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2015 年度 実績報告書

海洋ウイルス遺伝資源化計画:海洋RNAウイルスの探索手法確立と多様性・機能の解明

研究課題

研究課題/領域番号 26892031
研究機関国立研究開発法人海洋研究開発機構

研究代表者

浦山 俊一  国立研究開発法人海洋研究開発機構, 海洋生命理工学研究開発センター, ポストドクトラル研究員 (50736220)

研究期間 (年度) 2014-08-29 – 2016-03-31
キーワード海洋 / ウイルス / 遺伝資源
研究実績の概要

本研究は、海洋に存在すると予想される膨大かつ多様なRNAウイルスを新たな遺伝資源として利用することを目指したものである。平成27年度は、海洋環境試料に含まれるRNAウイルス配列を解析することで、海洋性RNAウイルスの特徴や機能の推定を目標とした。
具体的には、平成26年度に確立した網羅的RNAウイルス探索手法を用い、珪藻コロニー中のRNAウイルス組成を調査した。本解析では21種の新規RNAウイルス全長ゲノムが同定され、身近な生物試料中にも、従来想定されていなかった多様なRNAウイルスが存在することが明らかになった。また、21種中2種は動物病原ウイルスのグループに属する可能性が示唆された。これら2種のウイルスが現在動物に感染するとは考えられないが、動物病原ウイルスの進化や起源を考える上で重要な知見となることが予想される。本研究成果は査読付国際誌に投稿、受理されている。
海水中の微生物を対象にしたRNAウイルス探索では、少なくとも100種以上の新規RNAウイルスが検出されており、上記結果とあわせ、海洋環境は多様なRNAウイルスを保持している新たなフロンティアであると考えられる。本研究で用いた網羅的RNAウイルス探索手法には、「多様なRNAウイルス遺伝子の特異的な濃縮」という側面もあり、今回の研究において「海洋RNAウイルスの遺伝資源化」に向けた最低限の科学的知見と技術基盤の構築が達成されたと考えられる。

現在までの達成度 (段落)

27年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

27年度が最終年度であるため、記入しない。

  • 研究成果

    (8件)

すべて 2016 2015 その他

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件、 オープンアクセス 2件、 謝辞記載あり 2件) 学会発表 (3件) (うち国際学会 1件、 招待講演 1件) 図書 (2件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] FLDS: A Comprehensive dsRNA Sequencing Method for Intracellular RNA Virus Surveillance.2016

    • 著者名/発表者名
      Syun-ichi Urayama, Yoshihiro Takaki, Takuro Nunoura.
    • 雑誌名

      Microbes and Environments

      巻: 31 ページ: 33-40

    • DOI

      10.1264/jsme2.ME15171

    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] A New Fractionation and Recovery Method of Viral Genomes Based on Nucleic Acid Composition and Structure Using Tandem Column Chromatography.2015

    • 著者名/発表者名
      Syun-ichi Urayama, Yukari Yoshida-Takashima, Mitsuhiro Yoshida, Yuji Tomaru, Hiromitsu Moriyama, Ken Takai, Takuro Nunoura.
    • 雑誌名

      Microbes and Environments

      巻: 30 ページ: 199-203

    • DOI

      10.1264/jsme2.ME14174

    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [学会発表] 宿主病徴に依存しない網羅的RNAウイルスゲノム決定手法の確立2016

    • 著者名/発表者名
      浦山俊一、吉田ゆかり、高木善弘、高井研、布浦拓郎
    • 学会等名
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      東京工業大学 大岡山キャンパス(東京都目黒区)
    • 年月日
      2016-03-05
  • [学会発表] 高効率dsRNAシーケンシングによる細胞内RNAウイルスワールドの発見2015

    • 著者名/発表者名
      浦山俊一
    • 学会等名
      日本微生物生態学会第30回大会
    • 発表場所
      土浦亀城プラザ(茨城県土浦市)
    • 年月日
      2015-10-20
    • 招待講演
  • [学会発表] Fractionation of four types of viral nucleic acids by using hydroxyapatite and cellulose chromatography2015

    • 著者名/発表者名
      Syun-ichi Urayama, Yukari Yoshida, Mitsuhiro Yoshida, Ken Takai, Takuro Nunoura
    • 学会等名
      The annual meeting of the American Society for Virology
    • 発表場所
      Western University London ON, Canada
    • 年月日
      2015-07-13
    • 国際学会
  • [図書] バイオサイエンスとインダストリー2016

    • 著者名/発表者名
      浦山俊一・布浦拓郎.
    • 総ページ数
      2
    • 出版者
      財団法人バイオインダストリー協会
  • [図書] 生物の科学 遺伝2015

    • 著者名/発表者名
      浦山俊一・吉田光宏・吉田(高島)ゆかり.
    • 総ページ数
      6 (272-277)
    • 出版者
      エヌ・ティー・エス
  • [備考] JAMSTEC研究者総覧

    • URL

      http://www.jamstec.go.jp/souran/html/Shunichi_Urayama003613-j.html

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公開日: 2017-01-06  

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