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2009 年度 実績報告書

植物自然免疫を担う活性酸素生成酵素の制御機構の構造生物学的解明

公募研究

研究領域活性酸素のシグナル伝達機能
研究課題/領域番号 21117513
研究機関横浜市立大学

研究代表者

清水 敏之  横浜市立大学, 生命ナノシステム科学研究科, 准教授 (30273858)

キーワード活性酸素 / Rboh / X線結晶解析 / EFハンド / カルシウム / Rac1
研究概要

活性酸素種は動植物を問わず重要な生理活性物質でありその生成は厳密に制御されている。本申請は植物の感染防御応答において中心的な役割を果たす膜タンパク質の活性酸素生成酵素(NADPH oxidase;イネではOsRbohB)に焦点をあて、動物食細胞のものとは異なる活性化機構を明らかにし、活性酸素生成の制御過程を原子レベルで明らかにすることを目的とする。イネ由来のRbohB、Rac1を研究対象に選び大腸菌による大量発現系、精製系を検討している。カルシウム結合型のOsRbohBに関しては構造解析を終了している。OsRac1は全長の形で大腸菌に形質転換させ大量発現に成功し複数のカラムクロマトグラフィーを用いて精製を行い、やや取得量は少ないが1Lあたり1mg程度のタンパク質がとれる段階まで達している。
RbohBとRac1の相互作用を検討するためRbohBのカルシウム存在・非存在、Rac1のGTP結合型・GDP結合型を用いてプルダウンアッセイを行った。その結果、相互作用はGTP依存性があったが、カルシウムに関しては依存性がなかった。またカルシウムの有無による構造変化を検討するためSAXS及びCDスペクトルを測定した。その結果有意な差が認められたため何らかの構造変化あると考えられる。一方Rac1との相互作用面を見出すためNMRを用いたperturbation実験を行った結果コイルドコイルの領域にあることが示唆された。

  • 研究成果

    (6件)

すべて 2009 その他

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 4件) 学会発表 (1件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Purification, crystallization and initial X-ray diffraction study of human REV7 in complex with a REV3 fragment.2009

    • 著者名/発表者名
      Hara, et al.
    • 雑誌名

      Acta Crysatallogr. F65

      ページ: 1302-1305

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Purification, crystallization and initial X-ray diffraction study of the zinc-finger domain of zebrafish Nanos2009

    • 著者名/発表者名
      Hashimoto, et al.
    • 雑誌名

      Acta Crysatallogr. F65

      ページ: 959-961

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural basis for novel interactions between human translesion synthesis polymerases and PCNA2009

    • 著者名/発表者名
      Hishiki, et al.
    • 雑誌名

      J.Biol.Chem. 284

      ページ: 10552-10560

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Intrinsic Dynamics of Restriction Endonuclease EcoO109I Studied by Molecular Dynamics Simulations and X-Ray Scattering Data Analysis2009

    • 著者名/発表者名
      Oroguchi, et al.
    • 雑誌名

      Biophys.J 96

      ページ: 2808-2822

    • 査読あり
  • [学会発表] Structural Studies of Chromatin-related Proteins PAD4 and NML Recognizing Intrinsically Disordered Region2009

    • 著者名/発表者名
      Shimizu T
    • 学会等名
      Yokohama NMR workshop
    • 発表場所
      Yokohama
    • 年月日
      2009-11-12
  • [備考]

    • URL

      http://www.tsurumi.yokohama-cu.ac.jp/xtal/index.html

URL: 

公開日: 2011-06-16   更新日: 2016-04-21  

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