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葉間期の変化には、葉間期比（plastochron ratio）と呼ばれるSAMと葉原基の関係に関するパラメーターの変化が重要であることが数理学的解析から明らかになっている。そこで、葉間期比に変化を与えうるSAMと葉原基の形態的特徴量の調査を、イネの葉間期変異体であるpla1、pla2、葉のサイズが小さくなるmkb3変異体、オーキシン内生量が減少したfib変異体を用いて行った。その結果、葉間期変異体であるpla1、pla2のみで、初期葉原基（P1）の厚み方向のサイズが拡大していた。一方、その後の発生ステージ（P2-P3）においては、逆にpla1、pla2は野生型と比較して葉原基が薄い傾向が見られ、結果として葉間期比の値は小さくなった。このことは、葉原基の発生に与えるPLA1とPLA2の効果は、初期と後期で異なることを示している。また、葉原基サイズのみから葉間期を説明することは難しく、PLA遺伝子による葉間期制御機構の理解には、葉原基の形態的変化だけでなく発生過程におけるオーキシン動態などを組み込んだモデルを設定する必要があると考えられた。イネの葉の発生過程で特徴的な発現を示す遺伝子から、葉身の一部の葉肉細胞のみで発現する遺伝子を抽出し、機能破壊系統をCRISPR/Cas9によって作出した。この変異体では、気孔の直下に形成される気孔腔（気孔と葉肉細胞層の間に生じる空隙）が小さくなる表現型が見られた。野生型と変異体における気孔腔の発生過程を観察したところ、両者とも気孔が分化する表皮層と葉肉細胞の間に細胞間隙が生じるものの、野生型では一部の葉肉細胞のみが大きく変形することで気孔腔が生じるものと考えられた。従って、この遺伝子は気孔直下の葉肉細胞の特徴的な細胞伸長の制御に関与している遺伝子であると考えられた。
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