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2009 年度 実績報告書

同一場における転写因子のDNA結合・転写活性同時評価法の確立

公募研究

研究領域遺伝情報収納・発現・継承の時空間場
研究課題/領域番号 21114501
研究機関北海道大学

研究代表者

三國 新太郎  北海道大学, 大学院・医学研究科, 特任助教 (40435954)

キーワードDNA / 核内転写因子 / FCS / FCCS / 生物物理 / グルココルチコイド / 単一分子計測 / 相互作用
研究概要

遺伝情報発現は転写調節によってその大半が制御されている。特に真核生物において、その転写調節は転写因子のDNAへの結合がトリガーとなる。従って、転写因子-DNA間の相互作用の定量的解明はとも言える。しかしながら、これまで転写因子の機能解析に用いられてきた手法では細胞内での時空間的解析が困難であった。そこで、本申請では蛍光相互相関分光法(Fluorescence Cross Correlation Spectroscopy : FCCS)を用い、転写因子-DNA相互作用とそれに伴う転写活性化量を経時的かつ定量的に測定可能な系の確立を目的とした。
今年度は、溶液での測定系構築を目指し、EGFP融合核内転写因子(グルココルチコイド受容体)の単離・精製を行い、FCCSによる蛍光ラベル化されたDNAとの相互作用検出のためのBuffer等の最適化を行った。また、転写活性化量を蛍光相関分光法(Fluorescence Correlation Spectroscopy : FCS)で定量するために用いる蛍光タンパク質融合RNA特異的結合タンパク質(MS2 Coat Protein)の構築を行った。
さらに、この「転写因子のDNA結合・転写活性同時評価法」を生細胞内で測定可能にするために、細胞内へのマイクロインジェクション装置の整備を行った。
このように、転写に関わる遺伝情報場の解明にむけて、溶液中での測定だけなく、生細胞への応用も見据えた測定系の基盤が整えることができた。次年度は溶液中における転写因子のDNA結合・転写活性同時評価法を完成させるとともに、生細胞への応用を本格的に行う予定である。

  • 研究成果

    (5件)

すべて 2010 2009

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (2件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] Low pH-Triggered Model Drug Molecule Release from Virus-Like Paricles2010

    • 著者名/発表者名
      Noriko Ohtake
    • 雑誌名

      ChemBioChem (in press)

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Simultaneous measurement of caspase-3 and caspase-9 activities during induced apoptosis by fluorescence cross-correlation spectroscopy2010

    • 著者名/発表者名
      Sun Fun
    • 雑誌名

      Bioimages (in press)

    • 査読あり
  • [学会発表] 蛍光相関分光法と蛍光寿命測定を組み合わせたホモ二量体定量法の確立2009

    • 著者名/発表者名
      三國新太郎
    • 学会等名
      第6回バイオオプティクス研究会
    • 発表場所
      北海道大学(札幌市)
    • 年月日
      2009-12-04
  • [学会発表] FCSとFLIMを組み合わせたホモ二量体検出法の確立2009

    • 著者名/発表者名
      三國新太郎
    • 学会等名
      イメージング若手の会 第1回光塾
    • 発表場所
      情報通信研究機構(神戸市)
    • 年月日
      2009-08-15
  • [図書] Live Cell Imaging : A Laboratory Manual, Second Edition 'First Steps for Fluorescence Correlation Spectroscopy of Living Cells.'2010

    • 著者名/発表者名
      Masdataka Kinjo
    • 総ページ数
      229-238
    • 出版者
      COLD SPRING HARBOR LABORATORY PRESS

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公開日: 2011-06-16   更新日: 2016-04-21  

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