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2011 年度 実績報告書

放線菌プラスミド上の特異二次代謝生合成系の解析および人為制御による有用分子生産

公募研究

研究領域生合成マシナリー:生物活性物質構造多様性創出システムの解明と制御
研究課題/領域番号 23108515
研究機関広島大学

研究代表者

荒川 賢治  広島大学, 大学院・先端物質科学研究科, 准教授 (80346527)

キーワード放線菌 / ポリケチド / チオエステラーゼ / 生合成 / 抗生物質 / ブテノライド / シグナル分子
研究概要

放線菌Streptomyces rochei7434AN4株は2つのポリケチド抗生物質ランカサイジン(LC)・ランカマイシン(LM)を生産する。また微生物ホルモンSRBを鍵物質としたLC・LM生産制御カスケードの存在も示唆された。本年度は(1)LM生合成におけるタイプ2型チオエステラーゼ遺伝子lkmEの機能解析,(2)SRBの単離・構造決定,に焦点を絞り研究を実施した。
(1)lkmE遺伝子破壊株を構築して代謝産物を調べたところ、親株と比較してLMの生産量は70%減少しており、さらに新規化合物の生成が認められた。新規化合物の化学構造をNMR,MSなどの分光機器で精密解析したところ、いずれも15-norランカマイシン誘導体であることが分かった。[3-^2H]3-methyl-2-oxobutyrateの取り込み実験を行い、15-norランカマイシン誘導体のスターター起源はバリンであることが明らかになった。さらに13位分岐側鎖の1-カルボキシエチル基の立体化学も、キラル重水素標識イソ酪酸の取り込み実験により明らかに出来た。以上によりLkmEは、LM生合成において誤って導入されたスターターユニットを加水分解して除去する役割をもつことが示唆された。
(2)SRBの単離・構造決定を行うため、200リットルスケールで培養し、各種クロマトグラフィーで精製した。高分解能質量分析により2つの活性成分の存在が示唆された。それらの構造をNMRで解析したところ、いずれもγ-butenolide骨格を有する新規シグナル分子であった。今まで知られている放線菌微生物ホルモンはγ-butyrolactone骨格であり、本成果によりシグナル分子の構造多様性を見出すことが出来た。さらに単離した化合物SRB1,SRB2を化学合成し、その構造を確認するとともに抗生物質生産誘導活性を調べた。その結果、天然型は20-50nMという低濃度でもLC,LM生産誘導活性を有しており、アルキル鎖の1'位水酸基の立体化学が生物活性に重要であることを明らかにした。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

1: 当初の計画以上に進展している

理由

9.に記載した項目(1)については学術雑誌に掲載され、ポリケチド生合成初発反応の巧妙な調節機構を明らかに出来た。(2)については、近年新規骨格のシグナル分子が他のStreptomyces属放線菌からも報告されており、放線菌二次代謝産物の人為制御による有用分子生産へと展開するに当たり、有用な知見であると考えている。

今後の研究の推進方策

来年度は本公募研究の最終年度に当たるため、今まで解析してきたP450水酸化酵素や糖転移酵素、PQQ要求性デヒドロゲナーゼの基質特異性に着目し、二次代謝酵素による新規骨格分子の構築を目指す。また、本年度構造決定を完了したシグナル分子SRBの生合成起源について興味が持たれたので、取り込み実験や遺伝子破壊実験を駆使してさらなる解析を進めていく所存である。

  • 研究成果

    (13件)

すべて 2012 2011 その他

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件) 学会発表 (9件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Isolation of borrelidin as a phytotoxic compound from a potato pathogenic Streptomyces strain2012

    • 著者名/発表者名
      曹 志生
    • 雑誌名

      Biosci. Biotechnol. Biochem.

      巻: 76 ページ: 353-357

    • DOI

      10.1271/bbb.110799

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Isolation, structural elucidation, and biosynthesis of 15-norlankamycin derivatives produced by a type-II thioesterase disruptant of Streptomyces rochei2011

    • 著者名/発表者名
      荒川賢治
    • 雑誌名

      Tetrahedron

      巻: 67 ページ: 5199-5205

    • DOI

      doi:10.1016/j.tet.2011.05.047

    • 査読あり
  • [雑誌論文] pSLA2-M of Streptomyces rochei is a composite linear plasmid characterized by self-defense genes and homology with pSLA2-L2011

    • 著者名/発表者名
      楊英杰
    • 雑誌名

      Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry

      巻: 75 ページ: 1147-1153

    • DOI

      doi:10.1271/bbb.110054

    • 査読あり
  • [学会発表] Streptomyces rochei 7434AN4株の線状染色体の塩基配列解析2012

    • 著者名/発表者名
      曹志生
    • 学会等名
      日本農芸化学会2012年度大会
    • 発表場所
      京都女子大(京都市)
    • 年月日
      2012-03-24
  • [学会発表] Streptomyces rocheiのPQQ生合成遺伝子破壊株の代謝産物解析2012

    • 著者名/発表者名
      荒川賢治
    • 学会等名
      日本農芸化学会2012年度大会
    • 発表場所
      京都女子大(京都市)
    • 年月日
      2012-03-23
  • [学会発表] 放線菌Streptomyces rocheiのPQQ遺伝子破壊株における代謝産物解析2011

    • 著者名/発表者名
      荒川賢治
    • 学会等名
      第7回生合成勉強会
    • 発表場所
      東京工業大学(東京都目黒区)(招待講演)
    • 年月日
      2011-12-26
  • [学会発表] Isolation, structural elucidation, and biological activity of the novel γ-butenolide signaling molecules SRBs that elicit antibiotic production in Streptomyces rochei 7434AN42011

    • 著者名/発表者名
      荒川賢治
    • 学会等名
      The 16^<th> International Symposium on the Biology of Actinomycetes
    • 発表場所
      メキシコ合衆国プエルトバジャルタ
    • 年月日
      2011-12-12
  • [学会発表] 14員環マクロライド抗生物質ランカマイシンの生合成経路2011

    • 著者名/発表者名
      荒川賢治
    • 学会等名
      第48回天然有機化合物討論会
    • 発表場所
      大阪国際交流センター(大阪市)
    • 年月日
      2011-09-27
  • [学会発表] Isolation and structural elucidation of the novel γ-butenolide signaling molecules SRBs that switch on antibiotic production in Streptomyces rochei 7434AN42011

    • 著者名/発表者名
      荒川賢治
    • 学会等名
      International Union of Microbiological Societies 2011 Congress
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター(札幌市)
    • 年月日
      2011-09-08
  • [学会発表] Analysis of the terminal sequence, deletion, and circularization of the linear chromosome of Streptomyces rochei2011

    • 著者名/発表者名
      曹志生
    • 学会等名
      International Union of Microbiological Societies 2011 Congress
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター(札幌市)
    • 年月日
      2011-09-08
  • [学会発表] The role of two repressor genes, srrB and srrC, for the production of secondary metabolites in Streptomyces rochei2011

    • 著者名/発表者名
      津田直人
    • 学会等名
      International Union of Microbiological Societies 2011 Congress
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター(札幌市)
    • 年月日
      2011-09-08
  • [学会発表] 抗生物質生産を誘導するシグナル分子の単離・構造決定およびその生合成2011

    • 著者名/発表者名
      荒川賢治
    • 学会等名
      第6回生合成勉強会
    • 発表場所
      理化学研究所(埼玉県和光市)(招待講演)
    • 年月日
      2011-07-02
  • [備考] 研究室のホームページ

    • URL

      http://home.hiroshima-u.ac.jp/mbiotech/5lab/index.html

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公開日: 2013-06-26  

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