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2011 年度 実績報告書

らせんねじれ角およびHOMOギャップ改変によるDNA分子ワイヤーの構築

公募研究

研究領域高次π空間の創発と機能開発
研究課題/領域番号 23108711
研究機関大阪大学

研究代表者

川井 清彦  大阪大学, 産業科学研究所, 准教授 (50314422)

キーワードDNA / 分子ワイヤー / 光電荷分離 / 光電子移動
研究概要

正電荷(ホール)移動のさらなる高速化を達成することによる、DNA分子ワイヤー構築を目指し、当該年度はG-C、A-T塩基対間のHOMOレベルギャップだけでなく、グアニン(G)、アデニン(A)の各塩基のHOMOに着目し、各塩基のHOMOレベルギャップを縮小したDNAを構築し、過渡吸収測定を用いてホール移動速度を評価した。具体的には、アデニンの誘導体として、アデニン、8-ブロモアデニン、アミノプリン、ジアミノプリンを選び、またグアニンの誘導体として、グアニン、イノシン、8-ブロモグアニンを用いた。アデニン誘導体、グアニン誘導体について、種々の組み合わせを有するDNAを合成した。DFT計算により、これらDNAにおいて、HOMOレベルギャップが0-0.78eV変化することがわかった。ホール移動速度を測定するため、DNAの片方の末端に光照射によりDNA中にホールを注入可能なナフタルイミド(NI)を結合し、またDNAのもう片方の末端にはホールのアクセプターとしてフェノチアジン(PTZ)を修飾した。NIを355nmナノ秒YAGレーザーを用いて励起し、ホールがDNA内を移動しもう片方の末端に達する過程を、PTZラジカルカチオンの生成速度より評価した。ホール移動速度は、核酸塩基間のHOMOレベルギャップが小さいほど速く、0-0.78eVの変化により、電荷移動速度が1,500倍変化することを見出した。また、ホール移動速度がホールキャリアーとなる核酸塩基のHOMOレベルに依存するのではなく、HOMOレベルギャップの縮小がホール移動速度の高速化につながることを明らかにした。これにより、優れたDNA分子ワイヤーを作るための指針が得られ、また、DNAを用いることにより種々の導電性(抵抗)を有する分子ワイヤーの構築が可能であることを見出した。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

ほぼ計画通りに研究が進展し、研究計画にそのまま沿った研究成果を化学のトップジャーナルであるJournal of the American Chemical Societyに報告することが出来た。今回は天然の核酸塩基グアニン、アデニンの改変を行なったが、理想的には残りの2塩基、チミン、シトシンの誘導体についても成功を収めたかったものの、申請書に書いた核酸塩基が酸化分解してしまい分子ワイヤーとして機能しなかったのが残念であった。

今後の研究の推進方策

平成24年度の研究計画に従い、DNAの糖-リン酸バックボーンを有機化学的に改変したLocked Nucleic Acids(LNA)を用いて、らせんねじれ角を減少することにより、塩基対がより効率よくπスタックしたDNAを構築し、DNA内ホール移動のさらなる高速化を目指す。23年度の研究により、ホール移動がDNAの局所的ゆらぎに大きく影響を受けることを示唆する結果が得られたため、LNAがDNAの構造を剛直することを鑑みて、グアニンとの間の水素結合数が3から2へと変更しDNAをより柔軟にするシトシンの誘導体、5-メチルデオキシゼブラリンを修飾したDNAついても検討する。

  • 研究成果

    (17件)

すべて 2012 2011

すべて 雑誌論文 (5件) (うち査読あり 5件) 学会発表 (11件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] HOMO Energy Gap Dependence of Hole-Transfer Kinetics in DNA2012

    • 著者名/発表者名
      K.Kawai, M.Hayashi, T.Majima
    • 雑誌名

      J.Am.Chem.Soc.

      巻: Vol.134 ページ: 4806-4811

    • DOI

      10.1021/ja2109213

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Excess-Electron Injection and Transfer in Terthiophene-Modified DNA : Terthiophene as a Photosensitizing Electron Donor for Thymine, Cytosine, and Adenine2012

    • 著者名/発表者名
      M.J.Park, M.Fujitsuka, K.Kawai, T.Majima
    • 雑誌名

      Chem.Eur.J

      巻: Vol.18 ページ: 2056-2062

    • DOI

      10.1002/chem.201103663

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Generation of Singlet Oxygen during Photosensitized One-Electron Oxidation of DNA2012

    • 著者名/発表者名
      Y.Osakada, K.Kawai, T.Tachikawa, M.Fujitsuka, K.Tainaka, S.Tero-Kubota, T.Majima
    • 雑誌名

      Chem.Eur.J

      巻: Vol.18 ページ: 1060-1063

    • DOI

      10.1002/chem.201101964

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Probing the charge-transfer dynamics in DNA at the single-molecule level2011

    • 著者名/発表者名
      K.Kawai, E.Matsutani, A.Maruyama, T.Majima
    • 雑誌名

      J.Am.Chem.Soc.

      巻: Vol 133 ページ: 15568-15577

    • DOI

      10.1021/ja206325m

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Direct measurement of the dynamics of excess electron transfer through consecutive thymine sequence in DNA2011

    • 著者名/発表者名
      M.J.Park, M.Fujitsuka, K.Kawai, T.Majima
    • 雑誌名

      J.Am.Chem.Soc.

      巻: Vol.133 ページ: 15320-15323

    • DOI

      10.1021/ja2068017

    • 査読あり
  • [学会発表] DNA内電荷移動速度のHOMOレベルギャップ依存性2012

    • 著者名/発表者名
      川井清彦、林光雄、真嶋哲朗
    • 学会等名
      日本化学会第91春季年会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2012-03-26
  • [学会発表] HOMOレベル改変によるDNA内電荷移動の高速化2012

    • 著者名/発表者名
      川井清彦、林光雄、真嶋哲朗
    • 学会等名
      高次π空間の創発と機能開発第7回公開シンポジウム
    • 発表場所
      松山
    • 年月日
      2012-03-13
  • [学会発表] DNAが作り出すπ空間を通る電荷の移動2012

    • 著者名/発表者名
      川井清彦
    • 学会等名
      生体π空間のイノベーション
    • 発表場所
      つくば(招待講演)
    • 年月日
      2012-03-06
  • [学会発表] Single-molecule level measurement of charge-transfer dynamics in DNA2011

    • 著者名/発表者名
      Kiyohiko Kawai, Eri Matsutani, Atsushi Maruyama, Tetsuro Majima
    • 学会等名
      高次π空間の創発と機能開発第3回国際シンポジウム
    • 発表場所
      つくば
    • 年月日
      2011-11-18
  • [学会発表] Single-Molecule Level Measurement of Charge-Transfer Dynamics in DNA2011

    • 著者名/発表者名
      Kiyohiko Kawai, Eri Matsutani, Atsushi Maruyama, Tetsuro Majima
    • 学会等名
      第38回国際核酸化学シンポジウム
    • 発表場所
      札幌
    • 年月日
      2011-11-09
  • [学会発表] Single-molecule level measurement of charge-recombination dynamics in DNA2011

    • 著者名/発表者名
      Kiyohiko Kawai, Tetsuro Majima
    • 学会等名
      5th Pacific Symposium on Radical Chemistry
    • 発表場所
      白浜(招待講演)
    • 年月日
      2011-09-27
  • [学会発表] 1分子レベル蛍光観測によるDNA配列情報の読み出し2011

    • 著者名/発表者名
      川井清彦、松谷恵利、丸山厚、真嶋哲朗
    • 学会等名
      第5回バイオ関連化学シンポジウム
    • 発表場所
      つくば
    • 年月日
      2011-09-14
  • [学会発表] 蛍光分子を光増感剤とするDNA内電荷分離2011

    • 著者名/発表者名
      川井清彦、松谷恵利、真嶋哲朗
    • 学会等名
      光化学討論会2011
    • 発表場所
      宮崎
    • 年月日
      2011-09-08
  • [学会発表] Charge transfer dynamics in DNA at the single-molecule level2011

    • 著者名/発表者名
      Kiyohiko Kawai
    • 学会等名
      2^<nd> Seminar on Nanoparticles and Single Molecules
    • 発表場所
      高松(招待講演)
    • 年月日
      2011-08-09
  • [学会発表] 分子の輝き方の観測に基づくDNA配列情報の読み出し2011

    • 著者名/発表者名
      川井清彦、松谷恵利、丸山厚、真嶋哲朗
    • 学会等名
      第33回日本光医学・光生物学会
    • 発表場所
      吹田
    • 年月日
      2011-07-22
  • [学会発表] らせんねじれ角およびHOMOギャップ改変によるDNA分子ワイヤーの構築2011

    • 著者名/発表者名
      川井清彦、林光雄、真嶋哲朗
    • 学会等名
      高次π空間の創発と機能開発第6回公開シンポジウム
    • 発表場所
      岡崎
    • 年月日
      2011-07-15
  • [図書] Electronic and Magnetic Properties of Chiral Molecules and Supramolecular Architectures for Topics in Current Chemistry2011

    • 著者名/発表者名
      K.Kawai
    • 総ページ数
      129-142
    • 出版者
      Springer-Verlag, Inc.

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公開日: 2013-06-26  

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