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2010 年度 実績報告書

核マトリックスを介した長鎖ncRNA,UBE3A-ATSのクロマチン制御機構

公募研究

研究領域非コードRNA作用マシナリー
研究課題/領域番号 22115507
研究機関金沢大学

研究代表者

堀家 慎一  金沢大学, フロンティアサイエンス機構, 特任助教 (40448311)

キーワード長鎖ncRNA / インプリンティング / PWS / 核マトリックス / クロマチン / 染色体 / 核内配置 / snoRNA
研究概要

本研究は,ヒト染色体改変システムを用いて,父性発現遺伝子である長鎖ncRNA UBE3A-ATSのノックアウトを行い,UBE3A-ATSによる遺伝子発現制御機構を明らかにしたいと考えた。そこで,マウスA9細胞中の父方ヒト15番染色体を微小核細胞融合法により,ニワトリDT40細胞に移入した。DT40細胞は高頻度に相同組み換えが誘導され,DT40細胞に移入したヒト染色体もこれに従う。従って,ヒト染色体をDT40に移入することで,ヒト染色体上の任意の領域を改変する事が可能となる。本年度は,UBE3A-ATSの転写開始点近傍のCpGアイランド(PWS-IC)を相同組み換え法により欠失させ,UBE3A-ATS欠失の影響を15q11-q13領域の遺伝子発現およびクロマチン構造の視点で解析した。PWS-IC欠失染色体でUBE3A-ATSの発現を解析したところ,SNRPN,HBII-85を含めたUBE3A-ATS転写産物の消失を確認した。さらに,UBE3A,GABRB3,MAGEL2など,15q11-q13領域の遺伝子発現をRT-PCRにより解析したところ,興味深いことにMAGEL2遺伝子の発現が消失していることが明らかとなった。このことから,何らかのメカニズムで長鎖ncRNA,UBE3A-ATSがMAGEL2遺伝子の発現を制御している可能性が示唆された。また,UBE3A-ATS遺伝子領域は,父方アレル特異的なクロマチン脱凝集が観察されることがすでに報告されている。そこで,PWS-IC欠失染色体におけるクロマチン脱凝集についてDNA-FISHで解析したところ,正常染色体と変わらず父方アレル特異的なクロマチン脱凝集を維持していた。今後,長鎖ncRNA,UBE3A-ATSの細胞核内での局在を明らかにすることでUBE3A-ATSによる遺伝子発現制御機構を明らかにしたい。

  • 研究成果

    (13件)

すべて 2011 2010

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (11件)

  • [雑誌論文] Aberrant CpG Methylation of the Imprinting Control Region KvDMR1 Detected in Assisted Reproductive Technology-Produced Calves and Pathogenesis of Large Offspring Syndrome.2010

    • 著者名/発表者名
      Hori.N
    • 雑誌名

      Animal Reproduction Science

      巻: 122 ページ: 303-312

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Localization of an hTERT repressor region on human chromosome 3p 21.3 using chromosome engineering.2010

    • 著者名/発表者名
      Abe.S
    • 雑誌名

      Genome Integrity

      巻: 1 ページ: 6

    • 査読あり
  • [学会発表] McCP2- and CTCF-mediated homologous 15q11-q13 pairing is essential for neuronal gene expressions.2011

    • 著者名/発表者名
      堀家慎一
    • 学会等名
      Keystone symposia, Environmental Epigenomics and Disease Susceptibility
    • 発表場所
      Grove Park Inn Resort & Spa (USA)
    • 年月日
      2011-03-28
  • [学会発表] Acquisition of a germline methylation imprint at the SNRPN DMR.2010

    • 著者名/発表者名
      堀家慎一
    • 学会等名
      International Symposium on Epigenome Network, Development and Reprogramming of Germ Cells
    • 発表場所
      九州大学医学部百年講堂(福岡県)
    • 年月日
      2010-11-22
  • [学会発表] Homologous pairing of chromosome 15q11-q13 is associated with significant disruption of gene expression in human maternal chromosome 15 microcell transferred neurons.2010

    • 著者名/発表者名
      堀家慎一
    • 学会等名
      A Brain Research Meeting ; The Emerging Nearoscience of Autism Spectrum Disorders
    • 発表場所
      Westin San Diego (USA)
    • 年月日
      2010-11-11
  • [学会発表] Homologous pairing of chromosome 15q11-q13 is associated with significant disruption of gene expression in human maternal chromosome 15 microcell transferred neurons.2010

    • 著者名/発表者名
      堀家慎一
    • 学会等名
      60^<th> Annual Meeting ; The American Society of Human Genetics
    • 発表場所
      Washington Convention Center (USA)
    • 年月日
      2010-11-06
  • [学会発表] Homologous pairing of chromosome 15q11-q13 is associated with significant disruption of gene expression in human maternal chromosome 15 microcell transferred neurons.2010

    • 著者名/発表者名
      堀家慎一
    • 学会等名
      日本人類遺伝学会第55回大会
    • 発表場所
      大宮ソニックシティー(埼玉県)
    • 年月日
      2010-10-29
  • [学会発表] Homologous pairing of chromosome 15q11-q13 is associated with significant disruption of gene expression in human maternal chromosome 15 microcell transferred neurons.2010

    • 著者名/発表者名
      堀家慎一
    • 学会等名
      Epigenetics Europe
    • 発表場所
      The Burlington Hotel (Ireland)
    • 年月日
      2010-09-14
  • [学会発表] Homologous pairing of chromosome 15q11-q13 is associated with significant disruption of gene expression in human maternal chromosome 15 microcell transferred neurons.2010

    • 著者名/発表者名
      堀家慎一
    • 学会等名
      Wellcome Trust Scientific Conferences ; Signalling to Chromatin
    • 発表場所
      Wellcome Trust Genome Campus (UK)
    • 年月日
      2010-09-08
  • [学会発表] Homologous pairing of chromosome 15q11-q13 is associated with significant disruption of gene expression in human maternal chromosome 15 microcell transferred neurons.2010

    • 著者名/発表者名
      堀家慎一
    • 学会等名
      Sweden-Japan Joint Colloquium
    • 発表場所
      Karolinska Institutet (Sweden)
    • 年月日
      2010-09-06
  • [学会発表] ヒト15番染色体を保持したトランスクロモソミックマウスの作出2010

    • 著者名/発表者名
      堀家牧子
    • 学会等名
      第4回大会日本エピジェネティクス研究会
    • 発表場所
      米子市文化ホール(鳥取県)
    • 年月日
      2010-05-29
  • [学会発表] 母方15番染色体重複細胞株における15q11-q13領域の遺伝子発現および染色体ペアリングの解析2010

    • 著者名/発表者名
      堀家慎一
    • 学会等名
      第4回大会日本エピジェネティクス研究会
    • 発表場所
      米子市文化ホール(鳥取県)
    • 年月日
      2010-05-28
  • [学会発表] Homologous pairing of chromosome 15q11-q13 is associated with significant disruption of gene expression in human maternal chromosome 15 microcell transferred neurons.2010

    • 著者名/発表者名
      堀家慎一
    • 学会等名
      The 9th Annual International Meeting for Autism Research
    • 発表場所
      Philadelphia Marriott (USA)
    • 年月日
      2010-05-20

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公開日: 2012-07-19  

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