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2019 年度 実績報告書

周囲の環境に応じた感染細胞の運命決定機構の解明

公募研究

研究領域ネオウイルス学:生命源流から超個体、そしてエコ・スフィアーへ
研究課題/領域番号 19H04829
研究機関名古屋大学

研究代表者

佐藤 好隆  名古屋大学, 医学系研究科, 助教 (40754940)

研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2021-03-31
キーワードEBV / ウイルス感染 / ネオウイルス学 / 数理科学的解析
研究実績の概要

ウイルスは効率よく子孫ウイルスを標的細胞に感染させるため、宿主に寄り添って(寄り添うフリをして)、感染に有利な環境になるのを宿主内でじっと待つ(潜伏感染)。そして、宿主を裏切り、ウイルス粒子の産生(溶解感染)を起こす。
全人口の90%以上が感染しているEpstein-Barrウイルス(EBV)を主な研究対象として、周囲の環境が感染細胞の運命決定(潜伏感染を継続するか溶解感染へ移行するかなど)に、どのような影響を及ぼすかを解析することを目的に本研究計画を進めた。
RNAseq解析により、EBVの感染初期にウイルス産生に関わる遺伝子群が発現していることが示唆された。しかし、RNAseqは集団での遺伝子発現を捉えるスナップショットに過ぎず、時間分解能が弱いという欠点がある。そこで、組換えウイルスを用いたFate mappingにより、直接的に感染細胞の運命を追えるシステムを開発した。本システムにより、EBVの感染初期にウイルス産生に関わる遺伝子群が発現していることを証明した。さらに、EBV感染のダイナミクスを経時的に追い、EBV感染の広がりを数理モデル化した。本研究で樹立した数理モデルにより、EBV感染の初期ではウイルス粒子産生は起きていないことが改めて確認された。以上より、EBV感染の初期では不完全なウイルス産生感染(abortive lytic infection)をいう中間状態を経由して、潜伏感染の成立に至ることが実証された。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

組換えEBVを使用したFate mappingにより、EBV感染の初期では不完全なウイルス産生感染(abortive lytic infection)をいう中間状態を経由して、潜伏感染の成立に至ることが実証できた。また、EBV感染の広がりを数式で記述することも達成できた。以上の結果は、論文としてまとめて、現在投稿中である。総じて、概ねに計画は進展していると考える。
一方で、コロナウイルス感染症の影響でウイルス感染細胞の周囲の環境に関するメタボローム解析には遅れが生じはじめており、今後対策を考えていく。

今後の研究の推進方策

周囲の影響がウイルス感染に与える影響のフェノタイプは捉えつつある。次年度は、このフェノタイプの責任分子の同定を精力的に進めていきたい。メタボローム解析は新型コロナウイルス感染症の拡大を受けて、共同研究先の人員確保困難で遅れがでている。周囲の影響がウイルス感染に与える影響のフェノタイプを司る分子の同定は薬剤スクリーニングなど別の方法で探索することも模索していきたい。さらに、本研究課題を進めて行く中で想起した環境を介した異種ウイルス間の相互作用についても、本研究課題を発展させながら解析を進めていこうと考えている。領域内の研究者と密に連絡・連携を取りながら、研究を進展させていきたい。

  • 研究成果

    (23件)

すべて 2020 2019 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (5件) (うち査読あり 4件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (17件) (うち国際学会 1件、 招待講演 1件)

  • [国際共同研究] ハーバード大学(米国)

    • 国名
      米国
    • 外国機関名
      ハーバード大学
  • [雑誌論文] Oncogenesis of CAEBV revealed: Intragenic deletions in the viral genome and leaky expression of lytic genes2020

    • 著者名/発表者名
      Murata T, Okuno Y, Sato Y, Watanabe T, Kimura H
    • 雑誌名

      Reviews in Medical Virology

      巻: - ページ: e2095

    • DOI

      10.1002/rmv.2095

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Antitumor activity of cyclin-dependent kinase inhibitor alsterpaullone in Epstein-Barr virus-associated lymphoproliferative disorders2020

    • 著者名/発表者名
      Watanabe T, Sato Y, Masud HMAA, Takayama M, Matsuda H, Hara Y, Yanagi Y, Yoshida M, Goshima F, Murata T, Kimura H
    • 雑誌名

      Cancer Science

      巻: 111 ページ: 279-287

    • DOI

      10.1111/cas.14241

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] ウイルス遺伝子発現制御機構に基づいた抗Epstein-Barrウイルス薬の探索2019

    • 著者名/発表者名
      佐藤好隆, 渡辺崇広, 木村宏
    • 雑誌名

      臨床とウイルス

      巻: 47 ページ: 326-332

  • [雑誌論文] Epstein-Barr Virus BBRF2 Is Required for Maximum Infectivity2019

    • 著者名/発表者名
      Masud HMAA, Yanagi Y, Watanabe T, Sato Y, Kimura H, Murata T
    • 雑誌名

      Microorganisms

      巻: 7 ページ: E705

    • DOI

      10.3390/microorganisms7120705

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] The BOLF1 gene is necessary for effective Epstein-Barr viral infectivity2019

    • 著者名/発表者名
      Masud HMAA, Watanabe T, Sato Y, Goshima F, Kimura H, Murata T
    • 雑誌名

      Virology

      巻: 531 ページ: 114-125

    • DOI

      10.1016/j.virol.2019.02.015

    • 査読あり
  • [学会発表] Genome analysis of chronic active Epstein-Barr virus infection2019

    • 著者名/発表者名
      Takayuki Murata, Yusuke Okuno, Yoshitaka Sato, Takahiro Watanabe, Hiroshi Kimura
    • 学会等名
      The 18th Awaji International Forum on Infection and Immunity
    • 国際学会
  • [学会発表] Dynamic changes in the cellular environment during Epstein-Barr virus productive replication2019

    • 著者名/発表者名
      佐藤好隆
    • 学会等名
      第67回日本ウイルス学会学術集会
    • 招待講演
  • [学会発表] Exosomal transfer of viral proteins enhances Epstein-Barr virus infection2019

    • 著者名/発表者名
      佐藤好隆、村田貴之、五島典、渡辺崇広、木村宏
    • 学会等名
      第67回日本ウイルス学会学術集会
  • [学会発表] Dissecting the molecular pathogenicity of EBV-associated NK-cell lymphoma by reprogramming/differentiation approach2019

    • 著者名/発表者名
      稲垣知希、佐藤好隆、村田貴之、渡辺崇広、五島典、木村宏
    • 学会等名
      第67回日本ウイルス学会学術集会
  • [学会発表] Stress conditions promote cell-free infection of Epstein-Barr virus2019

    • 著者名/発表者名
      高木舜晟、佐藤好隆、佐藤佳、木村宏、岩見真吾
    • 学会等名
      第67回日本ウイルス学会学術集会
  • [学会発表] Role of Epstein-Barr virus C promoter deletion in B cell transformation2019

    • 著者名/発表者名
      村田貴之、肘岡史也、渡辺崇広、奥野友介、H. M. Abdullah Al Masud、柳裕介、佐藤好隆、五島典、木村宏
    • 学会等名
      第67回日本ウイルス学会学術集会
  • [学会発表] The Epstein-Barr virus BLRF2 gene product is involved in viral progeny production2019

    • 著者名/発表者名
      原優矢、渡辺崇広、村田貴之、H. M. Abdullah Al Masud、柳裕介、佐藤好隆、五島典、木村宏
    • 学会等名
      第67回日本ウイルス学会学術集会
  • [学会発表] EBV tegument protein BSRF1 contributes to progeny virus production2019

    • 著者名/発表者名
      柳裕介、村田貴之、渡辺崇広、H. M. Abdullah Al Masud、佐藤好隆、五島典、木村宏
    • 学会等名
      第67回日本ウイルス学会学術集会
  • [学会発表] Identifying host factors for HSV ionfection by genome-wide CRISPR screen2019

    • 著者名/発表者名
      鈴木健史、佐藤好隆、奥野友介、五島典、村田貴之、渡辺崇広、木村宏
    • 学会等名
      第67回日本ウイルス学会学術集会
  • [学会発表] Induction of antitumor immunity of oncolytic HSV-1 HF10 for metastatic breast cancer2019

    • 著者名/発表者名
      五島典、江崎伸一、高野学、渡辺崇広、佐藤好隆、村田貴之、西山幸廣、木村宏
    • 学会等名
      第67回日本ウイルス学会学術集会
  • [学会発表] The efficacy of oncolytic HSV-1 HF10 for head and neck carcinoma mouse model2019

    • 著者名/発表者名
      高野学、江崎伸一、五島典、渡辺崇広、佐藤好隆、村田貴之、西山幸廣、木村宏
    • 学会等名
      第67回日本ウイルス学会学術集会
  • [学会発表] CDK inhibitors that control late gene transcription of Epstein-Barr virus also suppress the transcription of HCMV2019

    • 著者名/発表者名
      梅田実希、佐藤好隆、木村宏、大黒徹
    • 学会等名
      第67回日本ウイルス学会学術集会
  • [学会発表] ウイルス感染細胞から放出される内因性微粒子によるウイルス感染の促進2019

    • 著者名/発表者名
      矢口正宏、佐藤好隆、村田貴之、渡辺崇広、五島典、木村宏
    • 学会等名
      第16回EBウイルス研究会
  • [学会発表] CRISPR screenを用いたHSV-1感染に必要な宿主因子の網羅的解析2019

    • 著者名/発表者名
      鈴木健史、佐藤好隆、奥野友介、渡辺崇広、五島典、木村宏
    • 学会等名
      第33回ヘルペスウイルス研究会
  • [学会発表] iPS細胞を用いたEBV関連NK細胞性腫瘍の病態解明2019

    • 著者名/発表者名
      稲垣知希、佐藤好隆、村田貴之、五島典、渡辺崇広、堀田秋津、木村宏
    • 学会等名
      第33回ヘルペスウイルス研究会
  • [学会発表] Epstein-Barrウイルスの再活性化に関わる分子基盤に迫るCRISPRスクリーニング2019

    • 著者名/発表者名
      佐藤好隆、稲垣知希、奥野友介、鈴木健史、村田貴之、H. M. Abdullah Al Masud、渡辺崇広、五島典、木村宏
    • 学会等名
      第33回ヘルペスウイルス研究会
  • [学会発表] ウイルス遺伝子発現制御機構に基づいた抗Epstein-Barrウイルス薬の探索2019

    • 著者名/発表者名
      佐藤好隆、渡辺崇広、木村宏
    • 学会等名
      第60回臨床ウイルス学会

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公開日: 2021-01-27  

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