| 研究領域 | 生物合成系の再設計による複雑骨格機能分子の革新的創成科学 |
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| 研究課題/領域番号 |
17H05450
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| 研究機関 | 慶應義塾大学 |
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研究代表者 |
末永 聖武 慶應義塾大学, 理工学部(矢上), 教授 (60273215)
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| 研究期間 (年度) |
2017-04-01 – 2019-03-31
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| キーワード | リポペプチド / ミンアミドA / 立体化学 / 生合成機構 / 生合成遺伝子 / ゲノムDNA |
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| 研究実績の概要 |
未決定であったミンナミドA脂肪酸部の立体構造決定を行った。ミンナミドAの部分酸加水分解により得られた脂肪酸部を穏やかに酸処理したところ、３位水酸基が脱水してα,β-不飽和エステルが生成し、７位水酸基が1,4-付加して生じたと考えられる環状エーテルが得られた。脂肪酸部にまた１当量の塩化メシルを反応させたところ、15位の水酸基がメシル化され１１位水酸基から閉環して生成したと考えられる環状エーテルが得られた。両者について、1H NMRの結合定数とNOESY相関の解析により、２個の２級メチル基の立体化学を決定した。残る９位メチル基を決定するため、脂肪酸部の９位に関する可能な２種のジアステレオマーの合成を行っている。
ミンナミドを産生するシアノバクテリアOkeania hirsutaの実験室における培養を検討するため必要な生のシアノバクテリアを採集するため、これまでに沖縄県水納島へ２回出かけたが、目的のシアノバクテリアを見つけることができなかった。
また、同じユレモ科のシアノバクテリア (Moorea bouillonii)を用いて、ゲノム抽出法の検討を行った。液体窒素下、凍結粉砕処理をすることで鞘と藻体をある程度分離することができ、抽出操作中に遠心操作を複数回組み入れることで、鞘をペレットとして除去できることを見出した。得られた gDNA に対し、universal primer を用いた 16S rDNA 領域の PCR による増幅と、つづくシークエンシング、 BLAST 解析を行った結果、本手法によって得られた gDNA が Moorea bouillonii 由来のものであることを支持する結果を得た。今後、Okeania hirsutaについてgDNA抽出を行ない、質および量ともに十分なgDNAが得られたら、次世代シークエンサーによる網羅的配列解析を行う予定である。
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
3: やや遅れている
理由
ミンナミドを産生するシアノバクテリアOkeania hirsutaを採集することができず、培養が検討できていない。現在保管してあるサンプルが少量であるため、同じユレモ科のシアノバクテリアでゲノムDNAの抽出法を検討していた。方法は確立したので、Okeania hirsutaのゲノム抽出を行い、配列解析と生合成遺伝子の探索を進めていく。
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| 今後の研究の推進方策 |
ミンナミドAの未決定の１個のメチル基の立体化学は可能な２種のジアステレオマーを合成し、早急に決定する。シアノバクテリアのゲノム抽出法は確立できたので、これを保管してあったOkeania hirsutaに適用し、次世代シークエンサーによる網羅的配列解析と生合成遺伝子の探索を進めていく。また、他の生物活性物質を産生するシアノバクテリアのゲノム抽出と配列解析についても検討したい。
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