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2020 年度 実績報告書

TRIM型ユビキチンリガーゼの物性と動作原理の解析

公募研究

研究領域ケモテクノロジーが拓くユビキチンニューフロンティア
研究課題/領域番号 19H05280
研究機関北海道大学

研究代表者

畠山 鎮次  北海道大学, 医学研究院, 教授 (70294973)

研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2021-03-31
キーワードユビキチン / TRIMタンパク質 / 質量分析 / 構造解析 / ストレス
研究実績の概要

ユビキチン化はタンパク質分解を制御する翻訳後修飾であり、多くの生命現象を支える極めて重要な翻訳後修飾の一つである。TRIMファミリーはRING型E3ユビキチンリガーゼの一つのファミリー(ヒトでは約70種)であり、様々な機能(がん、免疫、オートファジーなど)に関与することが知られている。本研究目的は、E3ユビキチンリガーゼであるTRIMタンパク質の「タンパク質」としての物理化学的な性質(物性)を解析し、将来的には創薬研究への知見を集積することである。実際に、TRIMタンパク質の機能を解明するために、基質タンパク質とユビキチンデコーダータンパク質を同定することと、およびTRIMタンパク質の構造を
決定することが重要となる。本年度は、シグナル伝達・選択的オートファジー・DNA修復・等に関与すると考えられているTRIMタンパク質を中心に、質量分析器(Hybrid IonTrap-Orbitrap LC-MS)を使用し、ユビキチン化基質タンパク質の同定を試み、複数のTRIMタンパク質に関して、基質タンパク質候補が同定された。
また、クライオ電顕によってTRIM68の構造解析を行ったところ、コイルドコイルドメインで折れ曲がる構造をしていることが判明し、それが酵素活性において何らかの役割を果たしている可能性が示唆された。
さらに、温度変化などのストレスによってもたらされる物性変化で、どのようにユビキチンリガーゼの酵素活性が影響を受けるかを明らかにするために、ストレス関連E3ユビキチンリガーゼであるCHIPを用いて解析したところ、ヒトの体温である37度周辺に至適温度があり、許容範囲が狭いことが判明した。今後、ストレスに反応して機能すべきユビキチン化酵素が、生体において、いかに温度変化等に対応して機能しているかを明らかにすることが重要である。

現在までの達成度 (段落)

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

  • 研究成果

    (6件)

すべて 2021 2020

すべて 雑誌論文 (6件) (うち国際共著 1件、 査読あり 6件、 オープンアクセス 2件)

  • [雑誌論文] Role of intracellular zinc in molecular and cellular function in allergic inflammatory diseases2021

    • 著者名/発表者名
      Suzuki Masanobu、Suzuki Takayoshi、Watanabe Masashi、Hatakeyama Shigetsugu、Kimura Shogo、Nakazono Akira、Honma Aya、Nakamaru Yuji、Vreugde Sarah、Homma Akihiro
    • 雑誌名

      Allergology International

      巻: 70 ページ: 190~200

    • DOI

      10.1016/j.alit.2020.09.007

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Autophagy promotes citrullination of VIM (vimentin) and its interaction with major histocompatibility complex class II in synovial fibroblasts2020

    • 著者名/発表者名
      Sugawara Eri、Kato Masaru、Kudo Yuki、Lee Wenshi、Hisada Ryo、Fujieda Yuichiro、Oku Kenji、Bohgaki Toshiyuki、Amengual Olga、Yasuda Shinsuke、Onodera Tomohiro、Hatakeyama Shigetsugu、Atsumi Tatsuya
    • 雑誌名

      Autophagy

      巻: 16 ページ: 946~955

    • DOI

      10.1080/15548627.2019.1664144

    • 査読あり
  • [雑誌論文] The role of Mediator and Little Elongation Complex in transcription termination2020

    • 著者名/発表者名
      Takahashi Hidehisa、Ranjan Amol、Chen Shiyuan、Suzuki Hidefumi、Shibata Mio、Hirose Tomonori、Hirose Hiroko、Sasaki Kazunori、Abe Ryota、Chen Kai、He Yanfeng、Zhang Ying、Takigawa Ichigaku、Tsukiyama Tadasuke、Watanabe Masashi、Fujii Satoshi、Iida Midori、Yamamoto Junichi、Yamaguchi Yuki、Hatakeyama Shigetsugu, et al.
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 11 ページ: 1063

    • DOI

      10.1038/s41467-020-14849-1

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] NONO Is a Negative Regulator of SOX2 Promoter2020

    • 著者名/発表者名
      LIANG SHANSHAN、TAKAHASHI HIDEHISA、HIROSE TETSURO、KURAMITSU YASUHIRO、HATAKEYAMA SHIGETSUGU、YOSHIYAMA HIRONORI、WANG RUOYU、HAMADA JUN-ICHI、IIZASA HISASHI
    • 雑誌名

      Cancer Genomics - Proteomics

      巻: 17 ページ: 359~367

    • DOI

      10.21873/cgp.20195

    • 査読あり
  • [雑誌論文] RNA Sensing by Gut Piezo1 Is Essential for Systemic Serotonin Synthesis2020

    • 著者名/発表者名
      Sugisawa Erika、Takayama Yasunori、Takemura Naoki、Kondo Takeshi、Hatakeyama Shigetsugu、Kumagai Yutaro、Sunagawa Masataka、Tominaga Makoto、Maruyama Kenta
    • 雑誌名

      Cell

      巻: 182 ページ: 609~624.e21

    • DOI

      10.1016/j.cell.2020.06.022

    • 査読あり
  • [雑誌論文] A substrate-trapping strategy to find E3 ubiquitin ligase substrates identifies Parkin and TRIM28 targets2020

    • 著者名/発表者名
      Watanabe Masashi、Saeki Yasushi、Takahashi Hidehisa、Ohtake Fumiaki、Yoshida Yukiko、Kasuga Yusuke、Kondo Takeshi、Yaguchi Hiroaki、Suzuki Masanobu、Ishida Hiroki、Tanaka Keiji、Hatakeyama Shigetsugu
    • 雑誌名

      Communications Biology

      巻: 3 ページ: 592

    • DOI

      10.1038/s42003-020-01328-y

    • 査読あり / オープンアクセス

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公開日: 2021-12-27  

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