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2009 年度 実績報告書

運動する生物のロバスト追跡と蛍光画像解析

公募研究

研究領域神経系の動作原理を明らかにするためのシステム分子行動学
研究課題/領域番号 21115502
研究機関東北大学

研究代表者

橋本 浩一  東北大学, 大学院・情報科学研究科, 教授 (80228410)

キーワード神経ネットワーク / ビジュアルサーボ / ロックオントラッキング顕微鏡 / 線虫 / 画像処理 / 行動解析
研究概要

当該年度は,線虫の頭部拡大画像をロバストにトラッキングするアルゴリズムを開発した.現段階では,並進移動と回転の3つのパラメータを推定する非線形最小化問題を解くことにより,線虫の体のテクスチャをトラッキングすることに成功している.線虫が体をくねらせて変形する場合や,ゴミなどで体の一部が隠れる場合にも,最小二乗推定により初期画像に最も合致する部分をトラッキングすることができる.これにより線虫の神経細胞が集中して存在する頭部を高倍率で長時間追跡することが可能となり,神経細胞の活動記録に大いに役立てることが期待される.画像取得に用いるカメラとして高速CMOSカメラを導入した.画像サイズ400×400ピクセル,テンプレートサイズ50×50ピクセルで500fps程度の画像処理が実現できている.画像処理の高速度化はトラッキングシステムにおける顕微鏡ステージの制御のために非常に重要な要素である.高解像度の画像を用いながら,高いサンプリングレートで顕微鏡ステージの制御を行うことにより,線虫行動解析に必要十分な空間・時間分解能向上が実現できた.
蛍光画像取得に用いるEM-CCDカメラを導入した.CCDはCMOSとは違い,ROI制御が自由に行えないため,複数の画素の輝度を足し合わせて1つの画素とみなすビニング処理や部分読み出しを行うことで150fps程度の高フレームレートでの蛍光画像取得が可能となった.線虫の蛍光画像の取得のみならず,蛍光画像を手がかりとしたGFP発現部位のトラッキングにも成功している.線虫の蛍光画像でのトラッキングを,明視野像でのトラッキングの補助として用いることも検討中である.高フレームレートでの蛍光画像取得は,短時間で起こる線虫の神経活動の変化を見逃さずに観察することで、今後の階層的かる多様な反応連鎖の解明に大きく貢献すると期待される.

  • 研究成果

    (9件)

すべて 2009

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (8件)

  • [雑誌論文] A Parallel Computation of the Region-Based Level Set Method for Boundary Detection with Moving Objects2009

    • 著者名/発表者名
      X.Fei
    • 雑誌名

      Journal of Robotics and Mechatronics 21

      ページ: 698-708

    • 査読あり
  • [学会発表] A Parallel Region-Based LSM with Displacement Correction for Tracking a Single Moving Object2009

    • 著者名/発表者名
      X.Fei
    • 学会等名
      計測自動制御学会SI部門
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2009-12-24
  • [学会発表] 運動する細胞の観察を自動化する顕微鏡システムの開発とその応用2009

    • 著者名/発表者名
      小原健
    • 学会等名
      計測自動制御学会SI部門
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2009-12-24
  • [学会発表] アフィン変換を用いた変形する物体のビジュアルトラッキング2009

    • 著者名/発表者名
      遠藤義英
    • 学会等名
      計測自動制御学会SI部門
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2009-12-24
  • [学会発表] 線虫の特定部位を実時間追跡する顕微鏡システム2009

    • 著者名/発表者名
      丸三徳
    • 学会等名
      計測自動制御学会SI部門
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2009-12-24
  • [学会発表] Parallel computation of level set method for 500Hz visual servo control2009

    • 著者名/発表者名
      X.Fei
    • 学会等名
      28^<th> International Congress on High-Speed Imaging and Photonics
    • 発表場所
      Canberra, AUSTRALIA
    • 年月日
      2009-11-09
  • [学会発表] Parallel Region-Based Level Set Method with Displacement Correction for Tracking a Single Moving Object2009

    • 著者名/発表者名
      X.Fei
    • 学会等名
      Advanced Concepts for Intelligent Vision Systems
    • 発表場所
      Bordeaux, FRANCE
    • 年月日
      2009-09-29
  • [学会発表] ビジュアルサーボとその生体計測への応用2009

    • 著者名/発表者名
      橋本浩一
    • 学会等名
      第24回生体・生理工学シンポジウム
    • 発表場所
      仙台
    • 年月日
      2009-09-25
  • [学会発表] 線虫の追跡を実現する蛍光顕微鏡システム2009

    • 著者名/発表者名
      丸三徳
    • 学会等名
      日本機械学会
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      2009-05-26

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公開日: 2011-06-16   更新日: 2016-04-21  

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