研究課題/領域番号 |
62580227
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研究種目 |
一般研究(C)
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配分区分 | 補助金 |
研究分野 |
生体物性学
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研究機関 | (財)東京都臨床医学総合研究所 |
研究代表者 |
立野 玲子 (南川 玲子) 東京都臨床医学総合研究所, 生命情報工学研究室, 研究員 (70150208)
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研究分担者 |
栗原 敬子 (財)東京都臨床研, 生命情報工学研究室, 研究員 (90124495)
大室 弘美 (財)東京都臨床研, 生命情報工学研究室, 研究員 (00124470)
神沼 二真 国立衛生試験所, 化学物質情報部, 部長 (60113495)
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研究期間 (年度) |
1987 – 1989
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キーワード | C.エレガンス / 細胞系譜 / コンピュ-タグラフィックス / 3次元再構成 |
研究概要 |
本研究の目的は、線虫(主としてC.エレガンス)の初期胚発生過程を時間的・空間的に連続な断層映像として記録し、これより細胞(割球)集団の立体的な配位構造の変化を経時的に計測することである。このことが可能となれば、細胞分裂の様子や移動系譜を定量的に解析することができ、発生に関与する遺伝子・外部環境因子などを調べる手掛りが得られる。そのためにC.エレガンスおよび類縁線虫の初期胚発生がコマ撮りで記録でき、さらに解析できるコンピュ-タシステムを開発した。このシステムは、(1)16mmフィルムの映像ないしTVカメラの映像をディジタル化しコンピュ-タ内に画像デ-タとして蓄積する。(2)画像デ-タを観察し細胞(核)位置を対話式に計測する。(3)各細胞位置を3次元的に再構成し、初期胚をコンピュ-タグラフィックスを用いて胚モデルを立体的に表現する。という機能を有し、実験から解析までを統合的に研究支援するシステムである。当初の2年間は、システムの開発とそれを用いた細胞核位置の決定を併行して進めてきたが、最終年度は、このシステムをパソコンへ移植した。これは、パソコンのめざましい普及に伴いすでに決定した2細胞期から87細胞期までの細胞核の位置デ-タを他の研究者も利用できるようにパソコンで配布するためである。具体的にはホストコンピュ-タとしてPC9801を用い、画像メモリ-、TV映像入力インタ-フェ-ス、パルスモ-タコントロ-ラ、光磁気ディスクを接続し、さらに演算能力アップのためにトランスピュ-タを用いた複合システムを開発した。現在個々の基本機能部分が完成したところであり、プログラムを統合して有機的なシステムにまとめる段階に来ている。本システムは、映像のディスクへの書き込み時間が約3秒と遅いものの、デ-タの吟味には優れており、一般の利用に呈す意味があり、研究を支援するシステムとして有効である。
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