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2016 年度 実績報告書

細胞分裂の階層構造ダイナミクスの解明

公募研究

研究領域生命分子システムにおける動的秩序形成と高次機能発現
研究課題/領域番号 16H00783
研究機関立命館大学

研究代表者

松村 浩由  立命館大学, 生命科学部, 教授 (30324809)

研究期間 (年度) 2016-04-01 – 2018-03-31
キーワード細胞分裂 / 離合集散 / 動的秩序
研究実績の概要

細菌の細胞分裂において、FtsZは細胞膜の内側に沿ってGTP依存的にフィラメント構造を形成し、ダイナミックに離合集散を繰り返すことで、細胞膜の陥入を引き起こす。本研究では、「ダイナミックなFtsZの構造ゆらぎが、いかにして膜分裂の駆動力となるのか?」を分子レベルで解明し、細胞分裂の分子機構モデルを構築することを目的とする。
まず、新たな条件で黄色ブドウ球菌FtsZの結晶化・構造解析を行った。その結果、同一結晶の中に、FtsZは大きく立体構造の違う2種類で存在していることが分かった。結晶内のFtsZフィラメント構造から判断して、2種類の構造はそれぞれフィラメント構造を形成・解離する構造に相当することが予想された。さらにこの異なる立体構造が変換しうるのか、またどのように変換するかを予測する目的で分子動力学計算を行った。その結果、多段階で起きる構造遷移を捕らえることができた。さらにこの構造遷移で鍵となるアミノ酸を変異させると、GTPase活性がなくなり上述の構造変化も見られなくなった。これらの結果から、FtsZのフィラメント構造形成の分子モデルを構築して論文にまとめた。
さらに、MRSA FtsZの阻害剤開発にも取り組んだ。これまで開発されてきたMRSA FtsZ阻害剤は、耐性を獲得した変異体によってその薬効を消失させるが、最近その変異体に結合できる化合物を共同研究者であるラトガース大学のチームが開発した。その新規化合物と変異体との複合体の構造解析を行い、その結合構造を決定することができた。新規化合物は過去に報告された阻害剤と同じ結合ポケットに結合していたが、興味深いことにその結合構造は異なっていた。この成果によってFtsZの新たな創薬基盤を構築することができた。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

(1)FtsZの構造変換の分子メカニズム解明、(2)構造変換しにくい(または、しやすい)FtsZ変異体の作製とその構造機能解析、(3)FtsZの阻害剤開発 を目的として研究計画を立てていたが、(1)、(2)、(3)それぞれにおいて進展が見られ、(1)、(2)については、得られた成果を元に論文に纏めることができ、また(3)においても現在論文を投稿中である(Reviewer’s commentsでは3名のReviewer共にポジティブな意見)。よって、おおむね順調に進展していると考えている。

今後の研究の推進方策

上述の(1)、(2)を更に詳細に検証すべく、今後は高速AFMでの観察も行う予定である。これまでの予備実験で、MRSA FtsZが分子集合する様子を初めて捕らえることができた。今後は、これまで作製してきた変異体や、GDPを完全に除去したリフォールディングサンプルを用いて、詳細にフィラメント形成の速度論的解析を行う予定である。

  • 研究成果

    (13件)

すべて 2017 2016 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (6件) (うち国際共著 1件、 査読あり 6件、 謝辞記載あり 3件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (6件) (うち招待講演 4件)

  • [国際共同研究] ラトガース大学(米国)

    • 国名
      米国
    • 外国機関名
      ラトガース大学
  • [雑誌論文] Identification of the key interactions in structural transition pathway of FtsZ from Staphylococcus aureus2017

    • 著者名/発表者名
      J. Fujita, R. Harada, Y. Maeda, Y. Saito, E. Mizohata, T. Inoue, Y. Shigeta, H. Matsumura
    • 雑誌名

      J. Struct. Biol.

      巻: 198 ページ: 65-73

    • DOI

      10.1016/j.jsb.2017.04.008

    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] A RuBisCO-mediated carbon metabolic pathway in methanogenic archaea2017

    • 著者名/発表者名
      T. Kono, S. Mehrotra, C. Endo, N. Kizu, M. Matsuda, H. Kimura, E. Mizohata, T. Inoue, T. Hasunuma, A. Yokota, H. Matsumura, H. Ashida
    • 雑誌名

      Nature Commun.

      巻: 8 ページ: 14007

    • DOI

      10.1038/ncomms14007

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Functional role of the C-terminal amphipathic helix 8 of olfactory receptors and other G protein-coupled receptors2016

    • 著者名/発表者名
      T. Sato, T. Kawasaki, S. Mine, H. Matsumura
    • 雑誌名

      Int. J. Mol. Sci.

      巻: 17 ページ: 1930

    • DOI

      10.3390/ijms17111930

    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Promotion of protein crystal growth by actively switching crystal growth mode via femtosecond laser ablation2016

    • 著者名/発表者名
      Y. Tominaga, M. Maruyama, M. Yoshimura, H. Koizumi, M. Tachibana, S. Sugiyama, H. Adachi, K. Tsukamoto, H. Matsumura, K. Takano, S. Murakami, T. Inoue, H. Y. Yoshikawa, Y. Mori
    • 雑誌名

      Nature Photonics

      巻: 10 ページ: 723-726

    • DOI

      10.1038/nphoton.2016.202

    • 査読あり
  • [雑誌論文] A crystallization technique for obtaining large protein crystals with increased mechanical stability using agarose gel combined with a stirring technique2016

    • 著者名/発表者名
      M. Maruyama, Y. Hayashi, H. Y. Yoshikawa, S. Okada, H. Koizumi, M. Tachibana, S. Sugiyama, H. Adachi, H. Matsumura, T. Inoue, K. Takano, S. Murakami, M. Yoshimura, Y. Mori
    • 雑誌名

      J. Crystal Growth

      巻: 452 ページ: 172-178

    • DOI

      10.1016/j.jcrysgro.2015.11.008

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Molecular mechanism underlying promiscuous polyamine recognition by spermidine acetyltransferase2016

    • 著者名/発表者名
      S. Sugiyama, S. Ishikawa, H. Tomitori, M. Niiyama, M. Hirose, Y. Miyazaki, K. Higashi, M. Murata, H. Adachi, K. Takano, S. Murakami, T. Inoue, Y. Mori, K. Kashiwagi, K. Igarashi, H. Matsumura
    • 雑誌名

      Int. J. Biochem. Cell Biol.

      巻: 76 ページ: 87-97

    • DOI

      10.1016/j.biocel.2016.05.003

    • 査読あり
  • [学会発表] 細菌の細胞分裂タンパク質の動的秩序2017

    • 著者名/発表者名
      松村浩由
    • 学会等名
      日本蛋白質科学会
    • 発表場所
      宮城県仙台市仙台国際センター
    • 年月日
      2017-06-22
  • [学会発表] MRSA細胞分裂必須タンパク質の構造遷移2017

    • 著者名/発表者名
      松村浩由
    • 学会等名
      四私大合同生命科学シンポジウム
    • 発表場所
      兵庫県西宮市関学会館
    • 年月日
      2017-03-07
  • [学会発表] MRSAの細胞分裂をターゲットにした阻害剤開発2017

    • 著者名/発表者名
      松村浩由
    • 学会等名
      東京生化学研究会成果報告会
    • 発表場所
      東京都中央区野村コンファレンスプラザ日本橋
    • 年月日
      2017-03-03
    • 招待講演
  • [学会発表] タンパク質の離合集散が織りなす生命現象2017

    • 著者名/発表者名
      松村浩由
    • 学会等名
      自然科学カフェの集い
    • 発表場所
      東京都中央区銀座ルノアール貸会議室プラザ
    • 年月日
      2017-02-18
    • 招待講演
  • [学会発表] 創薬に貢献するタンパク質結晶化技術2017

    • 著者名/発表者名
      松村浩由
    • 学会等名
      メディカルジャパン
    • 発表場所
      大阪府大阪市住之江区インテックス大阪
    • 年月日
      2017-02-15
    • 招待講演
  • [学会発表] 離合集散する柔らかいタンパク質の構造機能解析光合成CO2固定回路と細胞分裂2016

    • 著者名/発表者名
      松村浩由
    • 学会等名
      X線の会
    • 発表場所
      大阪府吹田市大阪大学蛋白質研究所
    • 年月日
      2016-09-24
    • 招待講演

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公開日: 2018-01-16   更新日: 2022-01-28  

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