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2011 年度 実績報告書

翻訳途上鎖のタンパク質社会における意義と役割

公募研究

研究領域タンパク質社会の研究の総合的推進
研究課題/領域番号 22020035
研究機関京都産業大学

研究代表者

伊藤 維昭  京都産業大学, 総合生命科学部, 教授 (90027334)

キーワードリボソーム / 翻訳制御 / 蛋白質 / 合成途上鎖 / ポリペプチジル-tRNA / 翻訳アレスト
研究概要

細胞内の合成途上鎖を特異的に検出する方法を開発した。細胞の全タンパク質を中性pHのSDS-PAGE(Invitrogen Nu-PAGE)で分離すると、その中に含まれる合成途上鎖はインタクトなpolypeptidy1-tRNAとして泳動される。ゲルのレーンを切り出して弱アルカリ性高温でインキュベートするとペプチドとtRNAとを結ぶエステル結合が切れる。Polypeptidyl-tRNAの安定性を系統的に調べたところ、最後のアミノ酸がVal,Ile,Proの場合は、かなり加水分解に抵抗性であることがわかった。これらの加水分解が充分に起こるように、強アルカリ・高温度処理を行うとゲル中のタンパク質がアクリルアミド成分と反応して2次元目の泳動が不可能となった。最適条件として1M Tris-base-80℃処理を設定した。切り出したゲルレーンを2次元目のゲルの上端に横たえて泳動すると、タンパク質一般は対角線上に並ぶが、Polypeptidyl-tRNAは、tRNAが存在するため1次元目の移動度が単純ポリペプチドに比べて約18kDa相当分遅れる。tRNAが失われた2次元目では移動が昂進する。この方法により、合成途上鎖のpolypeptide部分を対角線の下側のラインとして翻訳を完了した一般のタンパク質から分離して検出することが可能となった。この方法を用いた解析により、大腸菌細胞において、リボソーム救援機構が欠損するとpolypeptidyl-tRNAの数パーセントが安定に存続することが明らかになった。

  • 研究成果

    (7件)

すべて 2011 その他

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件) 学会発表 (2件) 備考 (2件)

  • [雑誌論文] Recruitment of a species-specific translational arrest module to monitor different cellular processes2011

    • 著者名/発表者名
      Chiba, S.
    • 雑誌名

      Proceeding of National Academy of Sciences, USA

      巻: 108 ページ: 6073-6078

    • DOI

      10.1073/pnas.1018343108

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structure and function of a membrane component SecDF that enhances protein export2011

    • 著者名/発表者名
      Tsukazaki, T.
    • 雑誌名

      Nature

      巻: 474 ページ: 235-238

    • DOI

      10.1038/nature09980

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Nascentome analysis uncovers futile protein synthesis in Escherichia coli2011

    • 著者名/発表者名
      Ito, K.
    • 雑誌名

      PLoS ONE

      巻: 6 ページ: e28413

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0028413

    • 査読あり
  • [学会発表] Vsualization of cellular polypeptidyl-tRNAs uncovers futile protein synthesis in E.coli2011

    • 著者名/発表者名
      伊藤維昭
    • 学会等名
      Cold Spring Harbor Asia Conference Protein Homeostasis in Health and Disease
    • 発表場所
      Suzhou, China(招待講演)
    • 年月日
      20110926-20110930
  • [学会発表] Structure, function and regulation of bacterial Sec machinery2011

    • 著者名/発表者名
      伊藤維昭
    • 学会等名
      International Union of Microbiological Societies 2011 Congress
    • 発表場所
      札幌(招待講演)
    • 年月日
      20110906-20110910
  • [備考]

    • URL

      http://www.cc.kyoto-su.ac.jp/~k4563/index-j.html

  • [備考]

    • URL

      http://www.kyoto-su.ac.jp/department/nls/news/20111208_news.html

URL: 

公開日: 2013-06-26  

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