• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 課題ページに戻る

2012 年度 実績報告書

無脊椎動物ロドプシンの光活性化機構の解明

公募研究

研究領域細胞シグナリング複合体によるシグナル検知・伝達・応答の構造的基礎
研究課題/領域番号 23121513
研究機関名古屋大学

研究代表者

村上 緑  名古屋大学, 理学(系)研究科(研究院), 助教 (20324387)

研究期間 (年度) 2011-04-01 – 2013-03-31
キーワード光受容 / X線結晶構造解析 / ロドプシン
研究概要

超高速、超高感度の光センサとして独特の進化を遂げた脊椎動物ロドプシンとは対照的に無脊椎動物のロドプシンは一般GPCRと共通の分子特性を多くもつ。ロドプシン活性化の分子機構を調べる目的で、無脊椎動物ロドプシンの代表としてイカロドプシンを研究対象にX線結晶構造解析に取り組んできた。本課題では光反応中間体の構造解析を進め、レチナール光異性化後の最初の熱産物であるルミロドプシンの構造解析を行った。最終年度では、結晶中でのロドプシンの熱的振る舞い、ルミ中間体へのX線照射の影響を顕微分光測定により調べ、立体構造を2.8Aで決定することができた。また、ルミ中間体に続いて230Kへの熱緩和で現れるLM中間体についても熱的振る舞いに関する知見を得る事ができた。全長ロドプシンについては、試料に含まれる脂質の量を界面活性剤の添加量を調整することで結晶化試料を最適化し、天然状態での三次元結晶を再現良く得ることができた。

現在までの達成度 (区分)
理由

25年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

25年度が最終年度であるため、記入しない。

  • 研究成果

    (13件)

すべて 2013 2012 その他

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (11件) (うち招待講演 3件)

  • [雑誌論文] Large deformation of helix F during the photoreaction cycle of pharaonis halorhodopsin in complex with azide2013

    • 著者名/発表者名
      Nakanishi T, Kanada S, Murakami M, Ihara K, Kouyama T
    • 雑誌名

      Biophys J.

      巻: 104 ページ: 377-385

    • DOI

      10.1016/j.bpj.2012.12.018

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystal structure of the O intermediate of the Leu93→Ala mutant of bacteriorhodopsin2012

    • 著者名/発表者名
      Zhang J, Yamazaki Y, Hikake M, Murakami M, Ihara K, Kouyama T
    • 雑誌名

      Proteins

      巻: 80 ページ: 2384-2396

    • DOI

      10.1002/prot.24124

    • 査読あり
  • [学会発表] X線結晶構造から観るイカロドプシンの光反応初期過程2013

    • 著者名/発表者名
      村上緑, 神山勉
    • 学会等名
      日本物理学会第68回年次大会
    • 発表場所
      広島
    • 年月日
      20130326-20130329
  • [学会発表] X-ray crystallography study of cruxrhodopsin from Haloarcula vallismortis2013

    • 著者名/発表者名
      S. K. Chan, T. Kitajima, M. Murakami, K. Ihara, T. Kouyama
    • 学会等名
      日本物理学会第68回年次大会
    • 発表場所
      広島
    • 年月日
      20130326-20130326
  • [学会発表] Crystal structure of the lumi intermediate of squid rhodopsin2012

    • 著者名/発表者名
      M. Murakami and T. Kouyama,
    • 学会等名
      15th International Conference on Retinal Proteins
    • 発表場所
      Ascona
    • 年月日
      20120930-20121005
    • 招待講演
  • [学会発表] Crystal structure of an M state of the azide complex of pharaonis halorhodopsin2012

    • 著者名/発表者名
      T. Kouyama, T. Nakanishi, S. Kanada, M. Murakami, K. Ihara
    • 学会等名
      15th International Conference on Retinal Proteins
    • 発表場所
      Ascona
    • 年月日
      20120930-20121005
    • 招待講演
  • [学会発表] Photo-activation mechanism of squid rhodopsin2012

    • 著者名/発表者名
      村上緑, 神山勉
    • 学会等名
      日本生物物理学会第50回年会
    • 発表場所
      名古屋
    • 年月日
      20120922-20120924
    • 招待講演
  • [学会発表] Large deformation of helix F upon formation of the M intermediate of the azide-bound purple form of pharaonis halorhodopsin2012

    • 著者名/発表者名
      中西太市, 金田創運, 村上緑, 井原邦夫, 神山勉
    • 学会等名
      日本生物物理学会第50回年会
    • 発表場所
      名古屋
    • 年月日
      20120922-20120924
  • [学会発表] Crystal Structure of deltarhodospin from Haloterrigena Thermotolerans2012

    • 著者名/発表者名
      J. Zhang, K. Mizuno, Y. Murata, M. Murakami, K. Ihara and T. Kouyama
    • 学会等名
      IGER International Symposium on Science of Molecular Assembly and Biomolecular Systems 2012
    • 発表場所
      名古屋
    • 年月日
      20120904-20120905
  • [学会発表] Large deformation of helix F upon formation of the M intermediate of the azide-bound purple form of pharaonis halorhodopsin2012

    • 著者名/発表者名
      T. Nakanishi, S. Kanada, M. Murakami, K. Ihara and T. Kouyama
    • 学会等名
      IGER International Symposium on Science of Molecular Assembly and Biomolecular Systems 2012
    • 発表場所
      名古屋
    • 年月日
      20120904-20120905
  • [学会発表] ロドプシンのX線結晶構造解析-結晶学と分光学で探るわたしたちがモノを見るしくみ-

    • 著者名/発表者名
      村上緑
    • 学会等名
      名古屋大学女性研究者サイエンスフォーラム
    • 発表場所
      名古屋
  • [学会発表] ハロロドプシンのハライドイオン輸送サイクルにおける構造変化

    • 著者名/発表者名
      川口春樹, 中西太市, 久保宏樹, 井原邦夫, 村上緑, 神山勉
    • 学会等名
      平成24年度生物物理学会中部支部講演会
    • 発表場所
      名古屋
  • [学会発表] Crystallographic study of cruxrhodopsin-3 from Haloarcula vallismortis

    • 著者名/発表者名
      S. K. Chan, T. Kitajima, M. Murakami, K. Ihara, T. Kouyama
    • 学会等名
      平成24年度生物物理学会中部支部講演会
    • 発表場所
      名古屋

URL: 

公開日: 2015-05-28  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi