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2016 年度 実績報告書

構造情報に基づいた機能変換による膜孔形成毒素の会合機構の解明

公募研究

研究領域生命分子システムにおける動的秩序形成と高次機能発現
研究課題/領域番号 16H00748
研究機関北海道大学

研究代表者

田中 良和  北海道大学, 先端生命科学研究院, 准教授 (20374225)

研究期間 (年度) 2016-04-01 – 2018-03-31
キーワードタンパク質 / 構造解析 / 膜孔形成毒素
研究実績の概要

病原性微生物がホスト細胞に障害を与えるために産生する膜孔形成毒素は,可溶性の単量体として分泌されるが,ターゲット細胞に接すると膜上でpreporeと呼ばれる円状の会合体を形成した後,劇的な構造変化を起こして膜孔を形成する.黄色ブドウ球菌は,3種類の非常に類似した膜孔形成毒素(Hla,LukF,Hlg2)を分泌するが,Hlaはホモ7量体の膜孔を形成するのに対し,LukF,Hlg2は交互に会合したヘテロ8量体の膜孔を形成する.毒素同士がどのようにして特定のパートナーとのみ特異的に会合して膜孔を形成するのか,また,7量体・8量体という分子の会合数がどのようにして決定されるのかについては,明らかにできていない.本課題では,構造解析から提唱された機構を基に変異体蛋白質を合理設計し,毒素の会合特性を改変することを通して,これらの毒素の自己組織化機構を解明する.
平成28年度は,HlaとLukFの相同性が高いことに着目し,Hlaの特徴的な配列領域をLukFに導入した.具体的には,N末端アミノラッチ領域をHlaの配列に置換したLukF(LukF-Mu1)と細胞膜結合領域をHlaの配列に置換したLukF(LukF-Mu3)の発現ベクターを作成した.また,これらの蛋白質を大腸菌発現系により大量発現させ,Niアフィニティークロマトグラフィーにより精製した.各蛋白質とも機能解析に十分な量の試料が得られた. LukF-Mu1については,MPD添加による会合体形成能を評価したが,自発的な会合は確認できなかった.

現在までの達成度
現在までの達成度

2: おおむね順調に進展している

理由

機能改変を目指した2種類の変異体をデザインし,その発現系を構築できた.次年度に機能解析するために十分な量の試料を得ることができており,当初の計画は順調に進んでいると判断した.

今後の研究の推進方策

得られた変異体蛋白質の溶血活性を,ヒト赤血球を用いて評価する.分子特性の変化が確認できた場合は,その立体構造解析を行う.

  • 研究成果

    (12件)

すべて 2017 2016 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (5件) (うち査読あり 5件、 謝辞記載あり 5件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (5件) (うち国際学会 2件、 招待講演 1件) 産業財産権 (1件)

  • [国際共同研究] マックスプランク研究所(ドイツ)

    • 国名
      ドイツ
    • 外国機関名
      マックスプランク研究所
  • [雑誌論文] Biochemical and structural characterization of oxygen-sensitive 2-thiouridine synthesis catalyzed by the iron-sulfur protein TtuA2017

    • 著者名/発表者名
      Minghao Chen, Shin-ichi Asai, Shun Narai, Shusuke Nambu, Naoki Omura, Yuriko Sakaguchi, Tsutomu Suzuki, Masao Ikeda-Saito, Kimitsuna Watanabe, Min Yao, Naoki Shigi and, Yoshikazu Tanaka
    • 雑誌名

      Proc. Natl. Acad. Sci. USA

      巻: 印刷中 ページ: 印刷中

    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Structural properties of phycoerythrin from dulse palmaria palmata2017

    • 著者名/発表者名
      Yoshikatsu Miyabe, Tomoe Furuta, Tomoyuki Takeda, Gaku Kanno, Takeshi Shimizu, Yoshikazu Tanaka, Zuoqi Gai, Hajime Yasui, Hideki Kishimura
    • 雑誌名

      J. Food Biochem

      巻: 41 ページ: e12301

    • DOI

      10.1111/jfbc.12301

    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Structural basis for recognition of a kink-turn motif by an archaeal homologue of human RNase P protein Rpp382016

    • 著者名/発表者名
      Kosuke Oshima, Yosuke Kakiuchi, Yoshikazu Tanaka, Toshifumi Ueda Takashi Nakashima, Makoto Kimura, Min Yao
    • 雑誌名

      Biochem. Biophys. Res. Commun.

      巻: 474 ページ: 541-546

    • DOI

      doi.org/10.1016/j.bbrc.2016.04.118

    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Crystallographic Study of Two-Thiouridine Synthetic Complex TtuA-TtuB from Thermus thermophilus2016

    • 著者名/発表者名
      Minghao Chen, Shun Narai, Naoki Omura, Naoki Shigi, Sarin Chimnaronk, Yoshikazu Tanaka and Min Yao
    • 雑誌名

      Acta Crystallogr. F.

      巻: F72 ページ: 777-781

    • DOI

      doi.org/10.1107/S2053230X16014242

    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] 超巨大蛋白質会合体ヘモシアニンのX線結晶構造解析2016

    • 著者名/発表者名
      松野明日香,田中良和
    • 雑誌名

      日本結晶学会誌

      巻: 58 ページ: 91-95

    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [学会発表] Encapsulation of Biomacromolecule into Porous Crystal of a Huge Protein Complex Hemocyanin2017

    • 著者名/発表者名
      Koji Kato, Asuka Matsuno, Yuxin Ye, Yuki Ohnishi, Akira Kitamura, Masataka Kinjo, Satoshi Abe, Takashi Ueda, Yoshikazu Tanaka, Min Yao
    • 学会等名
      新学術領域研究「動的秩序と機能」第5回国際シンポジウム
    • 発表場所
      東京大学(東京都,目黒区)
    • 年月日
      2017-01-21 – 2017-01-22
    • 国際学会
  • [学会発表] Pore formation mechanism of staphylococcal pore forming toxin2016

    • 著者名/発表者名
      Yoshikazu Tanaka
    • 学会等名
      Max Planck Institute of Molecular Physiology Department 3 Lab Retreat Seminar
    • 発表場所
      Ringberg,ドイツ
    • 年月日
      2016-10-09 – 2016-10-12
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] バクテリアにおけるユビチキン様翻訳後修飾の構造基盤2016

    • 著者名/発表者名
      陳明皓,奈良井峻,大村直毅,鴫直樹,田中良和,姚閔
    • 学会等名
      RNAフロンティアミーティング2016
    • 発表場所
      いこいの湯宿いろは(北海道,虻田郡ニセコ町)
    • 年月日
      2016-08-31 – 2016-09-02
  • [学会発表] Multidomain architecture of SepCysE confers transsulfursome flexibility to synthesize Cys-tRNACys in two-step indirect pathway2016

    • 著者名/発表者名
      Meirong Chen, Yume Kubo, Koji Kato, Yoshikazu Tanaka, Isao Tanaka, Min Yao
    • 学会等名
      第53回日本生化学会北海道支部例会 日本生化学会北海道支部・日本生物物理学会北海道支部 合同シンポジウム
    • 発表場所
      北海道大学(北海道,札幌市)
    • 年月日
      2016-07-08 – 2016-07-08
  • [学会発表] バクテリアにおける二機能性ユビキチン様タンパク質の機能調節の構造基盤2016

    • 著者名/発表者名
      陳明皓,奈良井峻,大村直毅,鴫直樹,田中良和,姚閔
    • 学会等名
      第16回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      福岡国際会議場(福岡県,福岡市)
    • 年月日
      2016-06-07 – 2016-06-09
  • [産業財産権] ヘモシアニン会合体を用いた包摂体の製造方法2016

    • 発明者名
      田中良和,松野明日香,北村朗,金城政孝,姚閔,上野隆史,安部聡
    • 権利者名
      国立大学法人北海道大学,国立大学法人東京工業大学
    • 産業財産権種類
      特許
    • 産業財産権番号
      特許出願2016-110309
    • 出願年月日
      2016-06-01

URL: 

公開日: 2018-12-17  

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