| 研究領域 | ゲノム配列を核としたヤポネシア人の起源と成立の解明 |
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| 研究課題/領域番号 |
19H05342
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| 研究機関 | 東京大学 |
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研究代表者 |
中山 一大 東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 准教授 (90433581)
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| 研究期間 (年度) |
2019-04-01 – 2021-03-31
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| キーワード | 褐色脂肪組織 / 寒冷適応 / ヒトゲノム多様性 |
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| 研究実績の概要 |
北海道在住の成人352名を対象として、放射性フッ素同位体標識グルコース投与とPET-CTによる褐色脂肪組織活性の測定実験を実施し、同時に口腔スワブ由来のゲノムDNAを収集した。Axiom Japonica Arrayで約66万のSNPの遺伝型判定を実施後、インピュテーションを実施し、全ゲノム規模でのSNPと小規模な挿入・欠失多型を含むsmall nucleotide variant:（SNV）の遺伝型データを取得した。クオリティ・コントロール後の約570万のSNVを用いてゲノムワイド関連解析研究（Genome wide association study：GWAS)を実施した。なお、GWASでは被検者の性別と年齢を共変量として投入した。このGWASの結果、12番染色体長腕領域にゲノムワイドな有意水準であるP < 5×10-8を記録したSNVが複数検出された。最も低いP値が記録されたSNVは、TGジヌクレオチドリピートからなる繰り返し多型で、被検者集団の中に繰り返し数が14、15、および16の少なくとも3つのアレルが存在しており、14回繰り返しアレルの保有者が褐色脂肪組織活性が低い傾向があった。その他にも、複数のゲノム領域に渡ってGWASにおいてsuggestive associationと捉えられるP<1E-5をクリアするSNVsが同定され、その中には、褐色脂肪組織の分化や機能に重要な役割を果たすことがすでに報告されている遺伝子の近傍に存在するものもあった。
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
2: おおむね順調に進展している
理由
期間延長により当初の目的を達成することができた。
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| 今後の研究の推進方策 |
前年度までのゲノムワイド関連解析研究で同定された褐色脂肪組織活性関連多型について、九州大学で実施した寒冷曝露実験コホートを対象に遺伝型判定を実施し、寒冷曝露下での体温変化・酸素消費量等との関連の有無を検証する。また、これらの多型周辺のゲノム領域の進化パターンを解析することにより、自然選択が関与等の検証を実施する予定である。
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