• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 課題ページに戻る

2011 年度 実績報告書

初期発生におけるクロマチン制御のリアルタイム解析

公募研究

研究領域哺乳類初期発生の細胞コミュニティー
研究課題/領域番号 22116509
研究機関大阪大学

研究代表者

國府 力  大阪大学, 医学系研究科, 特任講師 (70379238)

キーワードゲノム発現調節 / 幹細胞 / 核構造 / 生物発光 / トランスポゾン
研究概要

近年注目を集める細胞核内の3次元ゲノム構造は、哺乳類初期発生においても、細胞調節の重要なファクターと考えられる。ところが、その実験的解析方法は限られており、未だ十分な理解が進んでいない。そこで本プロジェクトでは、近接ゲノム領域に跳び易い性質(ローカルホッピング特性)を持つDNAトランスポゾンを活用し、従来法とは異なる原理に基づいた3次元ゲノム構造解析法を新規に開発した。具体的には、マウスES細胞の任意のゲノム領域にトランスポゾンをノックインして起点を作り、トランスポゾンの転移を誘導した後、ゲノム中への再挿入箇所を次世代シークエンサーで網羅的に同定する。
平成23年度は、前年度に最適化したプロトコールに基づき、マウスES細胞の系で、特徴の異なる数カ所の遺伝子座に対して解析を行った。その結果、いわゆる発生関連遺伝子座にトランスポゾンの起点を置いた場合、起点から約2-3Mb以内の近傍の著明な集積に加え、塩基数にして約30-40Mb以上離れたゲノム領域に、トランスポゾンの「ホットスポット」が出現することが分かった。これらの多くは進化的に保存された非コード領域であり、起点のゲノム領域との間に3次元的な近接が示唆される。一方、多能性関連遺伝子座に起点を置い左場合には、近傍ゲノム領域への集積は見られるものの、上記のような遠隔領域のホットスポットは認めなかった。
従来知られているシスエレメントは塩基数にして最大でも約1Mbのゲノム領域内に位置するものが多く、今回発見された約30-40Mb遠隔のホットスポットは、既知のエレメントとは異なる機序の存在を示している。本年度の結果は、トランスポゾンの転移分布が個々のゲノム領域の核内3次元構造の違いを反映することを示唆し、初期発生のゲノム調節機構に新たな視座を与えるものである。

  • 研究成果

    (7件)

すべて 2012 2011 その他

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (4件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] ES/iPS細胞研究のための遺伝学的手法の新展開2012

    • 著者名/発表者名
      堀江恭二
    • 雑誌名

      実験医学2012年6月増刊号「進展する幹細胞のサイエンスから再生医療へ」

      巻: (仮題)(掲載確定)

  • [雑誌論文] A homozygous mutant embryonic stem cell bank applicable for phenotype-driven genetic screening2011

    • 著者名/発表者名
      Horie K.
    • 雑誌名

      Nature Methods

      巻: 8 ページ: 1071-1077

    • DOI

      DOI:10.1038/nmeth.1739

    • 査読あり
  • [学会発表] 哺乳類と魚の背骨はどこが違うのか:異種間ゲノム工学による脊椎形成の分子機構の研究2011

    • 著者名/発表者名
      國府力
    • 学会等名
      京都大学再生医科学研究所「再生医学・再生医療の先端融合的共同研究拠点」平成23年度学術講演会
    • 発表場所
      京都大学芝蘭会館稲森ホール(招待講演)
    • 年月日
      2011-12-26
  • [学会発表] マウス・ゲノムエンジニアリングの進歩2011

    • 著者名/発表者名
      國府力
    • 学会等名
      第29回日本骨代謝学会学術集会
    • 発表場所
      大阪国際会議場
    • 年月日
      2011-07-30
  • [学会発表] 骨格組織構築に関与する幹細胞群の移動と局在2011

    • 著者名/発表者名
      國府力
    • 学会等名
      平成22年度共同研究会
    • 発表場所
      京都大学再生医科学研究所(招待講演)
    • 年月日
      2011-06-09
  • [学会発表] トランスポゾン飛跡追跡による3次元ゲノム構造解析の試み2011

    • 著者名/発表者名
      國府力
    • 学会等名
      次世代シークエンサー現場の会第1回研究会
    • 発表場所
      熱海ニューフジヤホテル
    • 年月日
      2011-05-28
  • [備考]

    • URL

      http://www.med.osaka-u.ac.jp/pub/mr-envi/www/japanese/member/detail/kokubu.html

URL: 

公開日: 2013-06-26  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi