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2023 年度 実績報告書

生殖細胞の進化的競合がもたらす発生・遺伝の自律効果の検証

公募研究

研究領域競合的コミュニケーションから迫る多細胞生命システムの自律性
研究課題/領域番号 22H05639
研究機関基礎生物学研究所

研究代表者

池田 達郎  基礎生物学研究所, 生殖細胞研究部門, 特任助教 (60803963)

研究期間 (年度) 2022-06-16 – 2024-03-31
キーワードマウス / 始原生殖細胞 / バーコード / クローン動態 / 遺伝子発現 / 数理モデリング
研究実績の概要

2023年度はまず2022年度末に作成した、誘導直後(E6.5)にバーコード標識したのち精巣に移動した始原生殖細胞(PGCs)のシングルセルRNA・バーコード-seqライブラリをシーケンスしてデータ解析を行なった。その結果、PGCsにおける不均一な遺伝子発現を見出し、その一部はPGCsの発生の進行度合いを反映していることが分かった。このデータにバーコード情報を重ねると、同じバーコードのPGCクローンでは上記の遺伝子群の発現が近似していた。これは、何らかの共有因子がクローンの遺伝子状態を規定することを示唆している。見出した遺伝子群のうちクローンの挙動に影響すると予想された遺伝子のタンパク質に対する抗体を購入し、その発生過程における発現分布・変動の観察を始めた。
これまで、PGCsの遊走期にクローンの種類数の減少と不均一な拡大が起こることを見出していた。実際にどのような作用がこのクローン分布変化を駆動しうるのかを調べるため、少数の仮定を基に複数の数理モデルを設計した。その結果、一部のPGCsが生存しながらも将来の精巣に寄与しないことを仮定したモデルで初めて、観察されたクローン分布の変化を再現できた。この仮定の蓋然性を検証するため、CAG-CAT-EGFPマウスを用いてE6.5でPGCsをEGFP標識し、E7.5およびE8.5の胚内におけるEGFP陽性細胞の分布を解析した。その結果、E7.5ではエピブラスト後端に存在していたEGFP+細胞のうち、E8.5で約半数は前側の原腸に移動しているのに対し、残りは胚後方の尿膜周辺に移動して胚体外中胚葉への寄与が見られた。このようなPGCsの運命転換がクローンの分布変化を駆動することが示唆された。
以上の結果を含む発生期から次世代に至るまでの生殖細胞クローン動態に関して、2023年度は国内外の学会等で複数の発表を行い、論文執筆も大きく進展させた。

現在までの達成度 (段落)

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

  • 研究成果

    (7件)

すべて 2024 2023 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 学会発表 (5件) (うち国際学会 2件、 招待講演 1件) 備考 (1件)

  • [国際共同研究] ドイツ癌研究センター(DKFZ)/ハイデルベルク大学(ドイツ)

    • 国名
      ドイツ
    • 外国機関名
      ドイツ癌研究センター(DKFZ)/ハイデルベルク大学
  • [学会発表] バーコード分布の数理モデリングによる始原生殖細胞のクローン動態推定2024

    • 著者名/発表者名
      池田 達郎
    • 学会等名
      第11回細胞競合コロキウム
  • [学会発表] Clonal selection and diversity preservation in the male germline2023

    • 著者名/発表者名
      Tatsuro Ikeda
    • 学会等名
      87th Cold Spring Harbor Laboratory Symposium on Quantitative Biology "Stem Cells"
    • 国際学会
  • [学会発表] 雄マウスの生殖細胞系列におけるクローンの選択と集団自律性2023

    • 著者名/発表者名
      池田 達郎
    • 学会等名
      第75回日本細胞生物学会大会
    • 招待講演
  • [学会発表] Territory distribution of primordial germ cell clones in the mouse testis2023

    • 著者名/発表者名
      Tatsuro Ikeda
    • 学会等名
      The 56th Annual Meeting of the Japanese Society of Developmental Biologists
  • [学会発表] Clonal selection and diversity preservation in the male germline2023

    • 著者名/発表者名
      Tatsuro Ikeda
    • 学会等名
      2023 Oz Single Cell Conference "Clonal Biology"
    • 国際学会
  • [備考] 基礎生物学研究所 吉田研究室

    • URL

      http://www.nibb.ac.jp/germcell/index.html

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公開日: 2024-12-25  

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