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2016 年度 実績報告書

人工蛋白質ナノブロック自己組織化超分子複合体の構造機能解析と動的秩序系設計構築

公募研究

研究領域生命分子システムにおける動的秩序形成と高次機能発現
研究課題/領域番号 16H00761
研究機関信州大学

研究代表者

新井 亮一  信州大学, 学術研究院繊維学系, 准教授 (50344023)

研究期間 (年度) 2016-04-01 – 2018-03-31
キーワードタンパク質ナノブロック / 超分子複合体 / 自己組織化 / 動的秩序系 / 人工蛋白質デザイン / 蛋白質安定性 / 蛋白質工学 / ナノバイオテクノロジー
研究実績の概要

近年、独自のヌンチャク型二量体人工蛋白質WA20を辺とし、T4ファージ三量体形成foldonドメインを頂点とした“人工蛋白質ナノブロック”を開発し、自己組織化により樽型6量体構造や正四面体型12量体構造等の複数種の人工蛋白質複合体超分子ナノ構造を形成することを明らかにした。そこで、本研究では、これらの人工蛋白質ナノブロックによる自己組織化ナノ構造超分子複合体の構造機能解析と動的秩序システムの設計・構築を目的とする。
そこで、28年度は、特に、ナノブロックに用いる人工蛋白質の安定化改変体の開発及び構造機能解析や、より特異的にナノブロック超分子複合体構造が形成するような動的秩序系の設計構築することを目指した。その結果、ヌンチャク型人工蛋白質WA20を改変した独自の超安定化人工蛋白質Super WA20 (SUWA)を開発し、熱変性実験ではSUWAの変性温度は122℃と極めて高く、WA20よりも47℃の熱安定性の向上に成功した。さらに、SUWAの安定化機構の理解を深めるためにX線結晶構造解析を行って立体構造を解明したところ、WA20と同様に特徴的な分子間フォールディング4本へリックスバンドル二量体構造を形成していた。変異導入箇所を詳細に観察すると、新たな疎水性相互作用が形成されており熱安定化への寄与が確認された。さらに、蛋白質ナノブロックSUWA-foldonを構築したところ、複数の自己組織化超分子ナノ構造複合体の形成が示された。また、熱変性実験を行ったところ、これらの蛋白質ナノブロック複合体においても安定性の向上が示され、さらに部分的熱変性・再構成による動的秩序構造の形成も示唆された。これらについてSEC-MALS解析やSAXS解析を行ったところ、樽型6量体及び正四面体型12量体の超分子複合体構造の形成が示唆された。以上の結果について、論文を準備中である。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

1: 当初の計画以上に進展している

理由

研究の過程で、予想以上に興味深い知見なども得られたため、研究実施計画の一部については予定を変更して、それらの興味深い現象をさらに積極的に追究した結果、9.研究実績に記載したように、独自の超安定化人工蛋白質Super WA20 (SUWA)の開発や、蛋白質ナノブロックSUWA-foldonの部分的熱変性・再構成による動的秩序構造形成など、当初の計画以上に、オリジナリティーの高い非常に優れた成果が得られたと考えている。これらの成果について、現在、主に化学系のトップジャーナル等を目指して、論文を執筆中である。

今後の研究の推進方策

これまでの研究成果を踏まえ、29年度は、独自のヌンチャク型人工蛋白質を利用した人工蛋白質ナノブロックによる自己組織化ナノ構造超分子系複合体の構造機能解析と、動的秩序系設計及び構築をさらに進めるために、以下のような研究を積極的に推進する。
まず、これらの人工蛋白質複合体のより詳細な構造機能解析として、電子顕微鏡やX線結晶構造解析による立体構造解析や機能解析等を行う。また、特異的な構造機能を構築するために、温度変化やpH変化等による部分的変性及び再構成の条件を検討・制御することによって、特定の超分子ナノ構造が、より特異的に形成するように蛋白質構造安定性やフォールディング過程を考慮した動的秩序系の設計構築を推進する。さらに、これらの成果について、トップ級のジャーナルを目指して、論文執筆及び投稿を積極的に進める。

  • 研究成果

    (34件)

すべて 2017 2016 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (3件) (うちオープンアクセス 3件、 査読あり 1件) 学会発表 (25件) (うち国際学会 8件、 招待講演 13件) 備考 (4件) 産業財産権 (1件)

  • [国際共同研究] Princeton University(米国)

    • 国名
      米国
    • 外国機関名
      Princeton University
  • [雑誌論文] Design and construction of self-assembling supramolecular protein complexes using artificial and fusion proteins as nanoscale building blocks2017

    • 著者名/発表者名
      Naoya Kobayashi, Ryoichi Arai
    • 雑誌名

      Current Opinion in Biotechnology

      巻: 46 ページ: 57-65

    • DOI

      10.1016/j.copbio.2017.01.001

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] 人工蛋白質で「かたち」をつくろう―ブロック遊びしようよ!―2016

    • 著者名/発表者名
      小林直也,新井亮一
    • 雑誌名

      生物工学会誌

      巻: 94 ページ: 270

    • オープンアクセス
  • [雑誌論文] バイナリーパターン配列デザインによるデノボ蛋白質の創出と蛋白質ナノブロックによる超分子複合体の創生2016

    • 著者名/発表者名
      小林直也,木村尚弥,新井亮一
    • 雑誌名

      生物工学会誌

      巻: 94 ページ: 485-488

    • オープンアクセス
  • [学会発表] Self-assembling supramolecular nanostructures created from de novo protein nanobuilding blocks2017

    • 著者名/発表者名
      Naoya Kimura, Naoya Kobayashi, Ryoichi Arai
    • 学会等名
      Okazaki Conference 2017 on Grand Challenges in Small-angle Scattering
    • 発表場所
      岡崎コンファレンスセンター(愛知県岡崎市)
    • 年月日
      2017-03-20
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] pH-dependent structural transition of self-assembling nanostructures constructed from protein nanobuilding blocks using a dimeric de novo protein2017

    • 著者名/発表者名
      Naoya Kobayashi, Takuya Sengoku, Takaaki Sato, Ryoichi Arai
    • 学会等名
      Okazaki Conference 2017 on Grand Challenges in Small-angle Scattering
    • 発表場所
      岡崎コンファレンスセンター(愛知県岡崎市)
    • 年月日
      2017-03-19
    • 国際学会
  • [学会発表] タンパク質ナノブロックによる動的秩序構造形成2017

    • 著者名/発表者名
      木村尚弥、小林直也、新井亮一
    • 学会等名
      日本化学会第97春季年会
    • 発表場所
      慶応大学(横浜市)
    • 年月日
      2017-03-16
    • 招待講演
  • [学会発表] Self-assembling supramolecular nanostructures created from de novo protein nanobuilding blocks2017

    • 著者名/発表者名
      Ryoichi Arai
    • 学会等名
      11th Annual Symposium on Nanobiotechnology 2017
    • 発表場所
      川崎市産業振興会館(川崎市)
    • 年月日
      2017-02-28
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 人工タンパク質ナノブロック(PN-Block)による自己組織化超分子ナノ構造複合体の創製:“ネオバイオ分子”創出へ向けて2017

    • 著者名/発表者名
      新井亮一
    • 学会等名
      平成28年度第3回富山大学テニュアトラックセミナー
    • 発表場所
      富山大学(富山市)
    • 年月日
      2017-02-03
    • 招待講演
  • [学会発表] Dynamical Ordering Nanostructures Constructed from Protein Nanobuilding Blocks2017

    • 著者名/発表者名
      Naoya Kimura, Naoya Kobayashi, Ryoichi Arai
    • 学会等名
      The 5th International Symposium of Dynamical Ordering of Biomolecular Systems for Creation of Integrated Functions
    • 発表場所
      東京大学(東京都目黒区)
    • 年月日
      2017-01-22
    • 国際学会
  • [学会発表] 人工蛋白質ナノブロックによる多様な自己組織化超分子ナノ構造複合体:ネオバイオ超分子の創生を目指して2016

    • 著者名/発表者名
      小林直也、木村尚弥、新井亮一
    • 学会等名
      第39回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(横浜市)
    • 年月日
      2016-12-02
    • 招待講演
  • [学会発表] 蛋白質ナノブロック用超安定化人工蛋白質SUWA (Super WA20)の特性解析及び構造解析2016

    • 著者名/発表者名
      木村尚弥、小林直也、新井亮一
    • 学会等名
      第39回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(横浜市)
    • 年月日
      2016-12-01
  • [学会発表] 人工タンパク質をブロックに見立てた超分子ナノ構造複合体の設計構築2016

    • 著者名/発表者名
      小林直也、木村尚弥、新井亮一
    • 学会等名
      第54回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      つくば国際会議場(つくば市)
    • 年月日
      2016-11-25
    • 招待講演
  • [学会発表] De Novo Protein Nano-Building Block Approach for “Synthetic Structural Biology” to Create Artificial Supramolecular Protein Complexes2016

    • 著者名/発表者名
      Ryoichi Arai, Naoya Kimura, Naoya Kobayashi, Michael H. Hecht
    • 学会等名
      THE 42nd NAITO CONFERENCE ON In the Vanguard of Structural Biology: Revolutionizing Life Sciences
    • 発表場所
      CHATERAISE Gateaux Kingdom SAPPORO (札幌市)
    • 年月日
      2016-10-06
    • 国際学会
  • [学会発表] 蛋白質ナノブロック用超安定化人工蛋白質SUWA (Super WA20)の特性解析及び構造解析2016

    • 著者名/発表者名
      木村尚弥、小林直也、新井亮一
    • 学会等名
      第68回日本生物工学会大会
    • 発表場所
      富山国際会議場(富山市)
    • 年月日
      2016-09-29
  • [学会発表] Selfassembling supramolecular nanostructures created by de novo extender protein nanobuilding blocks2016

    • 著者名/発表者名
      Naoya Kimura, Naoya Kobayashi, Ryoichi Arai
    • 学会等名
      第68回日本生物工学会大会
    • 発表場所
      富山国際会議場(富山市)
    • 年月日
      2016-09-29
    • 招待講演
  • [学会発表] 人工蛋白質ナノブロック(PN-Block)による自己組織化超分子ナノ構造の創製:“合成構造生物学”を目指して2016

    • 著者名/発表者名
      小林直也、木村尚弥、新井亮一
    • 学会等名
      第28回高遠・分子細胞生物学シンポジウム
    • 発表場所
      高遠さくらホテル(長野県伊那市)
    • 年月日
      2016-08-25
  • [学会発表] 人工蛋白質ナノブロックの設計開発による自己組織化超分子ナノ構造複合体の創出2016

    • 著者名/発表者名
      小林直也、新井亮一
    • 学会等名
      2016年度日本生物工学会中部支部例会
    • 発表場所
      名古屋大学(名古屋市)
    • 年月日
      2016-08-05
    • 招待講演
  • [学会発表] タンパク質ナノブロックによる自己組織化超分子複合体の創製2016

    • 著者名/発表者名
      新井亮一
    • 学会等名
      第48回若手ペプチド夏の勉強会
    • 発表場所
      大学セミナーハウス(東京都八王子市)
    • 年月日
      2016-08-01
    • 招待講演
  • [学会発表] 超安定化二量体デノボ蛋白質SUWAの創製と蛋白質ナノブロック複合体構築2016

    • 著者名/発表者名
      木村尚弥、新井亮一
    • 学会等名
      第48回若手ペプチド夏の勉強会
    • 発表場所
      大学セミナーハウス(東京都八王子市)
    • 年月日
      2016-08-01
  • [学会発表] Self-assembling supramolecular nanostructures created by de novo extender protein nano-building blocks2016

    • 著者名/発表者名
      Naoya Kobayashi, Kouichi Inano, Takaaki Sato, Keisuke Miyazawa, Takeshi Fukuma, Michael H. Hecht, Ryoichi Arai
    • 学会等名
      The 30th Anniversary Symposium of the Protein Society
    • 発表場所
      Hyatt Regency Baltimore, Baltimore, MD, USA
    • 年月日
      2016-07-17
    • 国際学会
  • [学会発表] Super WA20 (SUWA), an ultra-stabilized dimeric de novo protein for self-assembling protein nano-building blocks2016

    • 著者名/発表者名
      Naoya Kimura, Naoya Kobayashi, Ryoichi Arai
    • 学会等名
      The 30th Anniversary Symposium of the Protein Society
    • 発表場所
      Hyatt Regency Baltimore, Baltimore, MD, USA
    • 年月日
      2016-07-17
    • 国際学会
  • [学会発表] Self-assembling supramolecular nanostructures created from de novo protein nanobuilding blocks2016

    • 著者名/発表者名
      Naoya Kobayashi, Keiichi Yanase, Takaaki Sato, Satoru Unzai, Michael H. Hecht, Ryoichi Arai
    • 学会等名
      The 30th Anniversary Symposium of the Protein Society
    • 発表場所
      Hyatt Regency Baltimore, Baltimore, MD, USA
    • 年月日
      2016-07-16
    • 国際学会
  • [学会発表] Self-assembling supramolecular nanostructures created from de novo protein nanobuilding blocks2016

    • 著者名/発表者名
      小林直也、木村尚弥、新井亮一
    • 学会等名
      分子研研究会 超機能分子の創成
    • 発表場所
      岡崎コンファレンスセンター(愛知県岡崎市)
    • 年月日
      2016-06-28
    • 招待講演
  • [学会発表] ネオバイオ分子の構造機能解析及び設計基盤技術(X線結晶構造解析、タンパク質工学 編)2016

    • 著者名/発表者名
      新井亮一
    • 学会等名
      第5回ネオバイオ分子研究会
    • 発表場所
      鹿児島大学(鹿児島市)
    • 年月日
      2016-06-10
    • 招待講演
  • [学会発表] 人工蛋白質ナノブロック(PN-Block)による自己組織化ナノ構造創製:“ネオバイオ分子”創出へ向けて2016

    • 著者名/発表者名
      小林直也、木村尚弥、新井亮一
    • 学会等名
      第16回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      福岡国際会議場(福岡市)
    • 年月日
      2016-06-09
    • 招待講演
  • [学会発表] 人工蛋白質ナノブロックの設計開発による自己組織化超分子ナノ構造複合体の創出2016

    • 著者名/発表者名
      小林直也、新井亮一
    • 学会等名
      第16回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      福岡国際会議場(福岡市)
    • 年月日
      2016-06-08
    • 招待講演
  • [学会発表] 超安定化二量体人工蛋白質Super WA20 (SUWA)の安定化機構解析と蛋白質ナノブロックへの応用2016

    • 著者名/発表者名
      木村尚弥、小林直也、新井亮一
    • 学会等名
      第16回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      福岡国際会議場(福岡市)
    • 年月日
      2016-06-08
  • [学会発表] 抗オステオカルシンC 末端ペプチド抗体KTM219 Fab 断片のX 線結晶構造解析: Q-body 作動原理の理解へ向けて2016

    • 著者名/発表者名
      小松 美沙紀, 董 金華, 上田 宏, 新井亮一
    • 学会等名
      第16回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      福岡国際会議場(福岡市)
    • 年月日
      2016-06-07
  • [備考] 新井研究室ホームページ

    • URL

      http://fiber.shinshu-u.ac.jp/arai/index.html

  • [備考] 小林直也研究員が日本蛋白質科学会で若手奨励賞を受賞

    • URL

      http://www.shinshu-u.ac.jp/institution/iccer/topics/iccer/post-29.html

  • [備考] 木村尚弥さん (M2) が分子生物学会で優秀ポスター賞

    • URL

      http://www.shinshu-u.ac.jp/faculty/textiles/news/2016/12/76140.html

  • [備考] 繊維学部 新井亮一准教授らがまとめた、人工タンパク質超分子複合体構築に関する総説が掲載

    • URL

      http://www.shinshu-u.ac.jp/topics/2017/02/-current-opinion-in-biotechnology.html

  • [産業財産権] ドメインスワップ二量体人工タンパク質2016

    • 発明者名
      新井亮一,木村尚弥,小林直也
    • 権利者名
      信州大学
    • 産業財産権種類
      特許
    • 産業財産権番号
      特願2016-101203
    • 出願年月日
      2016-05-20

URL: 

公開日: 2018-01-16   更新日: 2022-01-28  

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