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2015 年度 実績報告書

高次クロマチンにおける相同組換え反応の解析

研究課題

研究課題/領域番号 26890023
研究機関早稲田大学

研究代表者

町田 晋一  早稲田大学, 理工学術院, 助教 (50732195)

研究期間 (年度) 2014-08-29 – 2016-03-31
キーワードクロマチン / 相同組換え / ヒストン / ヒストン修飾 / リンカーヒストン / ユビキチン / RAD51
研究実績の概要

本研究の目的は、高次に折り畳まれたクロマチン上での相同組換えを介したDNA二重鎖切断損傷修復の分子機構を明らかにすることである。真核生物の細胞核内に収納されているゲノムDNAはクロマチン構造を形成し、細胞核内に収納されている。クロマチンは、多様な高次構造を形成することで、相同組換え反応を制御することが知られているが、その詳細は明らかになっていない。
そこで、クロマチン高次構造形成に機能するリンカーヒストンH1に着目した。ヒトのリンカーヒストンH1には11種類のバリアントが存在するが、それらが形成する多様なクロマチン構造と相同組換えの関係は分かっていない。そこで、試験管内で再構成したH1バリアントを含むクロマチンを基質とした、RAD51およびRAD54依存的な相同組換え反応を解析を行った。その結果、精巣特異的に発現するH1バリアント(H1T)の相同組換え反応抑制効果が、他のH1バリアントと比較して、著しく低いことが明らかになった。さらに、H1Tの形成するクロマチン高次構造形成をポリヌクレオソームレベルで分析超遠心法により解析し、H1Tの形成するクロマチンが体細胞型のH1バリアントと比較して緩んだ構造であることを明らかにした。H1Tが最も発現している精母細胞は、減数分裂を経て精子となる。その減数分裂の進行には相同組換えによるキアズマの形成が必須であることから、精母細胞に発現するH1Tは、相同組換えのための「場」としてのクロマチン構造形成に機能することが示された。
さらに、ヒストンのモノユビキチン化によるクロマチン高次構造制御機構を、構造生物学的手法により明らかにすることを試みた。転写活性化領域に局在することが知られているH2BK120ubおよびH4K31ubを含むヌクレオソームのX線結晶構造解析を行い、3.3オングストロームでその立体構造を明らかにすることに成功した。

現在までの達成度 (段落)

27年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

27年度が最終年度であるため、記入しない。

  • 研究成果

    (6件)

すべて 2016 2015

すべて 雑誌論文 (5件) (うち国際共著 2件、 査読あり 5件、 オープンアクセス 4件) 学会発表 (1件)

  • [雑誌論文] Chromatin architecture may dictate the target site for DMC1, but not for RAD51, during homologous pairing2016

    • 著者名/発表者名
      Kobayashi, W., Takaku, M., Machida, S., Tachiwana, H., Maehara, K., Ohkawa, Y., and Kurumizaka, H.
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 印刷中 ページ: 印刷中

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Structure and function of human histone H3.Y nucleosome.2016

    • 著者名/発表者名
      Kujirai, T., Horikoshi, N., Sato, K., Maehara, K., Machida, S., Osakabe, A., Kimura, H., Ohkawa, Y. and Kurumizaka, H.
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Research

      巻: 1 ページ: gkw202

    • DOI

      10.1093/nar/gkw202

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] GATA3-dependent cellular reprogramming requires activation-domain dependent recruitment of a chromatin remodeler.2016

    • 著者名/発表者名
      Takaku M., Grimm S.A. Shimbo T., Perera L., Menafra R., Stunnenberg H.G., Archer T.K., Machida S., Kurumizaka H. and Wade P.A.
    • 雑誌名

      Genome Biology

      巻: 17 ページ: 36

    • DOI

      10.1186/s13059-016-0897-0

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Relaxed Chromatin Formation and Weak Suppression of Homologous Pairing by the Testis-Specific Linker Histone H1T.2016

    • 著者名/発表者名
      Machida S., Hayashida R., Takaku M., Fukuto A., Sun J., Kinomura A., Tashiro S. and Kurumizaka H.
    • 雑誌名

      Biochemistry

      巻: 55 ページ: 637-646

    • DOI

      10.1021/acs.biochem.5b01126

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Bivalent interaction of the PZP domain of BRPF1 with the nucleosome impacts chromatin dynamics and acetylation.2015

    • 著者名/発表者名
      Klein B.J., Muthurajan U.M., Lalonde M.E., Gibson M.D., Andrews F.H., Hepler M., Machida S., Yan K., Kurumizaka H., Poirier M.G., Côté J., Luger K. and Kutateladze T.G.
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Research

      巻: 44 ページ: 472-484

    • DOI

      10.1093/nar/gkv1321

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] The biochemical analyses of the chromatin containing mono-ubiquitinated nucleosomes2015

    • 著者名/発表者名
      Shinichi Machida, Yuki Nishiyama and Hitoshi Kurumizaka
    • 学会等名
      International Symposium on Chromatin Structure, Dynamics,and Function
    • 発表場所
      淡路島
    • 年月日
      2015-08-23 – 2015-08-25

URL: 

公開日: 2017-01-06  

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