• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 課題ページに戻る

2021 年度 実績報告書

比較ゲノム解析からたどる日本猫の起源

公募研究

研究領域ゲノム配列を核としたヤポネシア人の起源と成立の解明
研究課題/領域番号 21H00357
研究機関アニコム先進医療研究所株式会社(研究開発課)

研究代表者

松本 悠貴  アニコム先進医療研究所株式会社(研究開発課), 研究開発課, 研究員 (40831384)

研究期間 (年度) 2021-04-01 – 2023-03-31
キーワードイエネコ / 日本猫 / ゲノム / 歴史 / ツシマヤマネコ
研究実績の概要

本年度では申請時の予定の通り、①日本産のイエネコの検体採取、②ゲノム解読、および③予備解析を行った。①北海道から沖縄までの全国各地の動物病院に協力いただき、100頭から研究目的でない避妊去勢手術で得られた組織片もしくは血液を収集した。②このうち36頭からDNAを抽出し、Illumina社のNovaSeq6000により全ゲノム配列解読を行った。③共同研究者から提供された13頭、ゲノムデータベースにある15頭のゲノムデータを追加し、64頭の全ゲノムデータを用いて予備解析を行った。
予備解析では、シーケンスを実施した配列の生データの品質管理、参照配列へのマッピング、変異検出について条件検討を行うとともに、主成分分析、集団史の推定を行った。主成分分析の結果、九州の集団は他の地域の集団と比べ、個体間の遺伝的なばらつきが大きかった。一方、北海道の集団はばらつきは小さかった。また、集団史の推定を行った結果、現段階では、先行研究の考古学的な観点からの研究結果と矛盾しない結果が得られている。次年度では統計モデルについてさらに条件検討を行い、日本猫の歴史の解明に向けて本格的に解析を進める。
また、本年度では申請時の予定にはなかったが、日本猫の近縁な野生種であるツシマヤマネコにおいてもゲノム解析を行った。予備検討の結果、ツシマヤマネコでは他のベンガルヤマネコと比べ、近親交配の程度が高いことが分かった。また、よこはま動物園ズーラシアと共同で進めていた親子判定のためのゲノム解析により、父親が不明だった個体の父親の推定を行った。
以上の成果は国際学術誌1報、国内学術会議等での発表2件、一般向けの情報誌での記事1報、新聞記事の取材対応等の成果に繋がった。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

1: 当初の計画以上に進展している

理由

当初の計画通り、本年度では検体採取、ゲノム解読、予備検討を進め、国内学術会議等での発表2件、一般向けの情報誌での記事1報、新聞記事の取材対応等の成果に繋がっている。
また、当初の予定にはなかったものの、日本猫の近縁な野生種であるツシマヤマネコにおいてもゲノム解析を行った。よこはま動物園ズーラシアと共同で進めていた親子判定のためのゲノム解析の結果が国際学術誌Animalsで出版に至るなど、当初の計画以上に進展した。

今後の研究の推進方策

次年度は本年度で実施した条件検討を進めながら、最終的な条件を決定したのち、成果の論文化を目指す。また、古代のイエネコの考古資料や、野生のネコ科動物においてもゲノム解析を進める予定である。

  • 研究成果

    (3件)

すべて 2022 2021

すべて 雑誌論文 (1件) (うち国際共著 1件、 査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (2件)

  • [雑誌論文] Successful Laparoscopic Oviductal Artificial Insemination in the Endangered Tsushima Leopard Cat (Prionailurus bengalensis euptilurus)2022

    • 著者名/発表者名
      Azumano Akinori、Ueda Miya、Nomura Mika、Usui Masashi、Ichinose Midori、Yanagawa Yojiro、Kusuda Satoshi、Matsumoto Yuki、Murata Koichi
    • 雑誌名

      Animals

      巻: 12 ページ: 777

    • DOI

      10.3390/ani12060777

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] ゲノム解析から明らかにする日本猫の歴史2022

    • 著者名/発表者名
      松本悠貴
    • 学会等名
      くにうみミーティング
  • [学会発表] ゲノムから見た日本ネコの特徴2021

    • 著者名/発表者名
      松本悠貴
    • 学会等名
      日本哺乳類学会2021年度大会

URL: 

公開日: 2022-12-28  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi