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2021 年度 実績報告書

核酸高次構造を反応場とするユビキチンプロテアソーム誘導分子の開発

公募研究

研究領域ケモテクノロジーが拓くユビキチンニューフロンティア
研究課題/領域番号 21H00275
研究機関東京農工大学

研究代表者

寺 正行  東京農工大学, 工学(系)研究科(研究院), 准教授 (10643512)

研究期間 (年度) 2021-04-01 – 2023-03-31
キーワードグアニン四重鎖 / ユビキチン / クリック反応 / ポリオキサゾール / ヌクレオプロテイン
研究実績の概要

異種生体分子を介したユビキチンリガーゼの連結分子の合成と評価法の開発
核酸高次構造に結合する天然有機化合物(テロメスタチン)アナログであるOTD分子に対して、種々のリンカーを介してユビキチンリガンドを連結し、系統的な連結分子群を収束的に合成した。これら合成した化合物について、分子レベルで核酸構造-ユビキチンリガーゼ間の複合体形成を、試験管レベルで迅速かつ定量的に測定を行うことを目的に、FRET原理に基づく定量的検出システムを開発した。本手法により、一般的な蛍光プレートリーダーを用いるのみで、核酸構造とユビキチンリガーゼが連結し得るかを評価し、OTD連結分子がPROTACとして機能し得ることを見出すことに成功した。本手法により、核酸構造特異的に結合するヌクレオタンパク質のユビキチン化が可能となる。
核酸分子の高速in situ連結を可能とする新規クリック試薬の開発
PROTAC分子の設計において、標的分子のリガンドとユビキチンリガーゼリガンドをスペーサーで連結する必要があるため、分子の巨大化が問題となっている。そこで、それぞれのリガンドが連結した後で、生体直交的かつ高速に連結できるクリック反応試薬を開発した。開発したクリック反応試薬は、標的となる核酸分子への親和性を向上させることで、通常のクリック反応に比べて1万倍以上の反応加速効果を有することを見出した。一方、クリック反応の反応点の化学安定性を維持することで、細胞内において問題となる副反応を回避することに成功した。(Bioconjug Chem 2023; Chem Commun 2023)

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

本年度予定したPROTAC分子について、系統的な合成法を確立することができた。さらに、合成化合物類の定量的評価方も確立することができた。これらの成果から、概ね順調に進展していると判断した。

今後の研究の推進方策

特異的G4-PROTAC、in situ G4-PROTACの分子設計
G4-PROTACのコンセプト一般化と創薬リードへの応用を目指すには特異性、すなわち標的のG4にのみG4-PROTACを作用させることを実現しなければならない。これまで、G4の折り畳まれ方の違い(トポロジー)を認識し分けるG4リガンドを開発している。この研究基盤を発展させ、G4リガンドに側鎖を導入し、近傍の配列、折り畳み方の違いを認識し分ける化合物を合成し、ユビキチンリガーゼリガンドとの連結分子を合成する。

  • 研究成果

    (13件)

すべて 2023 2022

すべて 雑誌論文 (2件) 学会発表 (11件)

  • [雑誌論文] Ion-Pair-Enhanced Double-Click Driven Cell Adhesion and Altered Expression of Related Genes2023

    • 著者名/発表者名
      Kitagawa Kohei、Okuma Nao、Yoshinaga Moeka、Takemae Hitoshi、Sato Fumiya、Sato Shoma、Nakabayashi Seiichiro、Yoshikawa Hiroshi Y.、Suganuma Masami、Luedtke Nathan、Matsuzaki Takahisa、Tera Masayuki
    • 雑誌名

      Bioconjugate Chemistry

      巻: 34 ページ: 638-644

    • DOI

      10.1021/acs.bioconjchem.2c00569

  • [雑誌論文] Synthesis of C2-Alkoxy-Substituted 19-Nor Vitamin D3 Derivatives: Stereoselectivity and Biological Activity2022

    • 著者名/発表者名
      Mizumoto Yuka、Sakamoto Ryota、Nagata Akiko、Sakane Suzuka、Kittaka Atsushi、Odagi Minami、Tera Masayuki、Nagasawa Kazuo
    • 雑誌名

      Biomolecules

      巻: 12 ページ: 69~69

    • DOI

      10.3390/biom12010069

  • [学会発表] テロメアグアニン四重鎖構造を標的とした多点認識型大環状ヘキ サオキサゾール化合物類の創製2023

    • 著者名/発表者名
      佐々木 捷悟、馬 悦、Hanbin Mao、寺 正行、長澤 和夫
    • 学会等名
      日本化学会第103回春季年会
  • [学会発表] 大環状ヘキサオキサゾール型G4リガンド類による液-液相分離誘起能の解析2023

    • 著者名/発表者名
      大山彩、佐々木捷悟、寺正行、長澤和夫
    • 学会等名
      日本化学会第103回春季年会
  • [学会発表] 光架橋基を有する二点認識型テロメアG4リガンドの開発2023

    • 著者名/発表者名
      柳田和輝、佐々木捷悟、馬悦、池袋一典、広川貴次、寺正行、長澤和夫:光架橋基を有する二点認識型テロメアG4リガンドの開発
    • 学会等名
      日本化学会第103回春季年会
  • [学会発表] グアニン四重鎖形成配列予測器の開発とSARS -CoV-2ゲノム配列への応用2023

    • 著者名/発表者名
      野原玲奈、北村純也、清野雛、佐々木捷悟、白石慧、池袋一典、寺正行
    • 学会等名
      日本化学会第103回春季年会
  • [学会発表] グアニン四重鎖形成配列の予測器の開発とSARS-CoV-2ゲノムにおけるグアニン四重鎖形成配列の同定2022

    • 著者名/発表者名
      野原玲奈、白石慧、北村純也、佐々木捷悟、寺正行
    • 学会等名
      日本ケミカルバイオロジー学会第16回年会
  • [学会発表] Synthesis and evaluation of the photo-reactive macrocyclic hexaoxazole probe for selective crosslinking with telomeric G-quadruplex2022

    • 著者名/発表者名
      柳田和輝、佐々木捷悟、馬悦、池袋一典、広川貴次、寺正行、長澤和夫
    • 学会等名
      ISNAC 2022
  • [学会発表] Mechanistic study on the S1 nuclease cleavage of G-quadruplexes stabilized by their ligands2022

    • 著者名/発表者名
      石川遼,佐々木捷悟,安田瑞穂,長澤和夫,寺正行
    • 学会等名
      ISNAC 2022
  • [学会発表] 大環状ヘキサオキサゾール二量体の合成と液-液相分離誘起能の評価2022

    • 著者名/発表者名
      大山彩、佐々木捷悟、寺正行、長澤和夫
    • 学会等名
      有機合成化学協会関東支部シンポジウム
  • [学会発表] Design and synthetic study on a covalent ligand for G-quadruplex binding to cereblon2022

    • 著者名/発表者名
      Nohara Rena、Yanagita Kazuki、Nagasawa Kazuo、Tera Masayuki
    • 学会等名
      New Frontier from Neo-Biology to Target Protein Degradation
  • [学会発表] 大環状ヘキサオキサゾール型G4リガンド類を用いた液-液相分離誘起能の解析2022

    • 著者名/発表者名
      大山彩、佐々木捷悟、寺正行、長澤和夫
    • 学会等名
      先端モデル動物支援プラットフォーム成果発表会
  • [学会発表] イオン対形成を駆動力とした標的指向性歪みジインによる細胞-細胞凝集体の作製2022

    • 著者名/発表者名
      吉永萌華,北川浩平,竹内愛美,津川裕司,竹前等,寺正行
    • 学会等名
      第16回バイオ関連化学シンポジウム

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公開日: 2023-12-25  

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