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2015 年度 実績報告書

細胞壁再構成をともなう離生細胞間隙形成の分子機構

公募研究

研究領域植物細胞壁の情報処理システム
研究課題/領域番号 15H01233
研究機関神戸大学

研究代表者

石崎 公庸  神戸大学, 理学(系)研究科(研究院), 准教授 (00452293)

研究期間 (年度) 2015-04-01 – 2017-03-31
キーワード植物 / 細胞壁 / 微小管 / 光合成 / コケ植物 / 進化
研究実績の概要

NOP1-Citrineをnop1変異体に導入し気室形成が回復した相補株と、NOP1のE3リガーゼ活性に必要なU-boxドメインを欠失した⊿UboxNOP1-Citrineを導入したnop1変異体と用いてNOP1と相互作用するタンパク質およびNOP1と相互作用しプロテアソームによる分解を受けるタンパク質候補を免疫沈降実験とLC-MSMSによるプロテオーム技術により解析した。候補となるタンパク質候補は数百にも及んだが、細胞内局在や機能ドメイン予測などの情報を併せて解析対象を28個にまで絞り込んだ。絞り込んだNOP1相互作用因子候補には、微小管や細胞骨格関連因子、セルロース合成酵素関連因子、膜交通関連因子、受容体キナーゼなどが含まれている。これらのNOP1相互作用因子候補をコードする遺伝子について、CRISPR/Cas9によるノックアウト株の作出を進めており、現在のところ2つの遺伝子について、気室形成に関連する表現形が見えている。そのうち、キネシン様カルモジュリン結合タンパク質ZWICHELの相同遺伝子CUFF.4329を破壊すると表面から気室孔が観察されず正常な気室形成が確認できない。CUFF.4329の破壊株は、気室の他にも仮根や葉状体の形態に異常が認められる(NOP1は野生株と変わらない)。また表層微小管とCESA複合体を連結するCELLULOSE SYNTHASE-INTERACTIVE1遺伝子の相同遺伝子CUFF.11924を破壊すると気室形成頻度が著しく減少し、形成された気室も異常な形態を示した。今後、これらの候補遺伝子の機能解析を進めるとともに、NOP1との相互作用について複数の手法を用いて確認し、ゼニゴケにおける離生細胞間隙形成にともなう気室形成機構を明らかにする。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

本研究は、基部陸上植物ゼニゴケの気室形成をモデルに、植物の離生細胞間隙形成の制御メカニズムを解明することを目的としている。ゼニゴケの離生細胞間隙形成を制御するE3リガーゼNOP1の相互作用因子候補を絞込み、更にその中から気室形成に関わる制御因子の同定にトライしてきた。プロテオミクス解析では、解析対象となる相互作用因子候補が多すぎること、実験毎のバラつきが大きいことが問題となった。しかしながら、CRISPR/Cas9による新しい変異体作出法を導入することにより、当初の想定よりもハイスループットな遺伝子機能解析系が確立された。この技術の導入により、離生細胞間隙形成の関連因子が複数見つかりつつある。

今後の研究の推進方策

現在進めている、相互作用因子候補の機能解析については、CRISPR/Cas9系によるゲノム編集系による機能欠損変異体の作出と表現形解析を行っていく。機能欠損変異体について、気室形成に異常が確認され、気室形成に関連する機能が考えられる遺伝子については、発現組織やNOP1との相互作用について詳細な検証を行う。以上の情報を統合し、ゼニゴケにおける離生細胞間隙形成にともなう気室形成制御機構を明らかにする。

  • 研究成果

    (16件)

すべて 2016 2015 その他

すべて 国際共同研究 (4件) 雑誌論文 (7件) (うち国際共著 3件、 査読あり 7件、 謝辞記載あり 2件、 オープンアクセス 3件) 学会発表 (5件) (うち国際学会 1件、 招待講演 2件)

  • [国際共同研究] Monash University(Australia)

    • 国名
      オーストラリア
    • 外国機関名
      Monash University
  • [国際共同研究] Joint Genome Institute, DOE(米国)

    • 国名
      米国
    • 外国機関名
      Joint Genome Institute, DOE
  • [国際共同研究] Gregor Mendel Institute(Austria)

    • 国名
      オーストリア
    • 外国機関名
      Gregor Mendel Institute
  • [国際共同研究] University of Oxford/University of Cambridge(United Kingdom)

    • 国名
      英国
    • 外国機関名
      University of Oxford/University of Cambridge
  • [雑誌論文] Molecular Genetic Tools and Techniques for Marchantia polymorpha Research2016

    • 著者名/発表者名
      Ishizaki, K., Nishihama, R., Yamato, K.T. and Kohchi, T.
    • 雑誌名

      Plant and Cell Physiology

      巻: 57 ページ: 262-270

    • DOI

      10.1093/pcp/pcv097

    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] SNARE molecules in Marchantia polymorpha.: unique and conserved feature of the membrane fusion machinery.2016

    • 著者名/発表者名
      Kanazawa, T., Era, A., Minamino, N., Shikano, Y., Fujimoto, M., Uemura, T., Nishihama, R., Yamato, K.T., Ishizaki, K., Nishiyama, T., Kohchi, T., Nakano, A. and Ueda, A.
    • 雑誌名

      Plant and Cell Physiology

      巻: 57 ページ: 307-324

    • DOI

      10.1093/pcp/pcv076

    • 査読あり
  • [雑誌論文] RSL class I genes controlled the development of epidermal structures in the common ancestor of land plants.2016

    • 著者名/発表者名
      Proust, H., Honkanen, S., Jones, V.A., Morieri, G., Prescott, H., Kelly, S., Ishizaki, K., Kohchi, T. and Dolan, L.
    • 雑誌名

      Current Biology

      巻: 26 ページ: 93-99

    • DOI

      10.1016/j.cub.2015.11.042

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Auxin produced by the indole-3-pyruvic acid pathway regulates development and gemmae dormancy in the liverwort Marchantia polymorpha.2016

    • 著者名/発表者名
      Eklund, D.M., Ishizaki, K., Flores-Sandoval, E., Kikuchi, S., Takebayashi, Y., Tsukamoto, S., Hirakawa, Y., Nonomura, M., Kato, H., Kouno, M., Bhalerao, R.P., Lagercrantz, U., Kasahara, H., Kohchi, T. and Bowman, J.L.
    • 雑誌名

      The Plant Cell

      巻: 27 ページ: 1650-69

    • DOI

      10.1105/tpc.15.00065

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Development of Gateway binary vector series with four different selection markers for the liverwort Marchantia polymorpha.2015

    • 著者名/発表者名
      Ishizaki, K., Nishihama, R., Ueda, M., Inoue, K., Ishida, S., Nishimura, Y., Shikanai, T., Kohchi, T.
    • 雑誌名

      PLoS One

      巻: 10 ページ: e0138876

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0138876

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Development of schizogenous intercellular spaces in plants.2015

    • 著者名/発表者名
      Ishizaki, K.
    • 雑誌名

      Frontiers in Plant Science

      巻: 6 ページ: 497

    • DOI

      10.3389/fpls.2015.00497

    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Auxin-mediated transcriptional system with a minimal set of components is critical for morphogenesis through the life cycle in Marchantia polymorpha.2015

    • 著者名/発表者名
      Kato, H., Ishizaki, K., Kouno, M., Shirakawa, M., Bowman, J.L., Nishihama, R. and Kohchi, T.
    • 雑誌名

      PLoS Genetics

      巻: 11 ページ: e1005084

    • DOI

      10.1371/journal.pgen.1005084

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] Conserved mechanism for secondary meristem formation in land plants2016

    • 著者名/発表者名
      Kimitsune Ishizaki
    • 学会等名
      第57回日本植物生理学会年会
    • 発表場所
      岩手大学(岩手県・盛岡市)
    • 年月日
      2016-03-18 – 2016-03-20
    • 招待講演
  • [学会発表] Screen for regulatory proteins of schizogenous intercellular space formation in Marchantia polymorpha by using mass spectrometry and the CRISPR/Cas9 genome editing technology.2016

    • 著者名/発表者名
      Miya Mizutani; Kimitsune Ishizaki; Yoichiro Fukao; Masayuki Fujiwara; Akihide Masuda; Ryuichi Nishihama; Takayuki Kohchi
    • 学会等名
      第57回日本植物生理学会年会
    • 発表場所
      岩手大学(岩手県・盛岡市)
    • 年月日
      2016-03-18 – 2016-03-20
  • [学会発表] Functional characterization of GCAM1, an R2R3-MYB essential for the development of gemma cup in the liverwort Marchantia polymorpha.2016

    • 著者名/発表者名
      Shigeyuki Tsukamoto; Tomomi Sugaya; Katsuyuki T. Yamato; Ryuichi Nishihama; Hiroyoshi Kubo; Hidehiro Fukaki; Tetsuro Mimura; Takayuki Kohchi; Kimitsune Ishizaki
    • 学会等名
      第57回日本植物生理学会年会
    • 発表場所
      岩手大学(岩手県・盛岡市)
    • 年月日
      2016-03-18 – 2016-03-20
  • [学会発表] Characterization of KARAPPO, an essential gene for gemma formation in Marchantia polymorpha.2016

    • 著者名/発表者名
      Takuma Hiwatashi; Katsushi Yamaguchi; Shuji Shigenobu; Shinichiro Sawa; Hiroyuki Kirita; Hidehiro Fukaki; Tetsuro Mimura; Takayuki Kohchi; Kimitsune Ishizaki
    • 学会等名
      第57回日本植物生理学会年会
    • 発表場所
      岩手大学(岩手県・盛岡市)
    • 年月日
      2016-03-18 – 2016-03-20
  • [学会発表] An ancient regulatory mechanism for secondary meristem formation in land plants2015

    • 著者名/発表者名
      Kimitsune Ishizaki
    • 学会等名
      Towards Increased Plant Productivity through Understanding of Environmental Responses and Epigenetic Regulation
    • 発表場所
      理研、横浜キャンパス(神奈川県・横浜市)
    • 年月日
      2015-11-24 – 2015-11-25
    • 国際学会 / 招待講演

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公開日: 2017-01-06   更新日: 2022-01-27  

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