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2009 年度 実績報告書

光駆動イオン輸送蛋白質の動作機構の解明

公募研究

研究領域膜超分子モーターの革新的ナノサイエンス
研究課題/領域番号 21023014
研究機関分子科学研究所

研究代表者

古谷 祐詞  分子科学研究所, 生命・錯体分子科学研究領域, 准教授 (80432285)

キーワードナノバイオ / 赤外分光法 / 生体分子 / 蛋白質 / 生物物理
研究概要

イオンポンプ蛋白質は、エネルギー生産や情報伝達に必要な膜電位やイオン濃度勾配の形成に重要な役割を果たしている。本研究では、高精度な赤外分光計測を駆使して、イオンが輸送される過程で生じるタンパク質の構造変化を明らかにし、その輸送機構の解明を行う。特に、イオンがタンパク質内部でどのような包摂状態にあるのかを、周辺に存在するアミノ酸側鎖や蛋白質内部の水分子の分子振動、さらには赤外活性なイオン分子(硝酸イオン)を用い、イオン分子そのものの分子振動から明らかにする。対象となるイオンポンプ蛋白質は光で駆動される古細菌型ロドプシンが主であるが、それらの研究を元に光駆動ではないイオンポンプ蛋白質(Na^+ポンプであるV-ATPaseなど)も研究対象とし、両者の駆動メカニズムの違いを明らかにする。
平成21年度は以下のような研究成果を得た。1.べん毛モーター蛋白質複合体を構成するPomA/PomB蛋白質に対するATR-FTIR計測に成功した。Na^+イオンの結合に伴う赤外差スペクトルを計測することで、PomBに対するNa^+の結合部位をAsp24と同定した(Y.Sudo et al., Biochemistry 48,10136-10145)。2.アナベナセンサリーロドプシンの217番目のアミノ酸残基を置換することで、細胞外側から内側へと通常とは逆向きにプロトンを輸送するタンパク質を作製することに成功した(A.Kawanabe et al., J.Am.Chem.Soc.131,16439-16444)。3.時間分解赤外分光装置を新規に立ち上げて、バクテリオロドプシン(プロトンポンプ)およびハロロドプシン(塩化物イオンポンプ)の3850-900cm^<-1>の中赤外領域でのスペクトル変化を12.5μsecの時間分解能で取得することに成功した。

  • 研究成果

    (35件)

すべて 2010 2009

すべて 雑誌論文 (6件) (うち査読あり 6件) 学会発表 (29件)

  • [雑誌論文] An FTIR Study of Monkey Green- and Red-Sensitive Visual Pigments2010

    • 著者名/発表者名
      Kouta Katayama et al.
    • 雑誌名

      Angew.Chem.Int.Ed. 49

      ページ: 891-894

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Manipulation of the Protein-complex Function by Using an Engineered Heterotrimeric Coiled-coil Switch2009

    • 著者名/発表者名
      Toshihisa Mizuno et al.
    • 雑誌名

      Org.Biomol.Chem. 7

      ページ: 3102-3111

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Effects of Chloride Ion Binding on the Photochemical Properties of Salinibacter Sensory Rhodopsin I2009

    • 著者名/発表者名
      Daisuke Suzuki et al.
    • 雑誌名

      J.Mol.Biol. 392

      ページ: 48-62

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Engineering an inward proton transport from a bacterial sensor rhodopsin2009

    • 著者名/発表者名
      Akira Kawanabe et al.
    • 雑誌名

      J.Am.Chem.Soc. 131

      ページ: 16439-16444

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Characterization of signaling complex composed of sensory rhodopsin I and its cognate transducer protein from the eubacterium Salinibacter rubber2009

    • 著者名/発表者名
      Yuki Sudo et al.
    • 雑誌名

      Biochemistry 48

      ページ: 10136-10145

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Interaction between Na+ ion and carboxylates of the PomA-PomB stator unit studied by ATR-FTIR spectroscopy2009

    • 著者名/発表者名
      Yuki Sudo et al.
    • 雑誌名

      Biochemistry 48

      ページ: 11699-11705

    • 査読あり
  • [学会発表] 霊長類色覚視物質の赤外分光解析2010

    • 著者名/発表者名
      片山耕大
    • 学会等名
      平成21年度生物物理学会中部支部講演会
    • 発表場所
      岡崎コンファレンスセンター、岡崎
    • 年月日
      20100329-20100330
  • [学会発表] X-H, X-D伸縮振動領域の赤外分光法から何が分かるか?2010

    • 著者名/発表者名
      古谷祐詞
    • 学会等名
      分子研研究会「拡がるロドプシンの仲間から"何が分かるか""何をもたらすか"」
    • 発表場所
      岡崎コンファレンスセンター、岡崎
    • 年月日
      20100323-20100324
  • [学会発表] センサーロドプシンを用いたプロトンポンプ研究2010

    • 著者名/発表者名
      川鍋陽
    • 学会等名
      分子研研究会「拡がるロドプシンの仲間から"何が分かるか""何をもたらすか"」
    • 発表場所
      岡崎コンファレンスセンター、岡崎
    • 年月日
      20100323-20100324
  • [学会発表] 霊長類色覚視物質の赤外分光解析2010

    • 著者名/発表者名
      片山耕大
    • 学会等名
      分子研研究会「拡がるロドプシンの仲間から"何が分かるか""何をもたらすか"」
    • 発表場所
      岡崎コンファレンスセンター、岡崎
    • 年月日
      20100323-20100324
  • [学会発表] 高速原子間力顕微鏡によるロドプシンの動態観察―ロドプシンの直接観察から何が分かるか、何をもたらすか―2010

    • 著者名/発表者名
      山下隼人
    • 学会等名
      分子研研究会「拡がるロドプシンの仲間から"何が分かるか""何をもたらすか"」
    • 発表場所
      岡崎コンファレンスセンター、岡崎
    • 年月日
      20100323-20100324
  • [学会発表] 霊長類色覚視物質の赤外分光解析2010

    • 著者名/発表者名
      片山耕大
    • 学会等名
      新学術領域「π空間」第3回公開シンポジウム
    • 発表場所
      岡崎コンファレンスセンター、岡崎
    • 年月日
      20100315-20100316
  • [学会発表] KcsAチャネルの全反射赤外分光解析2010

    • 著者名/発表者名
      浅井佑介
    • 学会等名
      新学術領域「π空間」第3回公開シンポジウム
    • 発表場所
      岡崎コンファレンスセンター、岡崎
    • 年月日
      20100315-20100316
  • [学会発表] Stimulus-Induced Difference FTIR Spectroscopy for Archaeal-Type Rhodopsins2009

    • 著者名/発表者名
      古谷祐詞
    • 学会等名
      2nd Japan-Korea Seminar on Biomolecular Sciences-Experiments and Simulations
    • 発表場所
      Symposion Hall, Nagoya University, Nagoya
    • 年月日
      20091222-20091223
  • [学会発表] Study on chimeric archeal-rhodopsin containing cytoplasmic loop of bovine rhodopsin2009

    • 著者名/発表者名
      Aya Nakatsuma
    • 学会等名
      1^<st> International Symposium on Emergence of Highly Elaborated π-Space and Its Function
    • 発表場所
      Hotel Hankyu Expo Park, Suita
    • 年月日
      20091218-20091219
  • [学会発表] Interaction between membrane protein and ions characterized by ATR-FTIR spectroscopy2009

    • 著者名/発表者名
      古谷祐詞
    • 学会等名
      The 47th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
    • 発表場所
      ASTY Tokushima, Tokushima
    • 年月日
      20091030-20091101
  • [学会発表] Sodium ion binding sites of V-ATPase studied by ATR-FTIR spectroscopy2009

    • 著者名/発表者名
      古谷祐詞
    • 学会等名
      The 47th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
    • 発表場所
      ASTY Tokushima, Tokushima
    • 年月日
      20091030-20091101
  • [学会発表] An FTIR Study of Monkey Green- and Red-Sensitive Visual Pigments2009

    • 著者名/発表者名
      片山耕大
    • 学会等名
      The 47th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
    • 発表場所
      ASTY Tokushima, Tokushima
    • 年月日
      20091030-20091101
  • [学会発表] ATR-FTIR study of KcsA channel2009

    • 著者名/発表者名
      浅井佑介
    • 学会等名
      The 47th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
    • 発表場所
      ASTY Tokushima, Tokushima
    • 年月日
      20091030-20091101
  • [学会発表] Study on chimeric archeal-rhodopsin containing cytoplasmic loop of bovine rhodopsin2009

    • 著者名/発表者名
      Aya Nakatsuma
    • 学会等名
      The 47th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
    • 発表場所
      ASTY Tokushima, Tokushima
    • 年月日
      20091030-20091101
  • [学会発表] Encapsulation of ion-pumping rhodopsins into multi-wall carbon nanotubes2009

    • 著者名/発表者名
      川島崇睦
    • 学会等名
      The 47th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
    • 発表場所
      ASTY Tokushima, Tokushima
    • 年月日
      20091030-20091101
  • [学会発表] An FTIR Study of Monkey Green- and Red-Sensitive Visual Pigments2009

    • 著者名/発表者名
      片山耕大
    • 学会等名
      Horiba-ISSP International Symposium(ISSP-11)on "Hydrogen and Water in Condensed Matter Physics"
    • 発表場所
      Seimeinomori Resort, Chiba
    • 年月日
      20091012-20091016
  • [学会発表] 全反射赤外分光法によるKcsAチャネルのイオン選択およびpHセンシング機構の解析2009

    • 著者名/発表者名
      古谷祐詞
    • 学会等名
      第3回分子科学討論会
    • 発表場所
      名古屋大学、名古屋
    • 年月日
      20090921-20090924
  • [学会発表] 霊長類色覚視物質の赤外分光解析2009

    • 著者名/発表者名
      片山耕大
    • 学会等名
      第3回分子科学討論会
    • 発表場所
      名古屋大学、名古屋
    • 年月日
      20090921-20090924
  • [学会発表] 古細菌型ロドプシンのカーボンナノチューブへの内包2009

    • 著者名/発表者名
      川島崇睦
    • 学会等名
      第3回分子科学討論会
    • 発表場所
      名古屋大学、名古屋
    • 年月日
      20090921-20090924
  • [学会発表] Structural Analysis of Sodium Ion Binding Sites of V-ATPase from Enterococcus hirae by use of ATR-FTIR Spectroscopy2009

    • 著者名/発表者名
      古谷祐詞
    • 学会等名
      Internal Symposium : Innovative Nanoscience of Supermolecular Motor Proteins Working in Biomembranes
    • 発表場所
      Shirankaikan in Kyoto University, Kyoto
    • 年月日
      20090908-20090910
  • [学会発表] KcsAチャネルに対する赤外分光の狙いは達成されたのか?2009

    • 著者名/発表者名
      古谷祐詞
    • 学会等名
      特定領域研究「高次系分子科学」第7回ミニ公開シンポジウム
    • 発表場所
      越前町生涯学習センター越前分館、越前
    • 年月日
      20090831-20090901
  • [学会発表] ロドプシンのカーボンナノチューブへの内包2009

    • 著者名/発表者名
      川島崇睦
    • 学会等名
      新学術領域研究「高次π空間」第2回公開シンポジウム
    • 発表場所
      京都テルサ、京都
    • 年月日
      20090827-20090828
  • [学会発表] 赤外分光法による膜タンパク質の機能発現に伴う構造変化解析2009

    • 著者名/発表者名
      古谷祐詞
    • 学会等名
      第49回分子科学若手の会夏の学校
    • 発表場所
      もみのき森林公園、広島県廿日市市
    • 年月日
      20090817-20090821
  • [学会発表] 霊長類色覚視物質の赤外分光解析2009

    • 著者名/発表者名
      片山耕大
    • 学会等名
      生物物理若手の会第49回夏の学校
    • 発表場所
      支笏湖ユースホステル、支笏湖
    • 年月日
      20090731-20090803
  • [学会発表] ロドプシンのカーボンナノチューブへの内包2009

    • 著者名/発表者名
      川島崇睦
    • 学会等名
      生物物理若手の会第49回夏の学校
    • 発表場所
      支笏湖ユースホステル、支笏湖
    • 年月日
      20090731-20090803
  • [学会発表] 光駆動イオン輸送蛋白質の動作機構の解明2009

    • 著者名/発表者名
      古谷祐詞
    • 学会等名
      特定領域研究「革新的ナノバイオ」第4回班会議
    • 発表場所
      北海道大学、札幌
    • 年月日
      20090619-20090620
  • [学会発表] 古細菌型ロドプシンで実現した内向きのプロトンポンプ2009

    • 著者名/発表者名
      川鍋陽
    • 学会等名
      第36回生体分子科学討論会
    • 発表場所
      北海道大学学術交流会館、札幌
    • 年月日
      20090619-20090620
  • [学会発表] ATR-FTIR Spectroscopy for Investigating Interaction Changes upon Binding of Ions to Transmembrane Proteins2009

    • 著者名/発表者名
      古谷祐詞
    • 学会等名
      First World Congress of International Academy of Nanomedicine(IANM)
    • 発表場所
      Sanya, China
    • 年月日
      20090611-20090614
  • [学会発表] Analysis of Hydrogen-Bonding Dynamics of a Water Cluster Formed in an Isolated Nanospace2009

    • 著者名/発表者名
      古谷祐詞
    • 学会等名
      The 3rd Symposium on "Molecular Science for Supra Functional Systems"
    • 発表場所
      Tokyo Institute of Technology, O-okayama
    • 年月日
      20090603-20090605

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公開日: 2011-06-16   更新日: 2016-04-21  

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