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2011 年度 実績報告書

核マトリックスを介した長鎖ncRNA,UBE3A-ATSのクロマチン制御機構

公募研究

研究領域非コードRNA作用マシナリー
研究課題/領域番号 22115507
研究機関金沢大学

研究代表者

堀家 慎一  金沢大学, フロンティアサイエンス機構, 特任助教 (40448311)

キーワード長鎖ncRNA / ゲノムインプリンティング / クロマチン / 核マトリックス / 核内配置 / ヒト染色体工学 / FISH / アンチセンスRNA
研究概要

15q11-q13領域はゲノム刷り込み遺伝子クラスターであり,PWS-ICを中心とした染色体ドメインレベルの転写制御の存在が明らかになっている。このPWS-IC近傍からは父方アレル特異的な長鎖ncRNA(UBE3A-ATS)が転写され,染色体ドメインレベルの転写制御の一役を担っていると考えられている。そこで,本研究ではヒト染色体工学技術を用いてPWS-ICのノックアウトを行い,UBE3A-ATSによる遺伝子発現制御機構を解析した。前年度,PWS-IC欠失染色体でUBE3A-ATSの発現を解析したところ,SNRPN,HBII-85を含めたUBE3A-ATS転写産物の消失を確認した。さらに,UBE3A,GABRB3,MAGEL2など,15q11-q13領域の遺伝子発現をRT-PCRにより解析したところ,興味深いことにMAGEL2遺伝子の発現が消失していることが明らかとなった。このことから,何らかのメカニズムで長鎖ncRNA,UBE3A ATSがMAGEL2遺伝子の発現を制御している可能性が示唆された。そこで,23年度はDNA-FISH法を用いてクロマチン脱凝集の状態や各々の遺伝子座の核内配置を詳細に検討した。その結果,15q11-q13領域のクロマチン脱凝集はUBE3A-ATSの転写の有無とは独立して維持されていること,逆に本来UBE3A-ATSの転写のないメチル化を受けたPWS-IC領域の欠失によってクロマチン脱凝集が誘導されることを見出した。また,MAGEL2遺伝子領域の核内配置をPWS-IC欠失染色体で解析したところ,MAGEL2遺伝子領域は,正常染色体と比べ核膜に近い位置に配置されていることを見出した。今後,長鎖ncRNA,UBE3A-ATSの細胞核内での局在を明らかにすることでUBE3A-ATSによる染色体核内配置の制御機構を明らかにしたい。

  • 研究成果

    (13件)

すべて 2012 2011

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (10件)

  • [雑誌論文] Epigenetic defects related to assisted reproductive technologies : Large offspring syndrome (LOS)2012

    • 著者名/発表者名
      Nagai M.
    • 雑誌名

      DNA Methylation-From Genomics to Technology

      ページ: 167-182

  • [雑誌論文] Neuron-specific impairment of inter-chromosomal pairing and transcription in a novel model of human 15q-duplication syndrome2011

    • 著者名/発表者名
      Meguro-Horike M.
    • 雑誌名

      Human Molecular Genetics

      巻: 20 ページ: 3798-3810

    • 査読あり
  • [雑誌論文] 15q11.2-13.3 chromatin analysis reveals epigenetic regulation of CHRNA7 with deficiencies in Rett and autism brain2011

    • 著者名/発表者名
      Yasui D.H.
    • 雑誌名

      Human Molecular Genetics

      巻: 20 ページ: 4311-4323

    • 査読あり
  • [学会発表] Neuron-specific inter-chromosomal pairing and transcription at the GABAR subunit genes cluster2011

    • 著者名/発表者名
      堀家慎一
    • 学会等名
      The 34^<th> Annual Meeting of the Molecular Biology Society of Japan
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(神奈川県)
    • 年月日
      2011-12-14
  • [学会発表] A novel model of human 15q-duplication syndrome : Neuron-specific impairment of inter-chromosomal pairing and transcription2011

    • 著者名/発表者名
      堀家慎一
    • 学会等名
      Cell Symposia, Autism Spectrum Disorders : From Mechanisms to Therapies
    • 発表場所
      Sheraton National Hotel (USA)
    • 年月日
      2011-11-09
  • [学会発表] Epigenetics of autism spectrum disorders2011

    • 著者名/発表者名
      堀家慎一
    • 学会等名
      第21回日本臨床精神神経薬理学会・第41回日本神経精神薬理学会合同年会
    • 発表場所
      京王プラザホテル(東京都)(招待講演)
    • 年月日
      2011-10-27
  • [学会発表] Neuron specific impairment of inter-chromosomal pairing and transcription in a novel model of human 15q-duplication syndrome2011

    • 著者名/発表者名
      堀家慎一
    • 学会等名
      The 32^<nd> NAITO CONFERENCE ON Biological basis of mental functions and disorders
    • 発表場所
      八ヶ岳ロイヤルホテル(山梨県)(招待講演)
    • 年月日
      2011-10-19
  • [学会発表] Neuron specific impairment of inter-chromosomal pairing and transcription in a novel model of human 15q-duplication syndrome2011

    • 著者名/発表者名
      堀家慎一
    • 学会等名
      12^<th> International Congress of Human Genetics and The ASHG 61^<st> Annual Meeting
    • 発表場所
      Montreal Convention Centrel (CANADA)
    • 年月日
      2011-10-12
  • [学会発表] Higher order inter-chromosomal association of maternal and paternal alleles of 15q11-q132011

    • 著者名/発表者名
      堀家慎一
    • 学会等名
      ICC on Genomic Imprinting and Beyond
    • 発表場所
      Institut d' Estudis Catalans (Spain)
    • 年月日
      2011-09-23
  • [学会発表] Neuron specific impairment of inter-chromosomal pairing in MeCP2-depleted neuronal cells2011

    • 著者名/発表者名
      堀家慎一
    • 学会等名
      12^<th> Annual Rett syndrome Symposium
    • 発表場所
      Landsdowne Resort and Spa (USA)
    • 年月日
      2011-06-26
  • [学会発表] MeCP2とクロマチンダイナミクス2011

    • 著者名/発表者名
      堀家慎一
    • 学会等名
      第53回日本小児神経学会総会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(神奈川県)(招待講演)
    • 年月日
      2011-05-26
  • [学会発表] ヒト15q11-q13領域におけるアレル特異的クロマチン脱凝集の解析2011

    • 著者名/発表者名
      堀家慎一
    • 学会等名
      日本分子生物学会第11回春季シンポジウム
    • 発表場所
      石川県立音楽堂(石川県)
    • 年月日
      2011-05-25
  • [学会発表] Role of PWS IC for paternal allele specific chromatin decondensation at 15q11-q132011

    • 著者名/発表者名
      堀家慎一
    • 学会等名
      第5回日本エピジェネティクス研究会年会
    • 発表場所
      KKRホテル熊本(熊本県)
    • 年月日
      2011-05-19

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公開日: 2013-06-26  

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