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2016 年度 実績報告書

X線溶液散乱と高速AFMを用いた生物時計因子の動的構造解析

公募研究

研究領域生命分子システムにおける動的秩序形成と高次機能発現
研究課題/領域番号 16H00785
研究機関分子科学研究所

研究代表者

秋山 修志  分子科学研究所, 協奏分子システム研究センター, 教授 (50391842)

研究期間 (年度) 2016-04-01 – 2018-03-31
キーワードX線小角散乱
研究実績の概要

本課題では、シアノバクテリア生物時計システムの中核をなす時計タンパク質(KaiC)を題材に、X線溶液散乱や液中高速AFMを用いて分子内対称性やその動態を精査することで、細胞システム全体に表出する動秩序の本質に迫る。
X線溶液散乱では分子の大きさ・形状を生理的な溶液環境下で検証することができ、とくに散乱角度が大きい領域(広角)には分子の形状に応じた特徴的な信号パターンが現れる。微弱な広角散乱信号を定量的に測定・解析するため、独自に装置や解析ソフトウェアを整備して実験を実施した。その結果、KaiC6量体の分子内対称性に起因した相関ピークが広角領域にまで複数観察された。KaiCの結晶構造に基づいた理論的な散乱曲線に比べると、一部、ピーク位置のシフト、幅広化、消失などが確認され、分子内対称性の一部が損なわれている可能性が示唆された。今後は、実験データを説明する分子モデルを構築することで、6量体の対称性について詳細に検証する。
液中高速AFMでは1分子ごとに動態を観察することができる。平成28年度の研究活動を通じて、KaiCを基盤上に固定化し、その機能や構造を著しく損なうことなく1分子イメージングが実施できるようになった。野生型KaiCを注意深く観察したところ、リング状構造の対称性が低下した6量体が存在していた。対称性の低下とATP加水分解の関係を検証するため、系に含まれるATP濃度を変化させた実験を実施中である。今後は、X線溶液散乱から示唆される6量体モデルとの対応関係について考察する。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

平成28年度の研究活動を通じて、KaiCを基盤上に固定化し、その機能や構造を著しく損なうことなく1分子イメージングが実施できるようになった。野生型KaiCを注意深く観察したところ、リング状構造の対称性が異なる6量体が存在することが明らかとなった。X線溶液散乱については、広角散乱を取得するための装置や解析ソフトウェアを整備した。

今後の研究の推進方策

平成29年度は、溶媒条件や温度を変えた液中高速AFM観察を実施し、6量体内の対称性が変化する時間スケールについても検証する。X線溶液散乱については、観察されたピーク位置・強度を説明するような6量体モデルを構築し、同時に、液中高速AFMのデータとの対応関係について考察する。

  • 研究成果

    (8件)

すべて 2017 2016

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 2件、 オープンアクセス 3件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (5件) (うち国際学会 3件、 招待講演 5件)

  • [雑誌論文] Accelerating in vitro studies on circadian clock systems using an automated sampling device2016

    • 著者名/発表者名
      Furuike Y, Abe J, Mukaiyama A, Akiyama S
    • 雑誌名

      Biophysics and Physicobiology

      巻: 13 ページ: 235-241

    • DOI

      10.2142/biophysico.13.0_235

    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Absolute slowness encoded in the circadian clock protein KaiC2016

    • 著者名/発表者名
      Abe J, Mukaiyama A, Akiyama S
    • 雑誌名

      SPring-8/SACLA Research Frontiers 2015

      巻: - ページ: 24-25

    • オープンアクセス
  • [雑誌論文] 概日時計因子の構造や動態を調べる意義とは?2016

    • 著者名/発表者名
      秋山 修志
    • 雑誌名

      生物物理

      巻: 56 ページ: 266-270

    • DOI

      10.2142/biophys.56.266

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] Biological X-ray Solution Scattering Activities at the Institute for Molecular Science2017

    • 著者名/発表者名
      Akiyama S
    • 学会等名
      Okazaki Conference 2017 on Grand Challenges in Small-angle Scattering
    • 発表場所
      岡崎コンファレンスセンター(愛知県岡崎市)
    • 年月日
      2017-03-19 – 2017-03-19
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Atomic-scale origins of slowness and temperature compensation in KaiC2017

    • 著者名/発表者名
      Akiyama S
    • 学会等名
      Circadian Clock of Cyanobacteria during 1991-2017
    • 発表場所
      名古屋大学坂田・平田ホール(愛知県名古屋市)
    • 年月日
      2017-03-12 – 2017-03-12
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 生物の不思議 ~ 体内時計2017

    • 著者名/発表者名
      秋山 修志
    • 学会等名
      日本放射光学会市民公開講座
    • 発表場所
      神戸芸術センター(兵庫県神戸市)
    • 年月日
      2017-01-08 – 2017-01-08
    • 招待講演
  • [学会発表] Cyanobacterial circadian clock system. How and why can it be so slow and stable?2016

    • 著者名/発表者名
      Akiyama S
    • 学会等名
      Sapporo Symposium on Biological Rhythm
    • 発表場所
      京王ホテルプラザ札幌(北海道札幌市)
    • 年月日
      2016-11-10 – 2016-11-10
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 生体分子システム研究に必要なツールとは?2016

    • 著者名/発表者名
      秋山 修志
    • 学会等名
      中性子生命科学研究会 「生命科学における中性子利用の現状と未来」
    • 発表場所
      IQBRC1階大会議室(茨城県那珂郡)
    • 年月日
      2016-05-17 – 2016-05-17
    • 招待講演

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公開日: 2018-01-16  

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