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2020 年度 実績報告書

日本犬の成立に寄与したニホンオオカミのゲノム領域の解明

公募研究

研究領域ゲノム配列を核としたヤポネシア人の起源と成立の解明
研究課題/領域番号 19H05343
研究機関総合研究大学院大学

研究代表者

寺井 洋平  総合研究大学院大学, 先導科学研究科, 助教 (30432016)

研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2021-03-31
キーワードニホンオオカミ / 日本犬 / 古代ゲノム / 島嶼適応 / 交雑
研究実績の概要

これまでのミトコンドリアDNA全長配列の研究から、ニホンオオカミは他のハイイロオオカミから遺伝的に離れた古い系統であること、またニホンオオカミと日本犬は過去に交雑を起こして来たことが明らかになっている。このことから、ミトコンドリアDNAだけでなく、日本犬の核ゲノムにもニホンオオカミ由来のゲノムが浸透していると予想される。そこで本研究では、日本犬ゲノム中に存在するニホンオオカミ由来のゲノム領域とその役割から、日本犬の成立を明らかにしようとしている。
これまでの研究でニホンオオカミ9個体(ヤマイヌ1個体を含む)、秋田犬3個体、柴犬6個体、紀州犬2個体、北海道犬、四国犬、甲斐犬、琉球犬それぞれ1個体のゲノムDNA配列を決定した。それを解析することにより次のことが明らかになった。1) 北海道を除く日本列島には、ニホンオオカミとヤマイヌが生息しており、現在ニホンオオカミのタイプ標本(オランダ・ライデン博物館)とされている3個体のうち、1個体だけがニホンオオカミであり、1個体はニホンオオカミとイヌの交雑個体のヤマイヌであった。2) ハイイロオオカミ亜種の中でニホンオオカミは、遺伝的にハイイロオオカミとイヌから大きく離れており、独立した亜種であった。3) ニホンオオカミの中に集団構造があり、四国由来の大型のニホンオオカミの個体は古い系統の可能性が高い。4) 過去の交雑により、日本犬の犬種のゲノムにはニホンオオカミ由来のゲノムDNAが含まれていた。5) イヌの古い系統で過去にニホンオオカミとの交雑があり、その系統の子孫は日本列島、インドネシアの島嶼部、オーストラリアなどに生き残っていることが明らかになった。また、日本犬だけの祖先でもさらにニホンオオカミと交雑があったと推測された。

現在までの達成度 (段落)

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

  • 研究成果

    (8件)

すべて 2021 2020 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (4件) (うち国際学会 1件、 招待講演 2件) 備考 (1件)

  • [国際共同研究] IPB University(インドネシア)

    • 国名
      インドネシア
    • 外国機関名
      IPB University
  • [雑誌論文] オオカミやヤマイヌと呼ばれたシーボルトが残した二ホンオオカミ標本の謎2021

    • 著者名/発表者名
      石黒直隆、松村秀一、寺井洋平、本郷一美
    • 雑誌名

      Journal of the Japan Veterinary Medical Association

      巻: in press ページ: in press

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Analysis of the Mitochondrial Genomes of Japanese Wolf Specimens in the Siebold Collection, Leiden2020

    • 著者名/発表者名
      Matsumura Shuichi、Terai Yohey、Hongo Hitomi、Ishiguro Naotaka
    • 雑誌名

      Zoological Science

      巻: 38 ページ: 60-66

    • DOI

      10.2108/zs200019

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 日本犬に近縁な犬種は、遠く離れて生き残っていた2021

    • 著者名/発表者名
      寺井洋平
    • 学会等名
      第二回くにうみミーティング
  • [学会発表] 日本犬の成立に寄与したニホンオオカミのゲノム領域2020

    • 著者名/発表者名
      寺井洋平、五條堀淳、本郷一美、松村秀一、石黒直隆
    • 学会等名
      日本進化学会 第22回大会
  • [学会発表] Evolutionary relationship between Japanese and Indonesian dogs2020

    • 著者名/発表者名
      Yohey Terai
    • 学会等名
      Workshop on Whole Genome Sequencing
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] ニホンオオカミとの交雑を経た日本犬の成立2020

    • 著者名/発表者名
      寺井洋平
    • 学会等名
      遺伝研研究会 コンパニオンアニマルのゲノム医療
    • 招待講演
  • [備考] 種分化と適応の機構の研究の紹介

    • URL

      http://adaptive-speciation.com/

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公開日: 2021-12-27  

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