公募研究
トランス・トランスレーションは、tmRNAと呼ばれる低分子RNAが情報分子mRNAと情報を読み取る分子tRNAの両方の機能を果たすことで異常mRNAから翻訳を引き継ぎ、結果として2本の情報分子から1本のキメラペプチドを合成する変則的翻訳であり、細胞においては「何らかの原因で滞った翻訳を解消し、そこから生じる異常タンパク質を処理する、真正細菌に特異的な細胞秩序維持システム」と理解される。本研究では、トランス・トランスレーションがmRNA上のどの位置でおこるのか、どのようなときに起こるのか、どうしてこの位置で起こるのか、という点について明らかにしていくことで、多彩な細胞機能との関係を明らかにすることを目的とした。tmRNA結合タンパク質SmpBの点変異体および欠質変異体を多数作成し(本年度は特にmRNAを擬態すると考えられるC末端領域に焦点をあてた)、トランス・トランスレーションの各ステップにおける変異の効果を明らかにした。ペプチジルtRNAからAla-tmRNAへのペプチド転移を指標にして、トランス・トランスレーションのターゲットとして好まれるmRNAの長さを調べたところ、decoding center下流の長さは短いものほど好まれる傾向にあった。また、decqding center下流の長さは、EF-TuによるGTPの加水分解活性には影響がなかった。クロスリンク法を用いて、トランス・トランスレーションの各ステップにおけるリボソームタンパク質とSmpBの相互作用について解析した。その結果、mRNAの入り口にあるリボソームタンパク質とSmpBのC末端がクロスリンクすることが明らかになった。
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