ultra-sensitive detection of epidermal growth factor receptor mutations using picodroplet digital PCR (2015)
  • 著者名/発表者名: Hiroaki Akamatsu, Yasuhiro Koh, Masaru Watanabe, Takashi Kikuchi, Masanori Nakanishi, Kazuto Matsunaga, Nobuyuki Yamamoto.
  • 学会等名: American Association of Cancer Research Annual Meeting 2015
  • 発表場所: Pennsylvania Convention Center
  • 年月日: 2015-04-23
• [学会発表] Droplet Digital PCR を用いた EGFR 遺伝子変異のマルチプレックス検出 (2014)
  • 著者名/発表者名: 渡辺 勝、洪 泰浩、赤松 弘朗、菊池 崇史、松永 和人、山本 信之
  • 学会等名: 日本肺癌学会総会
  • 発表場所: 京都国際会館
  • 年月日: 2014-11-15
• [学会発表] Significance ofconsolidation chemotherapyin unresectable, locally advanced non-small cell lung cancer. (2014)
  • 著者名/発表者名: Hiroaki Akamatsu
  • 学会等名: 日本臨床腫瘍学会総会
  • 発表場所: 福岡国際会議場
  • 年月日: 2014-07-17
  • 招待講演
• [図書] 呼吸器疾患診療最新ガイドライン (2014)
  • 著者名/発表者名: 菊池崇史, 赤松弘朗, 山本信之
  • 総ページ数: 342-349
  • 出版者: 総合医学社
• [図書] がん薬物療法の作用機序 殺細胞性抗悪性腫瘍薬 白金製剤･アルキル化薬･抗がん性抗生物質 (2014)
  • 著者名/発表者名: 赤松弘朗, 山本信之
  • 総ページ数: 124-126
  • 出版者: 日本臨床社
• [図書] Ⅲ期非小細胞肺癌の化学放射線療法. (2014)
  • 著者名/発表者名: 赤松弘朗, 山本信之
  • 総ページ数: 84-87
  • 出版者: へるす出版
• [図書] EBMの手法による肺癌診療ガイドライン2014年版 (2014)
  • 著者名/発表者名: 赤松弘朗, 山本信之
  • 総ページ数: 70-80
  • 出版者: 金原出版
• [図書] 現在進行中の大規模無作為化比較試験 (2014)
  • 著者名/発表者名: 赤松弘朗, 山本信之
  • 総ページ数: 360-364
  • 出版者: 南山堂
• [図書] 腫瘍病理鑑別診断アトラス 肺癌 (2014)
  • 著者名/発表者名: 赤松弘朗, 山本信之
  • 総ページ数: 261-265
  • 出版者: 文光堂