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2020 年度 実績報告書

立体構造を基盤にした生合成酵素の探索ならびに機能の解析と改変の新展開

公募研究

研究領域生物合成系の再設計による複雑骨格機能分子の革新的創成科学
研究課題/領域番号 19H04652
研究機関京都大学

研究代表者

藤橋 雅宏  京都大学, 理学研究科, 助教 (10397581)

研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2021-03-31
キーワード結晶構造解析
研究実績の概要

2つの酵素を対象に、立体構造を基盤として酵素のテーラーメード改良と未発見酵素の探索を行い、天然に無い化合物を含む狙った化合物を合成する酵素の取得を目指した。具体的には、(i) ピロリン酸(PPi)依存性リン酸化酵素のリン酸基受容体の改変、(ii) データベース登録済みの立体構造情報を基にした未発見PPi利用酵素の効率的な探索、(iii) C25以上のテルペン類を合成する酵素の反応機構の詳細な解析と機能の改変、に挑戦した。
研究目標 (i)のPPi依存性リン酸化酵素 (PPi-kinase) のリン酸基受容体の改変については、PPi依存性でイノシトールの1位をリン酸化する酵素 (PPi-Ins1K) のイノシトール認識部位に、ATP依存性でイノシトールの3位をリン酸化する酵素 (ATP-Ins3K) のイノシトール認識残基を導入することで、PPi依存性でイノシトールの3位をリン酸化する酵素 (PPi-Ins3K) の構築に成功した。この成果は最近ACS Chem Biol誌に発表した。
研究目標 (ii)のデータベース登録済みの立体構造情報を基にした未発見PPi利用酵素の効率的な探索については、現在は機能未知酵素として登録されている2つの酵素が、PPiを用いて基質Xをリン酸化する酵素であることを確かめた。基質Xをリン酸化するPPi-kinaseは、これまでに発見されていない。
研究目標 (iii) のC25以上のテルペン類を合成する酵素の反応機構の詳細な解析と機能の改変については、Bacillus alcalophilus 由来のClass IB型Large-terpene synthase (Bal-TS)について、活性に必要な金属イオンを含む基質結合型の結晶構造を決定した。これにより基質prenyl二リン酸のリン酸基並びに疎水性鎖の認識機構が明らかになった。

現在までの達成度 (段落)

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

  • 研究成果

    (6件)

すべて 2021 2020

すべて 雑誌論文 (1件) 学会発表 (5件) (うち招待講演 1件)

  • [雑誌論文] Altering the phosphorylation position of pyrophosphate-dependent myo-inositol-1-kinase based on its crystal structure2021

    • 著者名/発表者名
      Tashiro, R., Sato, T., Atomi, H., Miki, K., Fujihashi, M.
    • 雑誌名

      ACS Chem. Biol.

      巻: in press ページ: -

    • DOI

      10.1021/acschembio.0c00733

  • [学会発表] Class IB大型テルペン合成酵素の基質-金属イオン複合体の結晶構造解析2021

    • 著者名/発表者名
      金本壮平, 佐藤努, 品田哲朗, 三木邦夫, 深井周也, 藤橋雅宏
    • 学会等名
      2020年度量子ビームサイエンスフェスタ
  • [学会発表] クラスIB大型テルペン合成酵素の基質複合体の結晶構造解析2020

    • 著者名/発表者名
      金本壮平, 佐藤努, 品田哲朗, 三木邦夫, 深井周也, 藤橋雅宏
    • 学会等名
      第30回イソプレノイド研究会
  • [学会発表] クラスⅠ Bテルペン合成酵素の諸性質解析、マイナー生物同定および環化に重要な残基の特定2020

    • 著者名/発表者名
      浅田和也, Rafaella Stepanova, 菅原啓, 西智之, 上田大次郎, 稲木隼人, 三木邦夫, 藤橋雅宏, 保野陽子, 品田哲郎, 佐藤 努
    • 学会等名
      香料・テルペンおよび精油化学に関する討論会
  • [学会発表] 全自動とリモートでのデータ収集を通したリン位置同定の試み2020

    • 著者名/発表者名
      藤橋雅宏
    • 学会等名
      第5回タンパク質結晶構造解析中級者向け講習会
    • 招待講演
  • [学会発表] クラスIB大型テルペン合成酵素の基質複合体の結晶構造2020

    • 著者名/発表者名
      金本壮平, 佐藤努, 品田哲朗, 三木邦夫, 深井周也, 藤橋雅宏
    • 学会等名
      日本結晶学会 令和2年度年会

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公開日: 2021-12-27  

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