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体細胞分裂期と減数分裂期では、発現している遺伝子が大幅に異なっている。この遺伝子発現パターンの切り換えには、転写レベルの制御に加え、転写されたmRNAの選択的な除去による調節が大きく寄与している。本研究では、分裂酵母のRNA結合タンパク質Mmilpが誘導する、体細胞分裂期での減数分裂特異的mRNAの除去機構を明らかにすることを目標としている。これまでの解析によって、Mmilpが誘導するmRNA除去に、核内exosome、poly (A)ポリメラーゼ、poly(A)結合タンパク質が関わっていることが示されていた。これらに加えて、出芽酵母のmRNA3'末端成熟因子Rna15の分裂酵母ホモログが、mRNA除去に必要であることを示した。これらの因子が、分裂酵母内でMmilpと物理的に相互作用していること、Mmilpが形成する核内点状構造体に共局在することを明らかにした。またGFPを利用したMmilpの標的mRNAの可視化を進め、標的mRNAがMmilpの作る核内構造体に存在する様子を観察した。
Mmilpが認識するRNA配列を決定するため、既知のMmilpの標的mRNAの配列を詳細に比較し、共通する配列モチーフを見出した。Mmilpが実際に、その配列を認識していることを、in vivoでの変異導入や、in vitroでの結合実験を行い、明らかにした。決定した認識配列の情報を利用して、新規のMmilp標的遺伝子の同定を進めている。
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