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2011 年度 実績報告書

GPIアンカー型タンパク質の輸送シグナルの提示と検知の構造生物学

公募研究

研究領域細胞シグナリング複合体によるシグナル検知・伝達・応答の構造的基礎
研究課題/領域番号 23121532
研究機関名古屋市立大学

研究代表者

佐藤 匡史  名古屋市立大学, 大学院・薬学研究科, 准教授 (80532100)

キーワード積荷受容体 / GPIアンカー型糖鎖 / N結合型糖鎖 / X線結晶構造解析 / NMR解析 / 構造細胞生物学
研究概要

本研究では、小胞体積荷受容体によるGPIアンカー型およびN結合型糖タンパク質の分子認識および細胞内輸送機構の構造基盤の解明を目的としている。
(1)GPIの構造変化と積荷受容体p24によるGPIアンカー型タンパク質輸送の制御機構の解明
GPI糖鎖のPGAP1による脱アシル化およびPGAP5による脱リン酸化が、GPIアンカー型タンパク質の小胞体からゴルジ体への「輸送シグナル」となり、p24タンパク質がその糖鎖シグナルを特異的に認識することで、積荷受容体として機能することを明らかにした。
(2)GPIアンカー型糖鎖の化学合成法の確立
GPI糖鎖3-5糖ユニット(エタノールアミンリン酸化マンノース3糖-グルコサミン-イノシトール)の化学合成に成功した。現在、収率を向上させるべく、反応条件の検討を行っている。GPIアンカー糖鎖はタンパク質のC末端部分と結合するが、合成基質の非還元末端には、in vitro、in vivoの活性試験において精製と検出を容易にするように疎水性の蛍光分子を導入した誘導体を合成した。
(3)積荷受容体ERGIC-53/MCFD2複合体による血液凝固第V/VIII因子の分子認識機構の解明
積荷受容体(ERGIC-53/MCFD2)とN結合型糖タンパク質(血液凝固第V/VIII因子)のNMR解析による相互作用解析を行った。その結果、ERGIC-53と複合体を形成したMCFD2がEFハンドタンパク質に典型的な様式で血液凝固第VIII因子と相互作用することを見出した。またERGIC-53/MCFD2複合体の新しい3つの結晶系におけるX線結晶構造解析を行い、MCFD2のコンフォメーション多形を捉えることに成功した。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

リガンドの調製は、最長の5糖ユニットからなるGPIアンカー型糖鎖誘導体の化学合成に成功しており、計画通りに進んでいる。現在、収率を向上させるべく、反応条件の検討を行っている。また、p24ファミリータンパク質の小胞体内腔領域および各ドメイン(GOLDドメイン、コイルドコイルドメイン)の発現・精製に成功している。さらに、N型糖タンパク質輸送系では、輸送レクチンと血液凝固因子との相互作用部位をNMR解析により明らかにしている。以上、総合的に判断しておおむね順調に進展している。

今後の研究の推進方策

p24タンパク質の結晶化およびX線回折データ収集・立体構造決定を行う。また、p24タンパク質と合成したGPIアンカー型糖鎖3-5糖ユニット複合体のX線結晶構造解析およびNMR解析を行う。PGAP5に関しては、大腸菌に加えて哺乳動物細胞を用いた発現系も併せて検討を行う。
N型糖タンパク質の分子認識機構についても併せて検討し、小胞体品質管理機構の包括的な理解を目指す。前年度のNMR解析の結果を基に、血液凝固因子の相互作用部位ペプチドとERGIC-53/MCFD2との複合体のX線結晶構造解析を行う。相互作用部位ペプチドは溶解度が非常に低いことが判明したため、融合タンパク質として結晶化を行う予定である。

  • 研究成果

    (22件)

すべて 2012 2011 その他

すべて 雑誌論文 (6件) (うち査読あり 6件) 学会発表 (15件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Molecular and structural basis for N-glycan-dependent determination of glycoprotein fates in cells2012

    • 著者名/発表者名
      Yukiko Kamiya
    • 雑誌名

      Biochimica et Biophysica Acta

      巻: 1820 ページ: 1327-1337

    • DOI

      doi:10.1016/j.bbagen.2011.12.017

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Overproduction of anti-Tn antibody MLS128 single-chain Fv fragment in Escherichia coli cytoplasm using a novel pCold-PDI vector2012

    • 著者名/発表者名
      Subedi GP, Satoh T, Hanashima S, Ikeda A, Nakada H, Sato R, Mizuno M, Yuasa N, Fujita-Yamaguchi Y, Yamaguchi Y
    • 雑誌名

      Protein Expr.Purif.

      巻: 82 ページ: 197-204

    • DOI

      10.1016/j.pep.2011.12.010

    • 査読あり
  • [雑誌論文] 糖鎖を目印とするタンパク質の品質管理の仕組みを解く2012

    • 著者名/発表者名
      佐藤匡史, 山口芳樹
    • 雑誌名

      生物物理

      巻: 52 ページ: 32-33

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Conformational dynamics of wild-type Lys-48-linked diubiquitin in solution2011

    • 著者名/発表者名
      Hirano T, Serve O, Yagi-Utsumi, M, Takemoto E, Hiromoto T, Satoh T, Mizushima T, Kato
    • 雑誌名

      J.Biol.Chem.

      巻: 286 ページ: 37496-37502

    • DOI

      10.1074/jbc.M111.256354

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural insights into recognition of triple-helical β-glucan by insectfugal receptor2011

    • 著者名/発表者名
      Kanagawa M, Satoh T, Ikeda A, Adachi Y, Ohno N, Yamaguchi Y
    • 雑誌名

      J.Biol.Chem.

      巻: 286 ページ: 29158-29165

    • DOI

      10.1074/jbc.M111.256701

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Sorting of GPI-anchored proteins into ER exit sites by p24 proteins is dependent on remodeled GPI2011

    • 著者名/発表者名
      Fujita M, Watanabe R, Jaensch N, Romanova-Michaelides M, Satoh T, Kato M, Riezman H, Yamaguchi Y, Maeda Y, Kinoshita T
    • 雑誌名

      J.Cell Biol.

      巻: 194 ページ: 61-75

    • DOI

      10.1083/jcb.201012074

    • 査読あり
  • [学会発表] プロテアソームの19S複合体基底部の形成を介助するシャペロン分子Nas2の構造生物学研究2012

    • 著者名/発表者名
      廣本武史, 矢木真穂, 植草義徳, 雲井健太郎, 佐藤匡史, 水島恒裕, 佐伯泰, 田中啓二, 加藤晃一
    • 学会等名
      日本薬学会第132年会
    • 発表場所
      札幌(口頭発表)
    • 年月日
      2012-03-30
  • [学会発表] 新規プロテアソーム活性化因子PbaBの構造生物学研究2012

    • 著者名/発表者名
      佐藤匡史, 雲井健太郎, 矢木宏和, 廣本武史, 水島恒裕, 内山進, 野田勝紀, 村田和義, 神谷由紀子, 加藤晃一
    • 学会等名
      日本薬学会第132年会
    • 発表場所
      札幌(口頭発表)
    • 年月日
      2012-03-30
  • [学会発表] NMR analysis of an anti-carbohydrate antibody MLS128 single-chain Fv fragment toward elucidation of the multivalent recognition mechanism2011

    • 著者名/発表者名
      Ganesh Prasad Subedi, Tadashi Satoh, Shinya Hanashima, Akemi Ikeda, Hiroshi Nakada, Reiko Sato, Mamoru Mizuno, Noriyuki Yuasa, Yoko Fujita-Yamaguchi, Yoshiki Yamaguchi
    • 学会等名
      ISNMR2011第50回NMR討論会記念国際シンポジウム
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      20111116-20111118
  • [学会発表] 細胞内レクチンによる糖タンパク質品質管理の構造基盤2011

    • 著者名/発表者名
      佐藤匡史
    • 学会等名
      Glyco Tokyo 2011シンポジウム
    • 発表場所
      埼玉(招待講演)
    • 年月日
      2011-12-09
  • [学会発表] 糖鎖認識を介した糖タンパク質の輸送と分解の構造基盤2011

    • 著者名/発表者名
      佐藤匡史
    • 学会等名
      平成23年度日本結晶学会年会
    • 発表場所
      札幌(招待講演)
    • 年月日
      2011-11-25
  • [学会発表] NMR analysis of an anti-carbohydrate antibody MLS128 single-chain Fv fragment toward elucidation of the multivalent recognition mechanism2011

    • 著者名/発表者名
      Ganesh Prasad Subedi, Tadashi Satoh, Shinya Hanashima, Akemi Ikeda, Hiroshi Nakada, Reiko Sato, Mamoru Mizuno, Noriyuki Yuasa, Yoko Fujita-Yamaguchi, Yoshiki Yamaguchi
    • 学会等名
      2011 Annual Conference of the Society for Glycobiology
    • 発表場所
      シアトル
    • 年月日
      2011-11-10
  • [学会発表] Structural basis of sugar recognition by intracellular lectins involved in glycoprotein transport and degradation2011

    • 著者名/発表者名
      Tadashi Satoh
    • 学会等名
      Nagoya University Global COE Mini-Symposium : Toward Systems Glycobiology
    • 発表場所
      名古屋(招待講演)
    • 年月日
      2011-11-07
  • [学会発表] レクチンとカルシウム結合タンパク質の協働的相互作用による血液凝固因子の細胞内輸送の構造基盤2011

    • 著者名/発表者名
      西尾美穂, 神谷由紀子, 佐藤匡史, 内海真穂, 加藤晃一
    • 学会等名
      糖鎖科学名古屋拠点"第9回若手の力フォーラム"
    • 発表場所
      岐阜
    • 年月日
      2011-10-22
  • [学会発表] A novel binding mode of beta-GRP/GNBP3 N-terminal domain with laminarihexaose-structural insight into recognition of triple-helical beta-glucan2011

    • 著者名/発表者名
      Mayumi Kanagawa, Tadashi Satoh, Akemi Ikeda, Yoshiyuki Adachi, Naohito Ohno, Yoshiki Yamaguchi
    • 学会等名
      第71回岡崎コンファレンス「糖鎖分子科学の新たな展望」
    • 発表場所
      岡崎
    • 年月日
      2011-10-13
  • [学会発表] ヒトZG16pレクチンのリガンド認識の多様性の構造基盤2011

    • 著者名/発表者名
      金川真由美, 池田明美, 佐藤匡史, 中野佑妃子, 相川京子, 山口芳樹
    • 学会等名
      第84回日本生化学会大会
    • 発表場所
      京都
    • 年月日
      2011-09-23
  • [学会発表] p24ファミリータンパク質は、リモデリングされたGPIアンカーに結合し、輸送小胞へ組込む積荷受容体である2011

    • 著者名/発表者名
      藤田盛久, 佐藤匡史, 加藤雅樹, 山口芳樹, 前田裕輔, 木下タロウ
    • 学会等名
      第84回日本生化学会大会
    • 発表場所
      京都
    • 年月日
      2011-09-22
  • [学会発表] ヒトZG16pとZG16bはJacalinと同様のβ-プリズムフォールドを有する2011

    • 著者名/発表者名
      金川真由美, 佐藤匡史, 池田明美, 中野佑妃子, 矢木宏和, 加藤晃一, 相川京子, 山口芳樹
    • 学会等名
      第30回日本糖質学会年会
    • 発表場所
      長岡
    • 年月日
      2011-07-12
  • [学会発表] GPIの構造変化と積荷受容体p24によるGPIアンカー型タンパク質輸送の制御2011

    • 著者名/発表者名
      藤田盛久, 佐藤匡史, 加藤雅樹, 山口芳樹, 前田裕輔, 木下タロウ
    • 学会等名
      第30回日本糖質学会年会
    • 発表場所
      長岡
    • 年月日
      2011-07-11
  • [学会発表] NMR法を用いた分子シャペロンUmp1とプロテアソームサブユニット複合体との相互作用解析2011

    • 著者名/発表者名
      大川慶祐, 矢木真穂, 廣本武史, 矢木宏和, 水島恒裕, 佐藤匡史, 加藤晃一
    • 学会等名
      第57回日本薬学会東海支部総会大会
    • 発表場所
      名古屋(口頭発表)
    • 年月日
      2011-07-09
  • [学会発表] GPIアンカー型タンパク質の輸送シグナルの提示と検知の構造生物学2011

    • 著者名/発表者名
      佐藤匡史
    • 学会等名
      新学術領域研究「構造細胞生物学」第2回全体会議
    • 発表場所
      奈良
    • 年月日
      2011-07-07
  • [備考] ・理化学研究所プレスリリース,2011年6月24日,「真菌類などが持つ3重らせん型βグルカンを認識する仕組みを解明-生体防御システムにおける3重らせん構造認識の秘密が明らかに-」

    • URL

      http://www.riken.jp/r-world/research/results/2011/110624/index.html

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公開日: 2013-06-26  

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