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2012 年度 実績報告書

生殖細胞の形成を制御するNanos/Pumilio/mRNA複合体の構造解析

公募研究

研究領域細胞シグナリング複合体によるシグナル検知・伝達・応答の構造的基礎
研究課題/領域番号 23121524
研究機関横浜市立大学

研究代表者

橋本 博  横浜市立大学, 生命ナノシステム科学研究科, 准教授 (40336590)

研究期間 (年度) 2011-04-01 – 2013-03-31
キーワードRNA複合体 / 結晶化 / 構造解析
研究実績の概要

生殖細胞は次世代に遺伝情報を伝え, 種の保存を実現する唯一の細胞であり, 次の世代をつくる全能性を有する. 生殖細胞の前駆細胞である始原生殖細胞の形成と維持にはNanosとPumilioが必要である. NanosとPumilioは, 高等真核生物で保存されたRNA結合タンパク質であり, mRNAの3' 非翻訳領域に結合し, 標的mRNAの翻訳を抑制する. しかし, その制御機構は不明であり, Nanos/Pumilio/mRNA複合体の原子レベルでの立体構造解析が求められている. 本研究は, 生殖細胞の基になる始原生殖細胞の形成と維持に必要なmRNAの翻訳制御因子, NanosとPumilioの構造生物学的研究であり, それらが機能している現場である複合体のX線結晶構造解析を目指す.
前年度にPumilioのC末端ドメイン(PumCTD), NanosのC末端ドメイン(NosCTD)とRNAとの複合体の結晶化に成功したが, 平成24年度は三者複合体のX線結晶構造解析を目指した試料調製を精力的に行った. 10-merと20-merの単鎖RNAを用いて, まずPumCTDとRNAを混合し, その後, NosCTDを添加しゲル濾過を行ったところ, 10-merのRNAでは三者複合体を形成しなかったが, 20-merのRNAを用いた場合に三者複合体としてゲル濾過カラムから溶出することに成功した. また,NosCTDとPumCTDはゲル濾過では相互作用が確認出来なかった. さらに, RNAに対する親和性は, NosCTDよりもPumCTDの方が高いという結果を得ている. これらの結果から, まずPumilioが配列特異的にRNAに結合し, その後NanosがPumilio-RNA複合体に結合し, 三者複合体が形成するモデルを提唱できる.

現在までの達成度 (段落)

24年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

24年度が最終年度であるため、記入しない。

  • 研究成果

    (14件)

すべて 2013 2012

すべて 雑誌論文 (6件) (うち査読あり 6件) 学会発表 (8件) (うち招待講演 1件)

  • [雑誌論文] Crystal structure of aldoxime dehydratase and its catalytic mechanism involved in carbon-nitrogen triple-bond synthesis2013

    • 著者名/発表者名
      Junpei Nomura
    • 雑誌名

      Proc Natl Acad Sci USA

      巻: 110 ページ: 2810-2815

    • DOI

      10.1073/pnas.1200338110

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural basis for the inhibition of xyloglucan-specific endo-β-1,4-glucanase (XEG) by XEG-protein inhibitor2012

    • 著者名/発表者名
      Takuya Yoshizawa
    • 雑誌名

      J Biol Chem

      巻: 287 ページ: 18710-18716

    • DOI

      10.1074/jbc.M112.350520

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystallization and X-ray diffraction analysis of the ternary complex of the C-terminal domain of human REV1 in complex with REV7 bound to a REV3 fragment involved in translesion DNA synthesis2012

    • 著者名/発表者名
      Sotaro Kikuchi
    • 雑誌名

      Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun

      巻: 68 ページ: 962-964

    • DOI

      10.1107/S1744309112032435

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural basis of recruitment of DNA polymerase z by interaction between REV1 and REV72012

    • 著者名/発表者名
      Sotaro Kikuchi
    • 雑誌名

      J Biol Chem

      巻: 287 ページ: 33847-33852

    • DOI

      10.1074/jbc.M112.396838

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Identification of a small molecule PCNA inhibitor that disrupts interactions with PIP-Box proteins and inhibits DNA replication2012

    • 著者名/発表者名
      Chandanamali Punchihewa
    • 雑誌名

      J Biol Chem

      巻: 287 ページ: 14289-14300

    • DOI

      10.1074/jbc.M112.353201

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Mechanistic insights into the activation of rad51-mediated strand exchange from the structure of a recombination activator2012

    • 著者名/発表者名
      Naoyuki Kuwabara
    • 雑誌名

      Structure

      巻: 20 ページ: 440-449

    • DOI

      10.1016/j.str.2012.01.005

    • 査読あり
  • [学会発表] REV1-REV7-REV3三者複合体の結晶構造から明らかになったDNAポリメラーゼζのリクルート機構2013

    • 著者名/発表者名
      菊池 壮太郎
    • 学会等名
      第30回PFシンポジウム
    • 発表場所
      つくば国際会議場, 茨城
    • 年月日
      2013-03-14 – 2013-03-15
  • [学会発表] REV1-REV7-REV3三者複合体の結晶構造から明らかになったDNAポリメラーゼζのリクルート機構の構造基盤2012

    • 著者名/発表者名
      菊池 壮太郎
    • 学会等名
      第35回 日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      福岡国際会議場, 福岡
    • 年月日
      2012-12-11 – 2012-12-14
  • [学会発表] Structural basis of recruitment of DNA polymerase zeta by interaction between REV1 and REV72012

    • 著者名/発表者名
      Sotaro Kikuchi
    • 学会等名
      AsCA 12/CRYSTAL 28
    • 発表場所
      Adelaide Convention Centre, Australia
    • 年月日
      2012-12-02 – 2012-12-06
  • [学会発表] Crystal structures of human PCNA in complex with small molecule inhibitors for cancer therapeutics2012

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Hashimoto
    • 学会等名
      AsCA 12/CRYSTAL 28
    • 発表場所
      Adelaide Convention Centre, Australia
    • 年月日
      2012-12-02 – 2012-12-06
  • [学会発表] Structural basis of recruitment of DNA polymerase ζ by interaction between REV1 and REV72012

    • 著者名/発表者名
      Sotaro Kikuchi
    • 学会等名
      The 8th 3R Symposium
    • 発表場所
      Awaji Yumebutai International Conference Center, Hyogo
    • 年月日
      2012-11-25 – 2012-11-28
  • [学会発表] 損傷乗り越えDNA合成に関わるREV1-REV7-REV3三者複合体の結晶構造解析2012

    • 著者名/発表者名
      菊池 壮太郎
    • 学会等名
      日本結晶学会年会
    • 発表場所
      東北大学 片平キャンパス, 宮城
    • 年月日
      2012-10-25 – 2012-10-26
  • [学会発表] REV1-REV7-REV3相互作用の構造基盤2012

    • 著者名/発表者名
      橋本 博
    • 学会等名
      遺伝研研究集会
    • 発表場所
      国立遺伝学研究所, 静岡
    • 年月日
      2012-10-03 – 2012-10-04
    • 招待講演
  • [学会発表] 抗がん剤併用薬開発に向けた PCNAと阻害剤との複合体構造2012

    • 著者名/発表者名
      菊池 壮太郎
    • 学会等名
      第12回日本蛋白質科学会
    • 発表場所
      名古屋国際会議場, 愛知
    • 年月日
      2012-06-20 – 2012-06-22

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公開日: 2018-02-02  

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