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約70％の乳がんはエストロゲン受容体（ER）を発現しており、その増殖にERをコードするESR1遺伝子の転写が必要である。そのためERの機能阻害を誘導する抗がん剤が臨床で使用されている。しかし、これらの抗がん剤に耐性となり再発するケースが少なくない。耐性獲得機構の解明は喫緊の課題である。
我々はER陽性乳がん細胞においてESR1遺伝子座近傍に非コードRNAエレノアが塊（クラウド）を形成していることを見出している。このクラウドは再発乳がんモデル細胞において顕著である。エストロゲン類縁体の添加によりER依存的にエレノアクラウドが消失し、その結果としてESR1遺伝子の転写が抑制され、細胞死に至る。また、エレノアクラウドの消失に伴いESR1遺伝子座近傍のクロマチン構造が変化する。さらに、ER陽性乳がんのESR1遺伝子座近傍に、転写活性化に機能するヒストンバリアントH2A.Z が局在していることが分かっている。これらのことから、本研究では、ER陽性乳がん細胞においてESR1遺伝子座に形成される非コードRNAを中心とした非ゲノム情報ネットワークが複製および維持される分子機構を解析した。これまでに、ヒストンの翻訳後修飾であるアセチル化修飾を取り除くヒストン脱アセチル化酵素を阻害することにより、エレノアの転写が下がることを見出した。さらに、脱アセチル化酵素の阻害によりH2A.ZはESR1 遺伝子のgene body 上に集積するようになることが分かった。同様のメカニズムにより転写が抑制される遺伝子が複数あることも分かり、新たな転写制御機構を観察していることが考えられた。
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