| 研究領域 | 細胞システムの自律周期とその変調が駆動する植物の発生 |
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| 研究課題/領域番号 |
20H05431
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| 研究機関 | 新潟大学 |
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研究代表者 |
池内 桃子 新潟大学, 自然科学系, 准教授 (00633570)
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| 研究期間 (年度) |
2020-04-01 – 2022-03-31
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| キーワード | シングルセル / 多能性 |
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| 研究実績の概要 |
・今年度は、カルスとメリステムを含むサンプルを用いたシングルセルRNA-seq のデータ解析を進め、クラスター特異的に発現するマーカー遺伝子群についてレポーターGFP の形質転換体を作出した。得られた形質転換体を用いて、共焦点レーザー顕微鏡を用いたイメージング解析を実施した。多能性カルスから様々な細胞種が生み出されるプロセスを観察した結果、細胞運命はまずカルスの内外に沿った位置情報にしたがって決まり、その後カルスの外側の層のなかで確率的にメリステムになる細胞とならない細胞の運命が分かれるということが明らかになった。
・多能性カルスをプロトプラスト化しシングルセルRNA-seq 解析を実施するための予備実験を進めることができた。
・遺伝子発現ダイナミクスを調べるために、多能性を制御することが示唆されている遺伝子群についてレポータールシフェラーゼラインの作出を進めることができた。
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
2: おおむね順調に進展している
理由
多能性カルスから様々な細胞種が生み出されるプロセスの解析は、非常に順調に進められた。多能性カルスのシングルセル解析は、当初初年度実施を計画していたが、コロナ禍の影響で関東への出張が著しく制限されたこともあり次年度へ持ち越した。
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| 今後の研究の推進方策 |
多能性カルスを用いて、シングルセルRNA-seq 解析を実施する予定である。また、得られたデータに基づいて周期的に発現が変動する遺伝子の候補を探索することを予定している。
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