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2020 年度 実績報告書

Y染色体からみたヤポネシア男性の起源・成立の解明

公募研究

研究領域ゲノム配列を核としたヤポネシア人の起源と成立の解明
研究課題/領域番号 19H05346
研究機関徳島大学

研究代表者

佐藤 陽一  徳島大学, 大学院医歯薬学研究部(薬学域), 教授 (10363160)

研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2021-03-31
キーワードY染色体 / ハプログループ
研究実績の概要

現代日本人のY染色体ハプログループ解析及びY染色体ハプログループとY染色体構造解析によるY染色体の進化について解析することで、ヤポネシア男性が辿ってきた道筋を明らかにすることを目的とし、以下の研究を行った。
1)現代日本人のY染色体ハプログループ解析:日本人男性106サンプルについてY染色体ハプログループの更新を行った。旧C1はC1a1a1に、旧C3はC2b1aの下流の5グループ及びC2b1bの下流の2グループに分類された。旧D2*はD1a2a1cの下流の7グループ及びD1a2a2の下流の4グループに分類された。旧D2a1はD1a2a2aの下流の8グループに分類された。旧O2b*は4グループに、旧O2b1は5グループに分類された。また、旧O3a3cは4グループに、旧O3a4は3グループに分類された。
2)Y染色体ハプログループとY染色体構造解析によるY染色体の進化:日本人において比較的頻度が高いY染色体ハプログループD1a2、C、O1b2、O2a2b1、O2a1bは例外があるものの同一の構造パターンを示したことから、それぞれ共通の先祖から由来していると考えられる。一方、頻度が低いK、O1a、O1b1a1a1、O2は多数の構造パターンを示したことから、それぞれ異なった先祖由来であり比較的最近日本に流入したと示唆される。
3)Y染色体ハプログループと全ゲノム解析によるクラスター分類:811人のヤポネシア男性について、SNPアレイを用いて全ゲノムジェノタイピングを行った。得られたデータを使用してY染色体ハプログループ間で主成分分析を行ったが特に違いはみられなかった。しかし、各ハプログループの推定発生時期に関して解析を行うとゲノムワイドな有意水準を満たす領域が同定された。

現在までの達成度 (段落)

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

  • 研究成果

    (10件)

すべて 2021 2020 その他

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (8件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Genome-wide association study of semen volume, sperm concentration, testis size, and plasma inhibin B levels2020

    • 著者名/発表者名
      Sato Youichi、Tajima Atsushi、Kiguchi Misaki、Kogusuri Suzu、Fujii Aki、Sato Takehiro、Nozawa Shiari、Yoshiike Miki、Mieno Makiko、Kojo Kosuke、Uchida Masahiro、Tsuchiya Haruki、Yamasaki Kazumitu、Imoto Issei、Iwamoto Teruaki
    • 雑誌名

      Journal of Human Genetics

      巻: 65 ページ: 683~691

    • DOI

      10.1038/s10038-020-0757-3

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 遺伝情報の機械学習を用いた顕微鏡下精巣内精子採取術における精子回収予測の検討2021

    • 著者名/発表者名
      佐藤 陽一, 土屋 春樹, 古城 公佑, 内田 将央, 山崎 一恭, 岩本 晃明
    • 学会等名
      日本アンドロロジー学会第39回学術大会
  • [学会発表] Y染色体ハプログループとAZF領域欠失パターンとの関連性から見た日本人のY染色体進化2020

    • 著者名/発表者名
      多田 篤史, 足立 奈生子, 井上 誠, 佐藤 陽一
    • 学会等名
      第74回日本人類学会大会
  • [学会発表] 日本人男性のY染色体ハプログループとAZF領域欠失パターンとの関連性2020

    • 著者名/発表者名
      多田 篤史, 足立 奈生子, 井上 誠, 佐藤 陽一
    • 学会等名
      日本人類遺伝学会第65回大会
  • [学会発表] 現代日本人のY染色体ハプログループ解析2020

    • 著者名/発表者名
      井上 誠, 佐藤 陽一:現代日本人のY染色体ハプログループ解析
    • 学会等名
      日本人類遺伝学会第65回大会
  • [学会発表] 非閉塞性無精子症に対する全エクソーム解析2020

    • 著者名/発表者名
      国村 彩香, 福永 千香, 古城 公佑, 内田 将央, 土屋 春樹, 松本 吉隆, 山崎 一恭, 岩本 晃明, 佐藤 陽一
    • 学会等名
      日本人類遺伝学会第65回大会
  • [学会発表] ゲノムワイド関連解析による血中inhibin B値関連遺伝子の同定と遺伝子改変マウスの解析2020

    • 著者名/発表者名
      上殿 千晴, 藤井 亜紀, 田嶋 敦, 佐藤 丈寛, 井本 逸勢, 佐藤 陽一
    • 学会等名
      日本人類遺伝学会第65回大会
  • [学会発表] ゲノム情報を用いた機械学習によるシタラビン投与後の副作用発現予測モデルの構築2020

    • 著者名/発表者名
      遠藤 優香, 田島 穂澄, 岡田 直人, 中村 信元, 賀川 久美子, 藤井 志朗, 三木 浩和, 石澤 啓介, 安倍 正博, 佐藤 陽一
    • 学会等名
      第59回日本薬学会中国四国支部学術大会
  • [学会発表] 機械学習による遺伝情報を用いた抗がん剤投与の味覚障害発現予測モデルの構築2020

    • 著者名/発表者名
      武井 みのり, 岡田 直人, 中村 信元, 賀川 久美子, 藤井 志朗, 三木 浩和, 石澤 啓介, 安倍 正博, 佐藤 陽一
    • 学会等名
      第59回日本薬学会中国四国支部学術大会
  • [備考] 徳島大学大学院医歯薬学研究部医薬品情報学分野ホームページ

    • URL

      https://www.tokushima-u.ac.jp/ph/faculty/labo/inf/

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公開日: 2021-12-27  

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