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2011 年度 実績報告書

蛍光色素を利用したイオンチャネルの開閉機構の可視化

公募研究

研究領域細胞機能と分子活性の多次元蛍光生体イメージング
研究課題/領域番号 23113519
研究機関独立行政法人理化学研究所

研究代表者

平野 美奈子  独立行政法人理化学研究所, 細胞動態計測研究グループ, 研究員 (80585167)

キーワードイオンチャネル / 蛍光色素 / 全反射顕微鏡
研究概要

本研究では、チャネルの開閉機構を明らかにするため、蛍光色素の特性を利用してイオンチャネルの構造変化を可視化し、チャネル開閉に伴う構造変化と機能変化を同時に計測することを目的としている。本年度は、カリウムチャネルの一つであるKcsAチャネルの細胞内ドメインの構造変化を、1分子、実時間でチャネル活性計測と同時に測定することを目標とした。KcsAチャネルの細胞内ドメインの構造変化は、標識した蛍光色素の蛍光強度の変化で捉えることができることは、以前巨視的な系で確認済みであった。しかしながら、1分子レベルでの確認は行っていなかった。そのため、同時計測を行う前に、まず、1分子レベルでの構造変化を蛍光色素を用いて調べた。蛍光標識したKcsAチャネルをリポソームに組み込み、そのリポソームをアビジン-ビオチン系を介してカバーガラスに固定した。その後、全反射顕微鏡を用いて、1分子レベルで蛍光色素を蛍光の輝点として捉え、KcsAチャネルの活性化条件下と不活性化条件下で、その蛍光強度変化を測定した。その結果、pH4では安定した蛍光強度を示す一方、pH7では明滅を繰り返している輝点が観察された。これより、KcsAは、活性化条件下では安定した構造状態をとっている一方、不活性化条件下では頻繁に構造状態が変化していることが示唆された。しかしながら、そのような傾向を示さない輝点も存在し、正確にデータが取れているとは言い難い。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

4: 遅れている

理由

本年度中にKcsAチャネルの構造変化と機能変化の同時計測を行う予定だったが、その前段階の構造変化のみのデータしか取れておらず、そのデータもまだ正確性に欠けるため。

今後の研究の推進方策

1分子レベルで、KcsAチャネルの構造変化を蛍光強度の変化として正確に捉えることができたとは言い難い。正確に測定できてない原因として、リポソームの固定の仕方が適切ではないことが考えられる。固定の方法の検討を行う一方、蛍光強度ではなくFRET法で構造変化を捉える方法の確立も行う。1分子レベルでの構造状態の情報を得た後、活性変化との同時計測を行う。

  • 研究成果

    (6件)

すべて 2011

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件) 学会発表 (3件)

  • [雑誌論文] Channels Formed by Amphotericin B Covalent Dimers Exhibit Rectification2011

    • 著者名/発表者名
      M.Hirano, Y.Takeuchi, N.Matsumori, M.Murata, T.Ide
    • 雑誌名

      Journal of Membrane Biology

      巻: 240 ページ: 159-164

    • DOI

      10.1007/s00232-011-9354-x

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Direct Manipulation of a Single Potassium Channel Gate with an Atomic Force Microscope Probe2011

    • 著者名/発表者名
      M.Kitta, T.Ide, M.Hirano, H.Tanaka, T.Yanagida, T.Kawai
    • 雑誌名

      Small

      巻: 7 ページ: 2379-2383

    • DOI

      10.1002/smll.201002337

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Role of the KcsA channel cytoplasmic domain in pH-dependentgating2011

    • 著者名/発表者名
      M.Hirano, Y.Onishi, T.Yanagida, T.Ide
    • 雑誌名

      Biophysical Journal

      巻: 101 ページ: 2157-2162

    • DOI

      10.1016/j.bpj.2011.09.024

    • 査読あり
  • [学会発表] Mechanism for opening and closing by the KcsA channel2011

    • 著者名/発表者名
      M.Hirano. Y.Onishi, T.Yanagida, T.Ide
    • 学会等名
      第49回日本生物物理学会
    • 発表場所
      兵庫県立大学(兵庫県)
    • 年月日
      2011-09-18
  • [学会発表] The KcsA channel opening and closing mechanism2011

    • 著者名/発表者名
      Minako Hirano
    • 学会等名
      QBiC Retreat 2011 : How to achieve "Whole Cell Modeling"
    • 発表場所
      ゆにとぴあ篠山(兵庫県)
    • 年月日
      2011-09-10
  • [学会発表] 蛍光色素を利用したイオンチャネルの開閉機構の可視化2011

    • 著者名/発表者名
      平野美奈子
    • 学会等名
      新学術領域研究「細胞機能と分子活性の多次元蛍光生体イメージング」第1回研究代表者会議
    • 発表場所
      北海道大学(北海道)
    • 年月日
      2011-06-30

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公開日: 2013-06-26  

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