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2010 年度 実績報告書

同一場における転写因子のDNA結合・転写活性同時評価法の確立

公募研究

研究領域遺伝情報収納・発現・継承の時空間場
研究課題/領域番号 21114501
研究機関北海道大学

研究代表者

三國 新太郎  北海道大学, 大学院・医学研究科, 特任助教 (40435954)

キーワード1分子計測 / 生物物理 / グルココルチコイド / FCS / FCCS / 核内転写因子 / 相互作用 / DNA
研究概要

遺伝情報発現は転写調節によってその大半が制御されている。特に真核生物において、その転写調節は転写因子のDNAへの結合がトリガーとなる。従って、転写因子-DNA間の相互作用とそれに伴う転写活性化の定量化は遺伝情報発現の中心的な命題の解明につながる。
しかし、これまで転写因子の機能解析に用いられてきた手法では細胞内での時空間的解析が困難であった。そこで、本申請では蛍光相互相関分光法を用い、転写因子-DNA相互作用とそれに伴う転写活性化量を経時的かつ定量的に測定可能な系の確立を目的とした。
今年度は、溶液での測定系構築を目指し、昆虫細胞からのEGFP融合核内転写因子(グルココルチコイド受容体)の単離法を確立した。また、蛍光相関分光法を用いた転写産物の定量化のための蛍光タンパク質融合RNA特異的結合タンパク質(MS2 Coat Protein)の単離精製を行った。現状では目的の測定系の確立には至っていないが、測定系に必要な材料がそろいつつあるので、今後、早急に系の立ち上げを目指す。
さらに、今年度はRICS(Raster Image Correlation Spectroscopy)法の確立を行い、生細胞核内での転写因子動態マッピング解析を行った。その結果、核内で転写因子の動きが著しく制限されている領域が確認された。また、DNA結合能を欠損させた変異体においては動きが制限される領域が観察されないことがわかった。これは転写因子の動きが制限される領域で転写が活発に行われていることが示唆する結果である。現在、DNA microarrayや定量的RT-PCRを用い、野生型と様々な機能欠損変異体との転写活性化の違いを解析し、核内における動きが制限される領域と転写活性化の相関について解析を行っている。

  • 研究成果

    (6件)

すべて 2011 2010 その他

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (3件) 備考 (2件)

  • [雑誌論文] Monitoring the caspase cascade in single apoptotic cells using a three-color fluorescent protein substrate.2011

    • 著者名/発表者名
      Sun F
    • 雑誌名

      Biochem Biophys Res Commun

      巻: 404(2) ページ: 706-710

    • 査読あり
  • [学会発表] Fluorescence correlation analysis of intranuclear transcriptional activity of glucocorticoid receptor.2011

    • 著者名/発表者名
      Shintaro Mikuni
    • 学会等名
      2^<nd> International Symposium on Photonic Bioimaging
    • 発表場所
      Hilton Niseko Village (Niseko, Japan)(招待講演)
    • 年月日
      2011-02-10
  • [学会発表] The relationship between the landscape of the diffusion property and transcriptional activity of glucocorticoid recetor.2011

    • 著者名/発表者名
      Shintaro Mikuni
    • 学会等名
      International Symposium Physicochemical Field for Genetic Activities
    • 発表場所
      Awaji Yumebutai International Conference Center (Awaji, Japan)
    • 年月日
      2011-01-24
  • [学会発表] Imaging correlation analysis of intranuclear transcriptional activity of glucocorticoid receptor2010

    • 著者名/発表者名
      Shintaro Mikuni
    • 学会等名
      日本生物物理学会第48回年会
    • 発表場所
      東北大学川内北キャンパス(仙台市)
    • 年月日
      2010-09-22
  • [備考]

    • URL

      http://www.lfsci.hokudai.ac.jp/labs/infmcd/index.html

  • [備考]

    • URL

      http://www.med.hokudai.ac.jp/~imaging/index.html

URL: 

公開日: 2012-07-19  

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